Home |  Text search
4 genomes BUD2023 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2313

HVO_1638

Hbo3206

- -

hla2530

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score1091 HVO_1638 Hbo3206 hla2530 rrnAC2313
693HVO_1638 1158 547 214 254
647Hbo3206 547 1051 269 253
487hla2530 214 269 1048 243
512rrnAC2313 254 253 243 1083

161 symbols
consensus       MAQTGLLSGALLGVLLVAAVVALA-GRGWRRYSP-------GGGSSGRADASDRERGADS
#oth            .2223.223111.2212.321323111.12311111111111212221333132122332
HVO_1638        ::::::FL:FV:::A:L:LT:F:T::::::Q::VTSVPTPT::::::N:GE:E::::SG:
Hbo3206         :::ES::VSFV:::S:I::::V:I::::::N::V:::::::A::WTT:ESG:VLT:::::
hla2530         :VSLT:::T::M:L:V::TF::V::QI:AK:TA:::::::::A::AS:Y::--ITETLSD
rrnAC2313       :SN:Y:A:M::M:A:V::V:TWMVR::::YH:::::::::::SST:::SPT::::SRFET

consensus       GARQPMV-WAAAFAVLALGFGAVAVLFVGGAEEPEGIAGAAGAVLVAGTGLILCGYLFYG
#oth            32331221.23113122112122211212133311131232221211122231321112.
HVO_1638        :SGTAARR::DDPT::S:::::::::::::STI:::VSD:::P::::::LTVVVT:::::
Hbo3206         ----::M::T:::L:A::A::TA:::::A:::V:::M:AIG::F:::::T:::IL:V:::
hla2530         V::K:V::::V::VAI:V:V:::SL:A::NFGL:::LS:SLLT:VY:VV::L:T:FV:L:
rrnAC2313       Y:D::::::VG:::::VV:LLVGV:ASIS:PV:TQS:::L:V::-:G:A:--:::::LF:

consensus       TYHSARGRGLERAQAAALGAWAAGLLFLIAIALQL-VGLI-
#oth            2131112..13112112211211.21.1121222.12.231
HVO_1638        :::A::::::::S:::L::S:VL::::VVGV::R:::::L:
Hbo3206         :FV:::S:::KN::::F:::::L:M::VV::::K::L::F:
hla2530         A:F:V:::::GN:HGV:A:SF::::V:::L:VA::LI:V:G
rrnAC2313       V:L::TR::HP:SL:V:ES:TV::V:::::VGF:::::A-: