4 genomes BUD2090 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - pNG7161 HVO_A0538 Hbo3060 - - - NP2956A -

Pairwise sequence scores
Consensus score	2918	NP2956A	pNG7161	HVO_A0538	Hbo3060
2191	NP2956A	2915	1901	2000	1986
2296	pNG7161	1901	2914	2126	2172
2678	HVO_A0538	2000	2126	2926	2684
2691	Hbo3060	1986	2172	2684	2921

405 symbols
consensus       MNIIERLKAIGPGAMVAAAFIGPGTVTTASVTGAEFGYALVWTIAFSIVATIVLQEMSAR
#oth            .2232...11....1.....1..........1..211.1.2..11...2..1........
NP2956A         :GLLA:::::::::L:::::V::::::::::I:::YA:L:::::::::L::M::::::::
pNG7161         :S:TK::::V::::::::::::::::::::::::::::::L::MV:::::::::::::::
HVO_A0538       ::F:::::S:::::::::::::::::::::::::R:::::::::::::::::::::::::
Hbo3060         :::V::::S:::::::::::::::::::::::::Q:::::I:::::::I:::::::::::

consensus       LGLVSREGLGEALRNQFDNPAASAASIALVVSAIGIGTAAYETGNILGGAAGLAGITGIS
#oth            ...1111.......32.11232233112...1...1....111...1......111..11
NP2956A         :::IT:D::::::::E:S::L:KW:TVG::::::::::::FQ::::V:::::::T:::V:
pNG7161         :::::G::::::::ER:::QIVEYV::F:::G:::V::::::A:::::::::::T::::D
HVO_A0538       ::::::::::::::G:::S::L:GL::::::::::V:::::::::::::::::E:L::::
Hbo3060         ::::::::::::::S::::EV:::F::::::::::::::::::::::::::::E:L::::

consensus       ANVWGPAMGLVAGALLWSGKYKLIERALIGLVAVMAVSFLADAIIIGPDLGALAMGFVPS
#oth            212..111..1.12..11.2.....11111..12.121.232..111..1..112.11.2
NP2956A         E::::::I::::A::::::N::::::VF:A:::::G:A:ILN:::VR::::::GG:L::T
pNG7161         ST:::VV::::::L::YT:R::::::::::::::::F::V:S::L::::P::I::::::G
HVO_A0538       ::L::::::::::V:::::::::::K::V:::SI::::::I:::L:::::::::R::I::
Hbo3060         ::I:::V:::I::::::::::::::K::V:::SL::L:::V:::::::::::::::::::

consensus       IPDGSAFLITGLIGTTVVGYNLFLHAGSVQERWAGPDDLNESRADTVLSIVVGGIITIAI
#oth            1.3..21..1..1...1.........12.....211211211.2..111112..3..12.
NP2956A         ::::::Y::V::::::::::::::::ST:::::DDKS::A:C:T::IAMVA::::::T::
pNG7161         ::S::LY:::::::::I:::::::::SN:::::S::::IGH::I:::::::A::V:::T:
HVO_A0538       V:E:::::::::::::::::::::::::::::::::EE:::::::::::::L::F:::S:
Hbo3060         V:Q::E::::::V::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::L:::::

consensus       LVTAAAAFPPGTEIQNVGTMAEQLEPLVGTYAKVFFGIGLFAAGFTSATTAPLAGAYATA
#oth            2.....1.11..2.21112..1.11.22.22.221.21.1........11......1..1
NP2956A         V:::::V:::::::DD::E::N::::VF:G::LT::AV::::::::::MS::::::::::
pNG7161         M:::::::E:::Q:SDI:R:::::R:IA:P::EL::S::I::::::::::::::::W::T
HVO_A0538       :::::::::V::N::::S::::::::::::Q:::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3060         :::::::::V:::::::S:::::I::::::H:::L:::::::::::::::::::::::::

consensus       GALGWDTDLQSTKFRAVWGTILLVGIVFSALGYSPVQAIVFAQVANGILLPIVAVFLIYA
#oth            .....12.11.12...1.11..21.112112121..12......1..2....1.1....1
NP2956A         :::::ER::T:MR:::I:M:::G::::G::MDLN::SV:::::::::L::::L:::::::
pNG7161         ::::::S:M:::Q:::::::::S::VLSVL::G::::I::::::V:::::::::::::::
HVO_A0538       :::::::::::::::::::S::::::::::V::::::::::::::::V:::::::::::V
Hbo3060         :::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::I::::V

consensus       MNDRDILGEYTNSTLQNVLGGLVTLIVVWLGLRTLYTVA-D-GVL
#oth            ..21.1..1.2.2221.21.12..11..11.11..12.12121.1
NP2956A         ::ND:L:::::::R:::I:::::::V::GI::Q:::D:L:-:-::
pNG7161         ::Q::L::::::GSIA:A::AI:::::::::V:::LS:::-::::
HVO_A0538       ::::::::S:A:::::::V::::::V:::::::::::::T:M::F
Hbo3060         ::::::::S:V:N:V:::V::V::I::::::::::::::A:L::F