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4 genomes BUD1963 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7268

rrnAC1340

HVO_1993

HVO_B0279

Hbo1603

-

Hut0906

Hut2674

- - -

Pairwise sequence scores
Consensus score1631 HVO_1993 pNG7268 HVO_B0279 Hut2674 Hut0906 rrnAC1340 Hbo1603
1026HVO_1993 1641 840 852 790 903 339 832
1190pNG7268 840 1603 1131 1127 865 444 863
1184HVO_B0279 852 1131 1607 1165 900 440 835
1189Hut2674 790 1127 1165 1600 839 473 881
1143Hut0906 903 865 900 839 1580 455 990
559rrnAC1340 339 444 440 473 455 798 490
1116Hbo1603 832 863 835 881 990 490 1747

226 symbols
consensus       -----------------MDPDDVRRRWADRSGAFSPEYYAQYGPNETSETLAEVIDQYAA
#oth            111111111111111112133222261241214211211143121121132442334336
HVO_1993        :::::::::::::::::V:AN::::K::::::E:::::::Y::::::::AIRR:F:ERLD
pNG7268         ::::::::::::::::::::::::DD::S:::K:::A:::EL::::V::::VN:L:H:VH
HVO_B0279       :::::::::::::::::::A::NH:G::E:::D::::::::I::::V:::::T:FEH:::
Hut2674         ::::::::::::::::::::E:N::S::E:D::Y:::::::I:E::V:::::T::EY::N
Hut0906         :::::::::::::::::V:::T:::E::::::EY::::::H::::::::AIR:TL:::LT
rrnAC1340       :::::::::::::::::-------------------------------------------
Hbo1603         MPRRTTTLYGGRANGRAV:SN::H:::TA::::Y::::::Y::::::::L:K:T:S:H:E

consensus       EDASILELGCGSGRHLAHLLDHGYENLTGIDINDDSFDVMAEEYPELADTGTFHHDAIED
#oth            5213121211221111311554123234122213231211225213132511134211.3
HVO_1993        AS:::::::::P::::S::RE::F:::H:V:::P:C:E:::DA::D::RC::::A::::E
pNG7268         D::R:I:::::::::::::QTS::G:::::::::E:::::::H::R:::S::::TG:L::
HVO_B0279       ::::::::::S::::::::H:R:::DI::::::::::E::::YF:::V:::::LTG::::
Hut2674         :::::::I::::::::D:::GV::KD:A::::::E::E:::::::R:::::::LSG::::
Hut0906         S:::::::::S:::::::::K::::DV:::EV:::A::::::T:::::RQ:::Y::T::A
rrnAC1340       -------------------------------------------------------M:::E
Hbo1603         P::A::::::S::::::::F::::::VS:VE::AEA::::D::::::S:A:::Y:::::S

consensus       IVEDFADDAFDVVYSVETLQHVHPDDAWVFEELARITDDLLITVENEGNRPGRG---RDD
#oth            4232131131.1111......2..134.1.1121.233111111...1342532111444
HVO_1993        :::E:SPGQ::A:::::::::::::::::::AV::SAS:YVV::::::D:SVPP:::-E:
pNG7268         ::TE:E:::::::::::::::I::::::::::I:::AG:::VIA:::::S:E::::::A:
HVO_B0279       LLP::P::K:::I:::::::::::::T:::::I::VSS::V::A:::::G:T::::::SG
Hut2674         HLPE:P:::Y::::::::::::::::T::::::T:V:::::::A:::::::N:::::P:A
Hut0906         VI:::::GQ::A:FA::::::I::ESV:::D::::V:::::::::::VDGE:--:::SSE
rrnAC1340       F:T:V:::TY:::F:::::::L:::VD:A:::::::V:::::::::::GD::--:::---
Hbo1603         V:RK:E:::::::::::::::L:::AE:::D::::::ET:::::::::EHSDA:GTAD:E

consensus       PEVNYVDDDFPLYHRDWNAVFSDLGLAQLDCEPGDRDTRRVFRVP-
#oth            53.2213322...1.1.222.234.1312443524..13.3.2334
HVO_1993        RG::DEEY:::::Y:::A:::DPF:FE:VA::H::::::::::RVD
pNG7268         TD:S:::::::::::N:KQ:::E::F:::IR::TS:::I::::A::
HVO_B0279       S::S::N::::::::N:KDE::EF:::::L::::K:::V:::::L:
Hut2674         VD:SH::::::::::::K:::::::::::LV:RTN:::I::::A::
Hut0906         :::T::SE:I::::::::QI:TGR::VEV:AVA:E:::::T:::DG
rrnAC1340       -:::::::NV:::Y:::::::T:C::TEV:SID:K:::V:I:Q::E
Hbo1603         :S:::::GEV:::Y:::::::T:V::TEIESKSM:::MF:S:-T:T