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4 genomes BUD2117 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0648

-

Hbo0912

Hbo3034

-

Hut1547

-

NP6040A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score2152 NP6040A Hbo3034 Hut1547 rrnAC0648 Hbo0912
1577NP6040A 2161 1280 1228 1288 1302
1608Hbo3034 1280 2141 1656 1230 1271
1653Hut1547 1228 1656 2141 1227 1320
1616rrnAC0648 1288 1230 1227 2145 1574
1707Hbo0912 1302 1271 1320 1574 2181

291 symbols
consensus       --MASMDADDRLEPPEITPEDILFLDDPHFTSENVALVTGAASGIGRATALALAANGLTV
#oth            11222343222123122133211231.11113221111..11....1...112....112
NP6040A         :::S:PE:E:SI::::::T:V:HRI:::::::N::::::::::::::::::V:::::::T
Hbo3034         ::---:PHEFD:TE::L:AD:L:V:E::::GP:TT:V:::::::::Q:::V:::::::S:
Hut1547         ::---:SD:FD:SA::L::::L:V:E::R::E:S::::::::::::Q:::V:::::::::
rrnAC0648       :::::STSHE:::VEP:DESS:::A::D:Y::DT:C::::GG::::::::::M::::V:A
Hbo0912         MRE:ET:::::I:::TFD:A::::V::D:::T::::VI:::G::::::::::C:::::::

consensus       VATDVDEDGLAETADLAAELDLDGTIHPVETDLTDDADIEAIVETAADQGTLRYVANIAG
#oth            211.1.31..2213322213213.3231133..11.1221132.2..32.31..11.1..
NP6040A         ::::::::::YN::QKGE::NV::E:K:IVC::::::E:::LA::::NA:Q::::V:V::
Hbo3034         IGA:I:D:::T::V:::DDIAVA::::::T::::::::V::MI:V:::::E:::::::::
Hut1547         :GA::::::::::DG:ID:F::P:PY::::::::::DAVD:V::A::E::D:::::::::
rrnAC0648       ::::I:A:::::V::T::D:::::AVET:AG::AN::::::::::::SH::V::L:::::
Hbo0912         A:::::GE::TD:QEK:::H::S::VVT::A::A::DEL:G:::::::H::V::L::V::

consensus       MQHIDPIEEFPMEKYDLLHDVMLRAPLYLAKLAMPHIRATDDGVGAIANMASVHGHYVTQ
#oth            1..112.22...121.32311.....22221113....211....111..1......1.3
NP6040A         :::VA:::S::::MF:R:YQ::::::M:ITQ::L::::EA::::::V::::::::::::R
Hbo3034         ::::AS:P::::::::FIV:I:::::FLT:::::::::::::::::::::S::::::A::
Hut1547         :::::::A::::K:::::T:I:::::F:T::R::::::E:E:::::::::S::::::A::
rrnAC0648       L::::A::D:::::::QM:::::::::A:S:RVI::::G::::::::G:::::::::::S
Hbo0912         L::::::::::::Q:::M:::::::::::S::VV:::::::::::VVG:::::::::::G

consensus       DKVAYNTAKFGLRGLTRSIAAEGEGDLRGFSVSTGYVKTPLVVNQIPDTAEERGISEREV
#oth            1.11.112.1.12...21.....2231.2.12.1...1...121..32..31.1.122..
NP6040A         :::::::M::::::::K:::::::S:I:A:TA::::::::::LD::AA::H::D:T::::
Hbo3034         ::P::I:::H::E::::A:::::::T:::::::V:::L:::M::::EG::D:::::K:::
Hut1547         A:P::I:::H:IT::::::::::::::::::::V:::L:::M::::R:::A::::::Q::
rrnAC0648       ::::::VS::::::::Q::::::GDG:::::I:::::::::::D:::::::Q::::VD::
Hbo0912         :::G::VS::::::::Q::::::D:S::S:::::::::::::T::::::::Q::::VD::

consensus       VEDVMLGQARTKEMMTPAEVANLFVFGFSRHAKHLNGGDLLFDGGMTTTYE
#oth            111.....1.21...2.21.1...1..1.3.12....1.121.1.2.3...
NP6040A         ::::::::::GG:::E:I::G:::A::L:::G:::::D:::W:D:F:N:::
Hbo3034         :::::::::::::::::::::::::::::G:G:::::::M:W:::Y:::::
Hut1547         :::::::::::::::::::::::::::::S::S:::::::C::::Y:::::
rrnAC0648       ID::::::::I::::D:ID:::::::::::::N::::::::::::::K:::
Hbo0912         I:N:::::S::::::::G:::::::::::K::::::::::R::::::L:::