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4 genomes BUD1946 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0808

HVO_1609

Hbo3238

Hmu2951

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score2213 Hmu2951 rrnAC0808 HVO_1609 Hbo3238
974Hmu2951 2463 589 550 519
1332rrnAC0808 589 2481 865 820
1436HVO_1609 550 865 2095 1065
1432Hbo3238 519 820 1065 2244

361 symbols
consensus       ----MANRRRLLLVAVV-LVALAGCSG-GGAADSG-A----------AGSAGGAQSVEAT
#oth            1111133.2321211212.221...1.22232.2.2111112222223.21222221232
Hmu2951         MPTIHVT::QIA:L:::V:::V:::::AQNT:::::-::::::::::-::DL:M::AGDG
rrnAC0808       ::::::S:I:V:A:VG-::LL::::T:M::SG:A:E:QGGGDGAQMSS:GD:SS:P:::D
HVO_1609        :::::D::LK::S::L-:::V::::T::-::::G::-:::::::::::::::::E::SL:
Hbo3238         :::::KH::T::::V::A:A:::::::::ADD:::R:::::ELHRSDD:A:TA:PT::T:

consensus       SDGASGGAEADQAGDAD----QDRAIIRNGRMRLEVDNFNASARAIAAAAAAYGGYVSDS
#oth            13211.22233122222222222.12112122312.12132233233231332..1.1.2
Hmu2951         :G:S:::GGVGSYY:::::::G::V:V:ES::D:R::::TRAF:STREI:::H::::G:R
rrnAC0808       :KASA:DS:NI:::::A::::A::::::::::VV::E:YS:T:N::::R:RTS:::::::
HVO_1609        A:-:::S:::E:T:GD:LPQA:R::V::::QIE:T::E::E:RD:VEST:ES::::::::
Hbo3238         :S::::::NS:S:ASSKTANV:N::L:KT:TV:V:::D:Q::KSNLT::VQG:::F:::T

consensus       NQERHRRDGETWRTGQIVVRVPSEDFSAARDDAKALGEVEREETNTEDVTDRLVDLEARL
#oth            12232231211132.2211...21212233313222.2.13121222.1..311.2...1
Hmu2951         S:----NSRGD:DE:R:T::::P:N::E::::LAV::H::D:SVSVQ:F::EYN:R:::I
rrnAC0808       :R:L::D:::::Y::Y::::::::EYEPTQSMVSKQ:T:RS:::T:K::::K::::::::
HVO_1609        :EYVN::S:G:Y:S::L:::::::::::FMT:M::::::::V:::S:::::Q:::I::::
Hbo3238         S::::SV:N::YL:::V:L:::AA::D:LVE::::E::::VVK:::::::::::::::::

consensus       ENLRAQRDRLRDLYERANTTEDVLAIEEELSDVQDEIERLEAQKQSLEDRVALSTLRVRL
#oth            21.122112.131122..21.12121222.22.131111.11.12..12.1.3..21132
Hmu2951         :D:QQEERA:ES:LS:::DS:EASE:RND:RE:R::LRT:RQ:QS:::R:E:M::I:IDA
rrnAC0808       T:::ER:::::TF:::::S::EL:R::::::S::SD::::::::R:::Q:::Y:::::EI
HVO_1609        S::::::::::::::S:::::::::V::R:T:::T::::::::::::::::::::V::S:
Hbo3238         ::::::::Q::K::DE:::::::::VQR::::::G::::::::::::Q::::F:::T:::

consensus       HEPAPEP---QPPRWYDTP--VLAAFLESVNGVATAARALVVAAAYAAP----YLVVFAF
#oth            2.1312122221232122111223..321131231231211.331113.11112121222
Hmu2951         :::VS:-::::::EN:RSSFGFDD::M:AFY:GL::VKYV::FFG::I:IGLSL:PLA::
rrnAC0808       :::::::SAQ:V:-YHEQS::LV::::S::TD:YVFT:G:L:T::SL::::::W:::L:V
HVO_1609        S:RP:--:::G:AQ:::::::::Q::S:::::AFV:L::::::V:::V::::::::::GG
Hbo3238         E::R:T:DRVA:D::::::::::S::FQ::D::::V::::::GL:::L::::::FL::V:

consensus       PLVLLGG----RRLLAGRAA----RRRLSPAA-E--GD--------EP----TDE-----
#oth            22221.111112231211332222122222332112112222222211222211111111
Hmu2951         G:::V::FRRT::FVS:AMSADSE:AND:::VV:TS::EAGTTDDG::DGGE::::::::
rrnAC0808       :--VV::::::::::R::SLSVLG::GT:ES:I::D::DGSSDPQQ::TPEP:::SPDDD
HVO_1609        L:AI::S::::GVV::::::::::F:::TD--:-::--::::::::--::::---:::::
Hbo3238         :F:::::::::---::W:F-:::::H::L:HS:-::--::::::::--::::---:::::

consensus       -
#oth            1
Hmu2951         :
rrnAC0808       A
HVO_1609        :
Hbo3238         :