Home |  Text search
4 genomes BUD2200 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7318

HVO_B0235

Hbo3082

- - - -

HQ1130A

Pairwise sequence scores
Consensus score8567 HQ1130A pNG7318 HVO_B0235 Hbo3082
3620HQ1130A 5920 3368 3418 3331
7772pNG7318 3368 8589 7247 7140
7831HVO_B0235 3418 7247 8621 7199
7733Hbo3082 3331 7140 7199 8516

1123 symbols
consensus       MSTDDPLPRVPDIDDPQPETPVTAEFETGTANDPPVGTDGDDPTTLRVDGERVTVPPGST
#oth            ..1.22113212331122211113111111121122112222211131222311121111
HQ1130A         ::S:ND:-----------------------------------------------------
pNG7318         ::::KSI:::::LH:::::::::H::::::::::D::::T::::::T::::::::A::::
HVO_B0235       ::::::::G::E:::::H::::::::::::::::::::::E:::::S:::TQ::::::::
Hbo3082         ::::::::SI::VT::R:Q::::S:::::::S:::T::S::AS:::::ND:L::::::::

consensus       VIDAMQAADDDIVSVDPGADGLDDDADVPALCYYDRDGDCSDEVGPRSECRTCMVETDEH
#oth            211121232133121211123232111111111111311211121111111112111211
HQ1130A         ------------------------------------------------------------
pNG7318         I:::L:DL:::::::::::E:VE::::::::::::::::::::::::::::::::::E::
HVO_B0235       :::::::V::EV::::::::S::E::::::::::::G::A:::I::::::::::::::::
Hbo3082         ::::::::S:QT:T:S::::V:H:::::::::::::E::::::::::::::::I::::::

consensus       GLVPSCSFPAEDGLRVRTDTPDAEESRSVNLDLVLSNHNLRCTTCNGNGRCELQETAISE
#oth            121111111121112131113212121111111111111111111111111111221222
HQ1130A         ------------------------------------------------------------
pNG7318         ::::::::::::::S:S::::::::A::::::::::::::::::::::::::::DA::::
HVO_B0235       :V::::::::T:::::E:::SA:::::::::::::::::::::::::::::::::::V::
Hbo3082         ::::::::::::::::::::V::A::::::::::::::::::::::::::::::::::GA

consensus       GVDHPRYGVFDDRAEYEPLDDTSSFIQIDRNKCILCNRCVEACNDVQVEGVLRIEGSGED
#oth            212111111112132111211211111111111111111122111111111111112121
HQ1130A         ------------------------------------------------------------
pNG7318         :::::::::::E:DQ:::I:::::::::::::::::::::D:::::::::::::::H:::
HVO_B0235       :::::::::::::S:::::::S:::::::::::::::::::G::::::::::::::::::
Hbo3082         D:E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:

consensus       TRIGFQSDAETMADSECVSCGHCATVCPTGSLTEKGIGGAGTLPLPGFTQRNSVGRVIEH
#oth            111111111111211211111111111111221112121121111111111112131121
HQ1130A         ------------------------------------------------------------
pNG7318         ::::::::::::H::::::::::::::::::::::::D::A::::::::::::I:K::::
HVO_B0235       :::::::::::::::D::::::::::::::A::::D::::::::::::::::::::::::
Hbo3082         :::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::T::D:

consensus       EDVETIDDTTAPNR--GFRPGDEGAA-----------ADRSGVARFMAQAKRRADDI---
#oth            12211211121111112332123231111111111113322.1.211221.11.312222
HQ1130A         --------------::----------:::::::::::---N:::GY:QH::EQ:---:::
pNG7318         ::A:::::::::::::::E:::PR:::::::::::::KSKQ:L:K:AS::::::G::AKD
HVO_B0235       :::::L::::::::::SPD::SS:T:GGEAESGRAGREK::::::Y:::S::::S:FLET
Hbo3082         :S:::::::P::::SF:V:D::::D:::::::::::::::::::::::N:::::::::::

consensus       YGRKAMLAGEHTAENIAANTLPEGRLFDIASAVGDYRLGKLNKAETTCGFCAVGCRFEMW
#oth            112122121.11..31..2.2...1..11.221111..2211211....1.......111
HQ1130A         -----LSNV:NI::D:::D:F:::K::E::Q:I::K::EE::V:D::::Y:::::::DLY
pNG7318         ::K::F::::::::S:::::M:::::::::DI:S::::S:ID:E::::::::::::::::
HVO_B0235       :::::::::::::::L::R:::::::::V::L:S:::::N:D::::::::::::::::::
Hbo3082         -:::L::T::::::G:::::::::::::V:::::A:::::::R:::::::::::::::::

consensus       GKDGDSLGVVPVDDPDDAPANNFSTCVKGKFGHDFANSENRLTAPLIRNDDGEFEPASWD
#oth            1111221112.21.112..1.11.........11.1..23.1.3..1.112.111211.1
HQ1130A         SDGEEI:AAR:TE:-E:::I:GI:::::::::Y::I::DD::::::V:DES:Q:RE:T::
pNG7318         :::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::Q:V:E:::::::::L::TT::
HVO_B0235       ::::NAI::Q::::::N::::::::::::::::::::::::::K:::::E:::::A::::
Hbo3082         :::::::::::IE:::S::::::::::::::::E::::RK:::R::V:::A:::::T::E

consensus       EALDYVADRLREIQDEHGVDALGCLASSKGSNEEAYLVQKFARQVLGTKNIDNCARLCHS
#oth            1..21..2113..1.2..2121111....11...1..11.......1.11....1.....
HQ1130A         :::SR:::G:G::R:T::GE::SVI::::AT:::N::MG:::::::Q:NS::::N:::::
pNG7318         :::E:::E:FT::::A::I:S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_B0235       :::::::G:::::::::::::VS:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3082         N:::::::::S:::::::::TV::::::::T:::::::::::::::::::::::::::::

consensus       STVAALQQTLGYGAMTNRINEDIGEADAYLISGSNTTESHPVLATRIKQNVRDGADLVVF
#oth            ......1..1....1111111.112..11.11......1......1...........2..
HQ1130A         ::::::G::Y::::ASIS-TD:LEI::CI:LT::::::A::::::Q:::::::::::L::
pNG7318         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_B0235       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3082         ::::::::::::::::::::::::H::::::::::::::::::::::::::::::::I::

consensus       DPRKIGIAEHADQYTRTRPGYDVAWLNGLIRYIIEHDLHDEAFIERNTKGFEEVKEKVQA
#oth            ...1111..1.1...113....11.1..11..1..1..1.12.1111.11.11.221.11
HQ1130A         :::E:QM::Y:S:::QVK::::AV:I::IT::::::::Y::T:VAEQ:T:::::Q:S:EE
pNG7318         ::::V::::::::::::N:::::::::::::::::::::::::::::::N::::R:::::
HVO_B0235       :::::::::::::::::T::::::::::::::L::::::::E:::::::::A:::R::::
Hbo3082         ::::V:::::::::::::::::::::::::::L::N::::T:::::::::::S::K::::

consensus       FTPERVEELAGVSPDELASAAETLADADTVVFGWAMGMTQSSHGTENLIAMADLALTLGQ
#oth            ...11.1211...11.111...11.2.121....11.1.12......11...1..121.1
HQ1130A         :::D:::KIT:::H::I:::::MI::::GC::::TL:L:EH::::::V::::N::AIT:N
pNG7318         ::::K:K:::::::E::::::::::E::::::::::::::Q:::::::::::::::V:::
HVO_B0235       ::::K::R:::::::::K:::::::::EN:::::::::::::::::::L:::::::::::
Hbo3082         ::::::::::::::::::A::::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       VGKPGAGLSPFRGQNNVQGGGGDMGTLPGSLPGYQDPADDDVGEKFADAWGERPPAEPGL
#oth            1..1...1.................1..111....11...1.11..111.111113.1.1
HQ1130A         L::::::V:::::::::::::::::P::DNF:::::I:::::RA::E:::DCEIDP:Y:Y
pNG7318         :::::::::::::::::::::::::::::::::::N::::E::::::::::::::K::::
HVO_B0235       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::EV:::::::::::
Hbo3082         :::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::E::::

consensus       KVPEMLSEAHEGNLRGMYIVGENPALSEPDIQHAAEALENLDFLVVQDIFMTETAEYADV
#oth            1111.12.1111.11...11...1.....112..211..311..1...1.1....11...
HQ1130A         YTTQ:FL::A:D:I:::::I:::S:::::GVN::EDV:::::::::::L:V::::K::::
pNG7318         ::::::A:::A:::::::V::::::::::::::::::::D:E::::::::::::::::::
HVO_B0235       ::::::::::::::::::::::::::::::::::G::::S::::::::::::::::H:::
Hbo3082         :::::F::I:::::K:::::::::::::::VT:::::::QI:::A:::::V:::::::::

consensus       ILPAATSPEKHGTFTNTERRIQRVRPSSEPPGKARQDWEITQALANRLGYDWDYDHPREV
#oth            1...1111..1......1.11.1.12221.1.21.1..1.1.1..2.1.12.1..112..
HQ1130A         V:::SSFV::T::::::D:TV:M:NKVM::K:DS:P::I:L:E::::M:RS::::STA::
pNG7318         V:::::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::::R::::::::::::::
HVO_B0235       ::::::::::::::::::::V::::A:A::::::::::::::E::A::::::G:::::::
Hbo3082         ::::::::::::::::::::::::::::D:::E:::::::::::::::::E::::::K::

consensus       MDEINSLAPIYGGVSYDRLESGDEHGLQWPCWDEDHPGTPYLYDYEEGNFNFDDGLARFV
#oth            .1..11.1......111.1221111........21.1..11..111211..111.11111
HQ1130A         :::::::T:::::::HE:VK--ENG::::::::M:::::VR::ED:---::T:N:KVNLK
pNG7318         ::::::::::::::T:::::::E:::::::::::::D::::::::D::::::E::K::::
HVO_B0235       ::::SE:T::::::::E::D:::::::::::::D::::::::::::G:::::::::::::
Hbo3082         :A::S:::::::::T:::::N:::::::::::::T:::::::::::::::::::::::::

consensus       PADGGHPGELPDEEFPLTLTSGRVLYHWHTGQITRRVEGLMSHVGESFVEINPETAAQLG
#oth            111111.1.2.1.11.1...1.....11...11.1.1..1.111111.1.12.2..1321
HQ1130A         GVGYSE:A:T:T::Y:::::T:::::QY:::TM:H:E::I:QYNPSD::::::A:::GM:
pNG7318         :::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::VH::::EK::
HVO_B0235       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::T:::E:D
Hbo3082         :::::::::::::A::Y::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::I:

consensus       ISDGEYVRVESRRGDIVVKAQITDRVGPGTLFIPMHFAAGAVNKLT-QENFDPQAGIPEY
#oth            121.11..1.....21..1.11.....2111.1.1..111.1.1..12.31..1111..1
HQ1130A         ::G:DP::I:::::ET::P:::::::::ENV:V:I::TES:I:R::DE:HL::T:AT:::
pNG7318         :A:::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::::::G:T:::T::::::
HVO_B0235       V:::::::::::::::::::TV:::::D:::::::::::::::::::::V:::::::::F
Hbo3082         VE::::::::::::A:::::T::::::N::::::::::::::::::::::::::T:::::

consensus       KVSSVRVEPLGPDA-DEDVLRTPDAGGR--------SAATGDD
#oth            ...1....1111111.22.1111111232221111123311..
HQ1130A         :::A:::::ADA::L:A::DTGQE:MSQSLSSDDRT:MS::::
pNG7318         ::::::::V:::ET:::T:::::::::KQIR:::::KRG::::
HVO_B0235       ::::::::::::::::P:::::::::AG:::::::::::R:::
Hbo3082         ::::::::::::ET:::S::T:::V:::::::::::GET:R::