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4 genomes BUD2188 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2678

pNG5078

HVO_2074

- - - - -

HQ3661A

Pairwise sequence scores
Consensus score3801 HVO_2074 VNG2678 pNG5078 HQ3661A
1865HVO_2074 3461 1208 649 770
2046VNG2678 1208 4532 682 853
1705pNG5078 649 682 4536 1155
2031HQ3661A 770 853 1155 3961

742 symbols
consensus       ---------------------------------------------------MQSGANRRI
#oth            111111111111111111111111111111111111111111111111111232333333
HVO_2074        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::---------
VNG2678         MLSAFSRVSRRQNTDLGVYCSHETWMAERRHHARCRPAKTGVKDAPVRTEAAM::SGP:K
pNG5078         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::KV:L:H:
HQ3661A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:TT:QIL

consensus       CLIFACCVLIAGAV--AGAAAAEPAV--------------------------NVEVANRQ
#oth            323233312222321122332121311111111111111111111111111132322233
HVO_2074        --------------::----------::::::::::::::::::::::::::-:VID::T
VNG2678         ::VVGV::::::L:VP::GV::Q:::AGSDGAGNNIHAGAPFATDQALNLTT:LT::GTP
pNG5078         MR::III::LSTT:::::T:T:::V:::::::::::::::::::::::::::T:ST:SGE
HQ3661A         V:T:::V:G::::T::FV:S::::T:::::::::::::::::::::::::::DI::N:E:

consensus       IADGDTITTADNPTLAINATANAQINLIEVRIDGDARRTYDPNSTAFNETTTLDLDAGEH
#oth            331.32121312112322122323.3122211112321213.121212122211222.11
HVO_2074        V::::::::D:::::TVR:NGS:P:D:LV::V:::S::I:T:::::V:::A:::VN::::
VNG2678         LP::GSV::::::R::M:V:S::T:EV:S:::NDNT::S:V::A:::::S:R::::::T:
pNG5078         :SE:E::K:T:EV:IN:::A:DSM:TVV:I:::::VVK::E:K:NT:SK:::P:TGD::Q
HQ3661A         FT::TE:DVGSD::VD:SV::ET::::::LYV::I:Q::F:::G:S:E:EFQ:T::N:::

consensus       DLEIVV-SADRTTTHRGTITEDSIAPAIEFTSPFST---G--NDYRRPPNNYTVNRAQVT
#oth            222221222221.13321.22.121.312122.2221111223323322212.1232222
HVO_2074        A::VL:Q:NG:::A::A::I::::::::V:S:::R:::::NTSI:D::E::::I::S:IQ
VNG2678         ::TT::RT::G:::YT::::::PN::LVT:EA:M:AGFV:PD:E:EPLG::::::Q:T::
pNG5078         NV::I:::S::V::FNY::VQ:::P:V::Y:::VQR:::-::YSG:SS:S:V::EN:Y:N
HQ3661A         :IQ::A:G:NK:::TD:V::K::G::F::Y:E:::::::-::P:KST::DVT::TEG:L:

consensus       LSGTIQDDSGVEQVEIERRYNYRGA-----DSRADSRRRIEIDDPGDSFSQQLRLGP---
#oth            .2.213.312.2322.2121322331111121333222312.21.121122312.11222
HVO_2074        :D::LH:H:D::::T::L::HGQ:I::::::APWGF:K::V::::NT:I:KS:::::FNE
VNG2678         :E:::::Q:A::YM::T:Y::::PGINGLP::K::AK:E:::P:::::::RE:::::GRP
pNG5078         :::N:S:TT::NT:S:R:T:QHSSN:::::A:SGQ:V:TYR:NN::NR:N:::F:--:::
HQ3661A         :::DLF:::::QSI:::::FE::Y::::::N::ET::ANY:::::::::Q:KIL:--:::

consensus       -VGSGENELQARYADEMGNVRRHNFNIAVDDRAAPQINVLDPRRV-TRSAVEITARVTDN
#oth            21.2.2.2131323.12.12.2132313.3.332.3.3222223221222223223...2
HVO_2074        Q::A:Q:S:KITAL:SR:HR:HY:V:LY:E:EDP:S:EI::Q:LIN::::IRL:I::::Q
VNG2678         S::::V:R::IEV:::Y::::QYHTQ:::K:T:::E:::::R:P:A::::::V::E:::S
pNG5078         :-:::::::L:::T:::::::::E:T:S:S:SEN:K:SLTV:N:T:FNQQ::MQVS::::
HQ3661A         :-:N::::IT:K:I:::::Q:::D:SLV::::R::::D:NA:TQ:::EPSAT:S:T::::

consensus       VGIQSVTVRRGSATGAGQNSERNPEPNAARPLSETITRNIPLAEGRNNITIEATDRAGNA
#oth            .212112122123213232323312133311223222311213213221223.1.33213
HVO_2074        :::R::G::::::D:S:L:Y:IQ:K:VG:::IEH:F:KT::::GDSR::::V:D:GTE::
VNG2678         :::S:IS::D:PV::::::VLFTQRQPLR::F:::V:TTV:ILD:TKA::LI:::Q:NHR
pNG5078         :QL:T:::E:PDG::FRPIT:S::::DPSL-::TK:S:::S:D::K:::SVT::::D::S
HQ3661A         :KL::::ITAP:MGNKQVV:S:G:::::D:-:QVN:NE::D:S::::EVD:::::VN::T

consensus       TSRELTVNYNRLIEPAIEIDANNTRVAG-NRVSVQGRVYDGEITRVSVETRNPTGN---I
#oth            22112213132212.2.22233313232132122211122.2111122113322211121
HVO_2074        :K::IE:DHTQ:VR::::VRPDTL::SD::::H:E::::::RV:S:YA::VG:::::::T
VNG2678         :T:::A:::SE:VT:::QF:NSL:GT::AQ::QAV::::::Q:S::R::SLT:D:E:::T
pNG5078         A:ESA:IT:::Q:::K:T:YR:Q:QITN:GNL:L:AA:IQ::::::::::I:L:T:::D:
HQ3661A         V:E::::E:V:I:::T:::::E::T:E::DS::::::IFR::V::A:IQ::SDSK:GTE:

consensus       IDIAQIYS-GGVTEAVTINETLALDAYPA--AVRVRATDSEGTEHTNSV------G----
#oth            1.1331.2112.213.2131213123221113111211.11.22.232222222212211
HVO_2074        ::L::::G:::::S:::F::::Q::S:::::R::I:::::T:R::IE::::::::-::::
VNG2678         :::NSV::::::::N:SFQ:L:DAE:::::::::::VL:VT:::::KTI::::::-::::
pNG5078         V:LQL:::::T:R:R:D:G:II::AGGRT::Q:Q:S::::::EL:::VLVADNRS:KV::
HQ3661A         V::GGV:TQDS:A:T:::DQ::T::TNETVTEI::L:::::::Q:EH::WINAKT:TIGD

consensus       ---AVAQSNPADERPAQTAG--------ADNDTAGDTTDDADETTVRTITAEPTV-AQTE
#oth            111323213231233332222222222232311113221231222211223322211322
HVO_2074        :::Q:::P:AT---------::::::::::PE::ST:SP:---S::::N:PL:G::PSES
VNG2678         :::ELS::E:V::VVVEG::::::::::TETE:::GEG:Q::R::L:N:ESS:A:SPG:A
pNG5078         :::FINE:SL::::S::::TETQAVSNESS::SNSSN:PGT::AIQE::::TT:G::T::
HQ3661A         SPS::DG:L:S:TT:MS:T:PSEETNIDG:S::N::::::N:::N:E:--D:N:L:::D:

consensus       DTQGPAGTAVEATSNS--------------------------------------------
#oth            3232212.1212123211111111111111111111111111111111111111111111
HVO_2074        SS::LL::L:::VR:L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
VNG2678         :QS::L::LTGLV:E-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
pNG5078         P:EI::S::I:::GV:VVVAKINQTQIQLGDTVTVNASIENRRRINQDVVVPVAANGEVI
HQ3661A         T:TSV:T::::S::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       -----------------------PG----------------------------------F
#oth            111111111111111111112221111111111111111111111111111111111112
HVO_2074        :::::::::::::::::::::::--::::::::::::::::::::::::::::::::::V
VNG2678         :::::::::::::::::::::::--::::::::::::::::::::::::::::::::::Y
pNG5078         YTQNKTIPKNSTINMSLQYTANK::NVSLQVGSAPAGKISVSEDSGLVPLDLVRNGLIV:
HQ3661A         ::::::::::::::::::::QSS:::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       GLIIAGEALELALLAITQRR--
#oth            2322313323133232333211
HVO_2074        STTAT::S::V---------::
VNG2678         A:P:V:LLVVVI::LVV:Q:RG
pNG5078         :S:VI:GY:I:KS:::YLGY::
HQ3661A         :V:::II:IS::FIG::H::::