|
Pairwise sequence scores | |||||
---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1091 | HVO_1638 | Hbo3206 | hla2530 | rrnAC2313 |
693 | HVO_1638 | 1158 | 547 | 214 | 254 |
647 | Hbo3206 | 547 | 1051 | 269 | 253 |
487 | hla2530 | 214 | 269 | 1048 | 243 |
512 | rrnAC2313 | 254 | 253 | 243 | 1083 |
161 symbols consensus MAQTGLLSGALLGVLLVAAVVALA-GRGWRRYSP-------GGGSSGRADASDRERGADS #oth .2223.223111.2212.321323111.12311111111111212221333132122332 HVO_1638 ::::::FL:FV:::A:L:LT:F:T::::::Q::VTSVPTPT::::::N:GE:E::::SG: Hbo3206 :::ES::VSFV:::S:I::::V:I::::::N::V:::::::A::WTT:ESG:VLT::::: hla2530 :VSLT:::T::M:L:V::TF::V::QI:AK:TA:::::::::A::AS:Y::--ITETLSD rrnAC2313 :SN:Y:A:M::M:A:V::V:TWMVR::::YH:::::::::::SST:::SPT::::SRFET consensus GARQPMV-WAAAFAVLALGFGAVAVLFVGGAEEPEGIAGAAGAVLVAGTGLILCGYLFYG #oth 32331221.23113122112122211212133311131232221211122231321112. HVO_1638 :SGTAARR::DDPT::S:::::::::::::STI:::VSD:::P::::::LTVVVT::::: Hbo3206 ----::M::T:::L:A::A::TA:::::A:::V:::M:AIG::F:::::T:::IL:V::: hla2530 V::K:V::::V::VAI:V:V:::SL:A::NFGL:::LS:SLLT:VY:VV::L:T:FV:L: rrnAC2313 Y:D::::::VG:::::VV:LLVGV:ASIS:PV:TQS:::L:V::-:G:A:--:::::LF: consensus TYHSARGRGLERAQAAALGAWAAGLLFLIAIALQL-VGLI- #oth 2131112..13112112211211.21.1121222.12.231 HVO_1638 :::A::::::::S:::L::S:VL::::VVGV::R:::::L: Hbo3206 :FV:::S:::KN::::F:::::L:M::VV::::K::L::F: hla2530 A:F:V:::::GN:HGV:A:SF::::V:::L:VA::LI:V:G rrnAC2313 V:L::TR::HP:SL:V:ES:TV::V:::::VGF:::::A-: