|
Pairwise sequence scores | |||||
---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3801 | HVO_2074 | VNG2678 | pNG5078 | HQ3661A |
1865 | HVO_2074 | 3461 | 1208 | 649 | 770 |
2046 | VNG2678 | 1208 | 4532 | 682 | 853 |
1705 | pNG5078 | 649 | 682 | 4536 | 1155 |
2031 | HQ3661A | 770 | 853 | 1155 | 3961 |
742 symbols consensus ---------------------------------------------------MQSGANRRI #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111232333333 HVO_2074 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--------- VNG2678 MLSAFSRVSRRQNTDLGVYCSHETWMAERRHHARCRPAKTGVKDAPVRTEAAM::SGP:K pNG5078 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::KV:L:H: HQ3661A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:TT:QIL consensus CLIFACCVLIAGAV--AGAAAAEPAV--------------------------NVEVANRQ #oth 323233312222321122332121311111111111111111111111111132322233 HVO_2074 --------------::----------::::::::::::::::::::::::::-:VID::T VNG2678 ::VVGV::::::L:VP::GV::Q:::AGSDGAGNNIHAGAPFATDQALNLTT:LT::GTP pNG5078 MR::III::LSTT:::::T:T:::V:::::::::::::::::::::::::::T:ST:SGE HQ3661A V:T:::V:G::::T::FV:S::::T:::::::::::::::::::::::::::DI::N:E: consensus IADGDTITTADNPTLAINATANAQINLIEVRIDGDARRTYDPNSTAFNETTTLDLDAGEH #oth 331.32121312112322122323.3122211112321213.121212122211222.11 HVO_2074 V::::::::D:::::TVR:NGS:P:D:LV::V:::S::I:T:::::V:::A:::VN:::: VNG2678 LP::GSV::::::R::M:V:S::T:EV:S:::NDNT::S:V::A:::::S:R::::::T: pNG5078 :SE:E::K:T:EV:IN:::A:DSM:TVV:I:::::VVK::E:K:NT:SK:::P:TGD::Q HQ3661A FT::TE:DVGSD::VD:SV::ET::::::LYV::I:Q::F:::G:S:E:EFQ:T::N::: consensus DLEIVV-SADRTTTHRGTITEDSIAPAIEFTSPFST---G--NDYRRPPNNYTVNRAQVT #oth 222221222221.13321.22.121.312122.2221111223323322212.1232222 HVO_2074 A::VL:Q:NG:::A::A::I::::::::V:S:::R:::::NTSI:D::E::::I::S:IQ VNG2678 ::TT::RT::G:::YT::::::PN::LVT:EA:M:AGFV:PD:E:EPLG::::::Q:T:: pNG5078 NV::I:::S::V::FNY::VQ:::P:V::Y:::VQR:::-::YSG:SS:S:V::EN:Y:N HQ3661A :IQ::A:G:NK:::TD:V::K::G::F::Y:E:::::::-::P:KST::DVT::TEG:L: consensus LSGTIQDDSGVEQVEIERRYNYRGA-----DSRADSRRRIEIDDPGDSFSQQLRLGP--- #oth .2.213.312.2322.2121322331111121333222312.21.121122312.11222 HVO_2074 :D::LH:H:D::::T::L::HGQ:I::::::APWGF:K::V::::NT:I:KS:::::FNE VNG2678 :E:::::Q:A::YM::T:Y::::PGINGLP::K::AK:E:::P:::::::RE:::::GRP pNG5078 :::N:S:TT::NT:S:R:T:QHSSN:::::A:SGQ:V:TYR:NN::NR:N:::F:--::: HQ3661A :::DLF:::::QSI:::::FE::Y::::::N::ET::ANY:::::::::Q:KIL:--::: consensus -VGSGENELQARYADEMGNVRRHNFNIAVDDRAAPQINVLDPRRV-TRSAVEITARVTDN #oth 21.2.2.2131323.12.12.2132313.3.332.3.3222223221222223223...2 HVO_2074 Q::A:Q:S:KITAL:SR:HR:HY:V:LY:E:EDP:S:EI::Q:LIN::::IRL:I::::Q VNG2678 S::::V:R::IEV:::Y::::QYHTQ:::K:T:::E:::::R:P:A::::::V::E:::S pNG5078 :-:::::::L:::T:::::::::E:T:S:S:SEN:K:SLTV:N:T:FNQQ::MQVS:::: HQ3661A :-:N::::IT:K:I:::::Q:::D:SLV::::R::::D:NA:TQ:::EPSAT:S:T:::: consensus VGIQSVTVRRGSATGAGQNSERNPEPNAARPLSETITRNIPLAEGRNNITIEATDRAGNA #oth .212112122123213232323312133311223222311213213221223.1.33213 HVO_2074 :::R::G::::::D:S:L:Y:IQ:K:VG:::IEH:F:KT::::GDSR::::V:D:GTE:: VNG2678 :::S:IS::D:PV::::::VLFTQRQPLR::F:::V:TTV:ILD:TKA::LI:::Q:NHR pNG5078 :QL:T:::E:PDG::FRPIT:S::::DPSL-::TK:S:::S:D::K:::SVT::::D::S HQ3661A :KL::::ITAP:MGNKQVV:S:G:::::D:-:QVN:NE::D:S::::EVD:::::VN::T consensus TSRELTVNYNRLIEPAIEIDANNTRVAG-NRVSVQGRVYDGEITRVSVETRNPTGN---I #oth 22112213132212.2.22233313232132122211122.2111122113322211121 HVO_2074 :K::IE:DHTQ:VR::::VRPDTL::SD::::H:E::::::RV:S:YA::VG:::::::T VNG2678 :T:::A:::SE:VT:::QF:NSL:GT::AQ::QAV::::::Q:S::R::SLT:D:E:::T pNG5078 A:ESA:IT:::Q:::K:T:YR:Q:QITN:GNL:L:AA:IQ::::::::::I:L:T:::D: HQ3661A V:E::::E:V:I:::T:::::E::T:E::DS::::::IFR::V::A:IQ::SDSK:GTE: consensus IDIAQIYS-GGVTEAVTINETLALDAYPA--AVRVRATDSEGTEHTNSV------G---- #oth 1.1331.2112.213.2131213123221113111211.11.22.232222222212211 HVO_2074 ::L::::G:::::S:::F::::Q::S:::::R::I:::::T:R::IE::::::::-:::: VNG2678 :::NSV::::::::N:SFQ:L:DAE:::::::::::VL:VT:::::KTI::::::-:::: pNG5078 V:LQL:::::T:R:R:D:G:II::AGGRT::Q:Q:S::::::EL:::VLVADNRS:KV:: HQ3661A V::GGV:TQDS:A:T:::DQ::T::TNETVTEI::L:::::::Q:EH::WINAKT:TIGD consensus ---AVAQSNPADERPAQTAG--------ADNDTAGDTTDDADETTVRTITAEPTV-AQTE #oth 111323213231233332222222222232311113221231222211223322211322 HVO_2074 :::Q:::P:AT---------::::::::::PE::ST:SP:---S::::N:PL:G::PSES VNG2678 :::ELS::E:V::VVVEG::::::::::TETE:::GEG:Q::R::L:N:ESS:A:SPG:A pNG5078 :::FINE:SL::::S::::TETQAVSNESS::SNSSN:PGT::AIQE::::TT:G::T:: HQ3661A SPS::DG:L:S:TT:MS:T:PSEETNIDG:S::N::::::N:::N:E:--D:N:L:::D: consensus DTQGPAGTAVEATSNS-------------------------------------------- #oth 3232212.1212123211111111111111111111111111111111111111111111 HVO_2074 SS::LL::L:::VR:L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG2678 :QS::L::LTGLV:E-:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG5078 P:EI::S::I:::GV:VVVAKINQTQIQLGDTVTVNASIENRRRINQDVVVPVAANGEVI HQ3661A T:TSV:T::::S::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus -----------------------PG----------------------------------F #oth 111111111111111111112221111111111111111111111111111111111112 HVO_2074 :::::::::::::::::::::::--::::::::::::::::::::::::::::::::::V VNG2678 :::::::::::::::::::::::--::::::::::::::::::::::::::::::::::Y pNG5078 YTQNKTIPKNSTINMSLQYTANK::NVSLQVGSAPAGKISVSEDSGLVPLDLVRNGLIV: HQ3661A ::::::::::::::::::::QSS::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus GLIIAGEALELALLAITQRR-- #oth 2322313323133232333211 HVO_2074 STTAT::S::V---------:: VNG2678 A:P:V:LLVVVI::LVV:Q:RG pNG5078 :S:VI:GY:I:KS:::YLGY:: HQ3661A :V:::II:IS::FIG::H::::