4 genomes BUD1944 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - pNG7193 HVO_A0596 Hbo3673 Hmu1839 - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	1537	HVO_A0596	Hbo3673	pNG7193	Hmu1839
1074	HVO_A0596	1616	875	463	511
983	Hbo3673	875	1490	469	513
746	pNG7193	463	469	1576	637
844	Hmu1839	511	513	637	1544

234 symbols
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HVO_A0596       VGEEGTM:T::L:AD::V:DQ:::::L:ETTG:SH:::A::QQP:IE:::::::IV::::
Hbo3673         :::::::LETL::S::Q:AS-----------:TP::D:VE:HE:::VQEL:T::T:::L:
pNG7193         ::::::G:K:TA::KAEPN:ELSD:SVP:SK::N:SS:::A::::Q:GHGA:L:V:::::
Hmu1839         :::MSATR:E:::::GGS:G::NETT:S:::E:::VT::EP::-----:::PV::V::L:

consensus       KNQRRRDALRYLKENDGE-AKLGDLAEHIAAIENDIEIAALSSSQRKRVYIGLYQCHLPK
#oth            ..1...11111.212.21111.111..21..1..21123111..1.....1.........
HVO_A0596       ::::::::::::::::::::::::M::F:::K::G:::K:::::::::::::::::::::
Hbo3673         ::::::::I:::::::::::::::M::Y:::K:::::::Q::::::::::::::::::::
pNG7193         ::S:::EV:HF:R:R:EQ:VS::E::::V:::::ETTTD::T::E:::::V:::::::::
Hmu1839         ::::::EV::::EAA:D:TVS:S::::::::::::TTVQ:I:::E:::::V:::::::::

consensus       MDDAGVIDFEQNRGDITLGDNADQLEQYL-GDIGSTDAENRQ--S---SPRRNAAVAAGV
#oth            .1231111.211..2.1.333.211131.1112322312122221111121111121221
HVO_A0596       ::S::IV:::K:::::::L:T:K::D:::D:::V::::DDE:SA:LAA::K::L:I::::
Hbo3673         :ANS::::::K:::::::KQM:E:::P:::::--::P:Q:DAGS:::::SK::::::GV:
pNG7193         :::I:::::N:D::H:::TEK::DF:K:::-NRSEEE:::::::-:::WY:YY:::SVL-
Hmu1839         :::MN:VA:D::::T:S::P::::::EF::-:::DD--:D:P::-:::W::YY:GL:::-

consensus       ---VGAGLLGAPGAAQVPAAAWAVLSTAVLVAAGACEIYHDR-LDR--------
#oth            222122211122223311223121122321213111231233111122222211
HVO_A0596       AAT:SG::::V::LE:::::G:::::::T:M:VT:M:S:K:::::L::::::::
Hbo3673         GIG:A::::::::F:L::D:::::V::TA::VLT:M:T::QHD:::::::::::
pNG7193         :::-::MV:A:SV:FSLSGTMVFG:FSL:VGV::::SV::WS:VE:EAPDSE::
Hmu1839         :::-:TA:Y:--L:LI:::VSVG:VVPV::::F:C:A:VNEY:V::QTDEQSTV