| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3612 | Hut0095 | HVO_1832 | Hbo1649 | Hut2011 | hla1723 |
| 2560 | Hut0095 | 3735 | 2101 | 2062 | 2164 | 2074 |
| 2802 | HVO_1832 | 2101 | 3566 | 2857 | 2223 | 2179 |
| 2759 | Hbo1649 | 2062 | 2857 | 3449 | 2166 | 2148 |
| 2898 | Hut2011 | 2164 | 2223 | 2166 | 4018 | 2986 |
| 2793 | hla1723 | 2074 | 2179 | 2148 | 2986 | 4108 |
564 symbols consensus VS--------------------------------------LDEDGP-------------- #oth 121211111122212221121212111222122211211132242233221211222122 Hut0095 --::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::S::KT:::::::::::: HVO_1832 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:G:-:::::::::::::: Hbo1649 --::::::::::::::::::::::::::::::::::::::------:::::::::::::: Hut2011 :NDR::::PPSDKSDGSGTDPSSS:::SAKGPDPNDDGPD::S:::ESTADPSDGDDSGD hla1723 ::DEPSEDPPESPSEFGGTGPGSADDDAGDGGGDNDSGP:I::TNSGVAGDASDDRVSDK consensus SITEGSLIRPMFALAWPIVVIQLLQVAYNLADTIWLGRLSADAVGAISLAFPLIFLLISV #oth 23121313111241...11.21..1.2..22..21..11.11..1.1.1.1.....1.11 Hut0095 NV:::G:L:::LDI:::L::F:::N::::VT::::::HY:::::::L:I:W:::::F::I HVO_1832 :L:::D:K::::E:::::I:TE:::::::::::V::::::T:::A::::::::::::::: Hbo1649 ----------::::::::I:TE::::::::::::::::::T:::A::::::::::::::: Hut2011 :::Q::::::LIG:::::::::::::T::I:::L::::::::::::::::::::::::A: hla1723 ::::::::::L:H:::::::::::::M::VV::LY::::::E::::::::::::::::A: consensus AGGFTTAGAILVAQYTGAKGEGSAGLVAGQTLAFVAVIAVVIGVAGFFYTDPALELLPSS #oth 1...12..21........1211...3.1.1134114321112.14.1131132.22...1 Hut0095 ::::NS::::::::::::DS:::::::T:NQ:V::VGM:T:L::::::LS:QL:A::::: HVO_1832 G::::V::ST:::::::::S:::::T::::::T:IT:::::V::I:::A::AM:GV:::: Hbo1649 G::::V::T::::::::::E:::::V:::::F::ISI::::V:LL::AS::LM:GV:::: Hut2011 :::::::::::::::::::::R:::H:T:::VS::GLLS:::::V:Y:::R::::::::D hla1723 ::::::::::::::::::D:D::::::::::IFS:::LS:L:::G:Y:::R::::I:::D consensus AATAAQVIPLAADYMEVFFLGLPLLFGFFVFSALMRGYGDTRTPMVVMFISVGLNVVIDP #oth 22.2231..2.2...1.112.1.11.1..1..11.....1.11..3..22..31.112.. Hut0095 :D:TERI::M:N::::::Y:::::::S:::::SV:::::::K:::Y::AG:::::::::: HVO_1832 E:::G::::::G:::R:::::::F:::::::::::::::N::A:::::::::VI:I:::: Hbo1649 ::::G::::H:G:::R:::::::F::::::::S::::::N::A:::::::::AI::LV:: Hut2011 PE:S:S:::::::::::I:M:I::M::::I:::::::::::::::F::VV:::::::L:: hla1723 PD:::T:::::::::::I:A:I::M::::::::::::::::::::A::VV::F:::LL:: consensus IFIFGFAANPLFGMLGLR---------GLQATLFAATGFTGFGIEGAAIATILSRGVATV #oth 21....33....32213411111111113222.211.1.3.2113...3..12..11111 Hut0095 :L:::::D::::APP::D:::::::::VIG:::AEL:A:G::::Q:::::::S:::L:A: HVO_1832 V:::::D:::::S:::VE::::::::::F::S:::::::D::KVA:::Y::V:::A:::: Hbo1649 ::::::ES::::::::I:::::::::::VES::::::::E:Y:VT::::::V:::A:::: Hut2011 F::::::G::::EWV::G:::::::::::E:::E:::::::L::::::L::::::::G:A hla1723 FL::::S::::::W:AAVPLVAALDPV:::EA::::::::::::::::M:::F::::::A consensus IGLWLLFGTGAGPDVSLEHLRPDFEYIRDIIRLGLPSAVEQSASALGMITLTAMVVTFSP #oth 1.1211.2113..1.322111.1122.221211.2.133..112..11..1...111.3. Hut0095 A:IL:::FA:Y::::R::::::::GV::KMVD::::TTA::::A::::::M::::SM::: HVO_1832 ::IYVI:::S:::::Q:ADF::Q::::KQ:VDI:V:::I::::T:::F::::::::::N: Hbo1649 :::YVI:::S::::::VSDFV:QR:::EK:::::V:::L::::::::F::::::::::A: Hut2011 ::::::::::I::A:TF:::::::PV::::::::T::M::::T:::A:::::::I:::T: hla1723 :::::::A::L::A:::S:::::RGF:E::F::::::S:::TT:::A::::::::::::: consensus EVVAAYGLGNRLISLVFLPAMGLGRATDTMVGQNLGANKPDRAERAVWLAAKVGAGVMFV #oth 2....1..1..1211....11.....11.1.......2111..211121.121111.131 Hut0095 A:::::::T::IGTI::::S:::::::N:::::::::E::::::::T:V:S::IV::L:: HVO_1832 :::::F::::::T:::::::L::::::N:I:::::::Q::E:::S::R:::::::S::L: Hbo1649 ::::::::::::T:::::::L::::::::I:::::::E::E::::::::::::::S::V: Hut2011 P:::::::::::::::::::::::::I:::::::::::R::::S::T::::GT:::::A: hla1723 P:::::::::::::::::::::::::I:::::::::::RA:::A:S:K:::ST::::::L consensus VGVVAFIFAEPIVGVFLGTGTDAAA-TIALGVEYIRIRAVEFGFIGVLQVILGAFRGAGN #oth 3122.23.2....22.2211122113.123111.211.11..3.1..3.12...1..... Hut0095 A:AI::::P::::::::::::EE::I:L:FAAT:LQV::F::V:M::F::M::::::::: HVO_1832 T::L:Y:::::::AF::Q:::AS::Q::D:::::::::::::::::::::::::Y::::: Hbo1649 I:::::L::::::S::ID::::S:TK::E::A::::V::F:::::::::TV:::Y::::: Hut2011 :A:::VV:T:::::A:M:DVP::::::::N::::V:::S:::T::::T:::::::::::: hla1723 :AI::VT:T:::::::::DVP::P:::::SA:::VQ::S:::A::::S:::::::::::: consensus TKTAMVISIFALWLGRVPIVYLLSFVFG-FGETGIWIGMALGNILGAIAAVAWFTRGTWK #oth .1..132.231..2..122.12.2133112112.1.2.1.2.2.1.122121..2....1 Hut0095 :R::::L:VI::::::::L::::AVDP:IL::F:::::F:A:D:::G:V::L:::::::: HVO_1832 ::::LGF:L::::::::::::::::Q::::A:::::L:::V:Q:::::::T::::::::: Hbo1649 ::::LAF:L::::F::I::::Y:::MQ:::::M:::::::V:Q:::::::A::::::::: Hut2011 :R:::::::MT::V:::TS::A:V:::E:W:A::V:V:::::::V::VLG::::L::::: hla1723 :::::M:::LT::V:::AS:AY:V::A::W::::::V::::::::::TV:::::A::::T consensus EAVIDEPAPDADPAV--------- #oth 221113323242212321111111 Hut0095 ::::E:TG::SE::AEPPEAVNTD HVO_1832 HS:V:AD:VGT----::::::::: Hbo1649 R::::HSEAAME---::::::::: Hut2011 :RY:::::L:::E::S:::::::: hla1723 :RY::D:::GV::::DD:::::::