4 genomes BUD2013 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG0399 - HVO_0877 Hbo0663 - - hla2362 - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	1057	VNG0399	hla2362	HVO_0877	Hbo0663
501	VNG0399	1164	226	295	321
552	hla2362	226	1319	341	321
701	HVO_0877	295	341	1013	497
709	Hbo0663	321	321	497	1132

198 symbols
consensus       -----R----A----MVAVLLVSAT-------GGPAAAQSGSQSAADGD-----------
#oth            111121222212222221221122111111111121.22212322321211111111111
VNG0399         :::::-::::-:::::AI:V::AF::::::::::G::Q:A::GPKV::::::::::::::
hla2362         MTCRS:TGLV:LTTLS::L::::::VVSGAFV::A::TP:::SA::::ALGDGSDATDDR
HVO_0877        :::::-::::-:::::L::I:TV:::::::::-A:V::AT:PT:P----:::::::::::
Hbo0663         ::::M:RFSR:VAVAV::I:I::GV:::::::-::V::::DA:::SN:::::::::::::

consensus       -----RCFPGEGHRFDIGGNGAAIAALVHLSLLTNLGGAGALGIEAAGSALNDRIIQLRA
#oth            11112111222.13221.23113.333211121111112131.31.3.122233113132
VNG0399         :::::-----G:Y:::V::DSPH:TFWL::D:::::::::D::FS:V:T::DT:V:VIDL
hla2362         VDPPT:::A:::YPIS::DG::::E::::::V::DPTAGNEF:L::::TLDGEP:VT:G:
HVO_0877        :::::-:::::::Q:::::E::D:DLV:F::MFE::::E:GF:M::G::VG::S:V::::
Hbo0663         ::::R::::PD::ELG::T::PG::VTI:T::F:::::::::::::R:::::ST::G:QT

consensus       GVAFDGVGPAAAFLSDPFSRFSVLYDYELNLPMFS-GSADDSEYEDDGSPVD--------
#oth            1131112122231111..11.212121122..1121123312212211112321111111
VNG0399         QLQ:::I::LEE:::::::::::SAEW:::::FL:A:P:S:T:FSYE:NETIANNTSLEN
hla2362         ::RLTAREAI:NGV-:::AA:D:::A:::R::::D:::IG::::R:E:::I:S:::::::
HVO_0877        :::::::::::::::::::::::V:::SM:::::A:V:GIE:S::::::::G::::::::
Hbo0663         ::V:::::S:DS:::N:::::GI::::SFQ:::::::MV::PG::S:E:::K::::::::

consensus       ---GADARSC--------
#oth            111.31232111111111
VNG0399         ATI:T:TLGNVTRNATQS
hla2362         :::::G:VP:::::::::
HVO_0877        ::::L::K::::::::::
Hbo0663         ::::V:S:::::::::::