| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1840 | Hmu1701 | Hbo1241 | HVO_A0320 | Hmu3318 | HVO_B0135 | hla2222 | Hmu0502 | HVO_1103 | Hbo0608 |
| 672 | Hmu1701 | 2010 | 350 | 354 | 312 | 350 | 416 | 393 | 329 | 345 |
| 733 | Hbo1241 | 350 | 2116 | 431 | 504 | 568 | 553 | 381 | 433 | 364 |
| 960 | HVO_A0320 | 354 | 431 | 1603 | 1166 | 587 | 602 | 377 | 489 | 338 |
| 996 | Hmu3318 | 312 | 504 | 1166 | 1787 | 699 | 663 | 397 | 484 | 361 |
| 997 | HVO_B0135 | 350 | 568 | 587 | 699 | 2044 | 807 | 491 | 554 | 540 |
| 965 | hla2222 | 416 | 553 | 602 | 663 | 807 | 2099 | 468 | 550 | 474 |
| 810 | Hmu0502 | 393 | 381 | 377 | 397 | 491 | 468 | 2057 | 654 | 552 |
| 960 | HVO_1103 | 329 | 433 | 489 | 484 | 554 | 550 | 654 | 2193 | 813 |
| 847 | Hbo0608 | 345 | 364 | 338 | 361 | 540 | 474 | 552 | 813 | 2386 |
374 symbols consensus MAALQSLQTALGALRRNPILFLIGLAFGLLQLPQLALQLAG-PLVASL-SL-LSGVTFLV #oth 254462355465534231434446533333521332324451143453412266423422 Hmu1701 VKPTGA:S:GIDT:::Q:QIVA:LF::S::STGLS:V:FVN:::L:YP:--:AT::VY:L Hbo1241 :VVAH:::::VE::::::VIAG:TVLLA:F:::LQFVP::A::STTIIA:AVSLVA:V:: HVO_A0320 --------------------------VFA:LV:::L::SSY::::ST:Y::GI:A:FL:: Hmu3318 :GV::A::RTP:::K:A:G:LVPQ:IVFV:L::::L::S:A:::LS::V::GV::IFLV: HVO_B0135 ::::::IG::A:S::::::::VVAM::S:V:::S:FA:AV:::::GGIV::VF::::VF: hla2222 :::::A:RP:VSGVV::::VL::TAL::GF:::N:LV:STS::VL::AI::VTF::MI:: Hmu0502 ::TIK:FVESF:V::::::::A::ALYAVIV:::T::STF:I:I:PW::--:FQI:::FI HVO_1103 :::IS::::::RGI:S::V:::GS::L::IT:::::T:::QI:F:PTI:--::MA:::F: Hbo0608 :S::R::RV:::S:G:::V:::V:::Y::VM:::S::::T::N:FG:::--::PF:::F: consensus TPFIQGGLLGMADEAI----DGRTSLSTFVAVGKANYVSLLLAYFLLLVVNLVLGIVAVI #oth 3..351.3411141241111534321221454.153.332.3232323234434343344 Hmu1701 L::LV:::VAYVAASM::::TDSP:FEQ:L:A:RDH::G:::GGL::G::T::VYVLVA: Hbo1241 L:::F::IF::::::L::::::T:NFG:::EM::RH:T:M:G::L:::GGSI:F:TI:WV HVO_A0320 :::::::MF::::::L::::TT:S:::R:::D:::::L:::I::V::::::G:I:A:G:A Hmu3318 :::::::MF::::::L::::R::S:::R:FTD::S:::Q:::::V::::::G:::V:::F HVO_B0135 I::FL::V::::N:::::::::::::G:L:SE::SH:::::VV::S::::::::SF:GGF hla2222 L::F::::::::::::::::A:EAR:G:L:::::::::P:::G::V::A::MIF:FL:FM Hmu0502 :::VIA:::A::Y:GR::::VRD::FE::KK:::DR:APV:IGNLIQA:FSF:Y::I:F: HVO_1103 :::VAA::Y::::::VGRGGS:S:::::LT:::REK:::V:::N:VQ:GIV:AF:::F:: Hbo0608 A::FVA:II:::S:S:::::::E:::::LKR::RNR::P::V:S:VNVGILIG:A:AGG: consensus -A--V----GLAGL-------GAGLNHGLGG-----------------LAIVAIVALAGL #oth 434532223343231222111156465453233222111111122121363332333332 Hmu1701 VFFVA::::VVLVF:::::::::A::T:::AAT::::::::::::::::SV:VLLS:V:F Hbo1241 :-::-::::-VV::::::::::TLVAIIPVFDSPQA:::::::LFPVL:L:MVVGSVLF: HVO_A0320 :-::-::::--::F:::::::::F:T::SI::::::::::::::::::T:FIGLA:I::: Hmu3318 :-::-::::--::V:::::::::L:G::TA:::::::::::::::::::VLL:V::VV:: HVO_B0135 A:VF::::::::V:::::::::S:IEL:TV:::::::::::::::::::::L:::V::VV hla2222 G:II:IIGGSI::M::::::::G:VGT:M::GAGTGVDAPVVGFDPTL::V:GV::VGLV Hmu0502 V:IF::::V:FGAMAMADGGT:GTSDAM:::::::::::::::::::::G::S::LI::: HVO_1103 IVVA:AVSL::G::AASG::::DVS:LA::::::::::::::::::::GFL:G:AV:GL: Hbo0608 IVLLI::::::L:F:::::::-------VV::::::::::::::::::IPLI:L::AGLV consensus -LVYLVVAFFIQFYGQAIVLDDEGAVDSFRRSVRLVRNNLLSTVGYSVIALVIGLLVGGP #oth 2.631316222..124.21311733332143.333.16.42423.151253342224453 Hmu1701 :::V::PW::S::FPA:M:::GD:VA:::::::S:::S:AV:V::FDL::F::::::QT: Hbo1241 ::LF:IPFI::::::::::F:::::FS::F:::SI::Q:FWPV:::::VVFG:S:VF:-- HVO_A0320 ::-:::::::V::::::::I:GAS:I:::K::Y:V::G:::A::::MLL:::::A:S::V Hmu3318 ::-::L:T::V::::::::V:G:S:IAA:A::Y:V::A:::G:I::L:::VLV:GVA::L HVO_B0135 ::T::A:::VV::F:H:::I::L::::GVK:::AC:::::V:VF:::::-VGL:G::A:V hla2222 ::A::L:T::V:::AH:V:::GSEL::G::::AG:::S::::VF::T:LL::GS::::TL Hmu0502 V:FF:L:M::::::AT:::V::V:V::G::N::SV:L::I:EAL:FG::N:::::::AA: HVO_1103 G::::::S:L::::PV:V:VG:K:P:E::GE:Y::::H:VVP:L:::::RF:V::V:SI: Hbo0608 G:GIV::LV:::::PV:VS:G:TD:I::::Q:I::::K:::::I:::::NAIAV:IMTL: consensus AAGLSLLS-LQSA------------ASAAAAAASGLPQISTVEVGAIGLLSLLIQGVLGA #oth 442455557544645534333222144384366554355345453335463435443444 Hmu1701 T:F:FYS:FDSM:LD:::::::::::RSRTGMV:VFDYM::T:::LFLGS::V:ST:V:S Hbo1241 FF:SLPA:T:S:QLSPSAT::::::NTLLSEVL::V::::I:ASA:LT:FATILM:LSAG HVO_A0320 Y::V:::-:----:::::::::::::::D::S:A:::TL::PLLVVV:::AAV:GS:VS: Hmu3318 YG:::V:-:----:::::::::::::TPE:::Y-:::SL:IPLLVVV:::AAVVGS:VS: HVO_B0135 FG:VAS:LLTP:LRHQGTAVAGPGSGAP::S:F:S::A:GV:GMV:VAVGLV:VS:LI:G hla2222 ::AA:FVVGP:PP::::::::::::G:PI:ELVPFD:STGV:V:::::Y--V:LT:MA:: Hmu0502 VF::F:VPI:TGGMGSGGMGS:::::::MD:TQT:GLGATLLAQ:G:VVY:::S:L::TP HVO_1103 :T:VI:FVSF::VQQVQ::::::::DA:NP:V:QAGVGFAPM:IA::AV::IAT:TI:A: Hbo0608 VS:PMYYRQ::G:QQLQRMQTQGMSPN:VSSQM:Q:V:F::Q::MLLSAI::AAMML:FT consensus FQLTYSVAFYREH---------------TGD----------------------------- #oth 264112112125331111111111111153254544343443232222221111111111 Hmu1701 IMYA:Y::Y:::I:::::::::::::::-::ASSAATDTTRL:::::::::::::::::: Hbo1241 LL::F::::::SLA:::::::::::::::S:NADDANDAAVRGTSA:::::::::::::: HVO_A0320 :L::F:::V:D:L:::::::::::::::::-::::::::::::::::::::::::::::: Hmu3318 :S::F:::V:D:F::::::::::::::::V-::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0135 :FAA::T::::SI:::::::::::::::RPTNPETTTP:::::::::::::::::::::: hla2222 :YA::::::::RI:::::::::::::::S:TVAN:::::::::::::::::::::::::: Hmu0502 :RSAF::S::DN:T::::::::::::::E:-::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1103 ::Y::A:::FEA:D::::::::::::::A:TDGPTGTAGPDIDGDAAIPQ:::::::::: Hbo0608 ::QA:AT::::D:APPLEDGTTRADVSAS::EPPVSDEASGLDADSGFGDSSTETTESNG consensus -------------- #oth 11211111111111 Hmu1701 :::::::::::::: Hbo1241 :::::::::::::: HVO_A0320 :::::::::::::: Hmu3318 :::::::::::::: HVO_B0135 :::::::::::::: hla2222 :::::::::::::: Hmu0502 :::::::::::::: HVO_1103 :FE::::::::::: Hbo0608 GFDTGTDDSTDGQL