|
Pairwise sequence scores | |||||
---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 8567 | HQ1130A | pNG7318 | HVO_B0235 | Hbo3082 |
3620 | HQ1130A | 5920 | 3368 | 3418 | 3331 |
7772 | pNG7318 | 3368 | 8589 | 7247 | 7140 |
7831 | HVO_B0235 | 3418 | 7247 | 8621 | 7199 |
7733 | Hbo3082 | 3331 | 7140 | 7199 | 8516 |
1123 symbols consensus MSTDDPLPRVPDIDDPQPETPVTAEFETGTANDPPVGTDGDDPTTLRVDGERVTVPPGST #oth ..1.22113212331122211113111111121122112222211131222311121111 HQ1130A ::S:ND:----------------------------------------------------- pNG7318 ::::KSI:::::LH:::::::::H::::::::::D::::T::::::T::::::::A:::: HVO_B0235 ::::::::G::E:::::H::::::::::::::::::::::E:::::S:::TQ:::::::: Hbo3082 ::::::::SI::VT::R:Q::::S:::::::S:::T::S::AS:::::ND:L:::::::: consensus VIDAMQAADDDIVSVDPGADGLDDDADVPALCYYDRDGDCSDEVGPRSECRTCMVETDEH #oth 211121232133121211123232111111111111311211121111111112111211 HQ1130A ------------------------------------------------------------ pNG7318 I:::L:DL:::::::::::E:VE::::::::::::::::::::::::::::::::::E:: HVO_B0235 :::::::V::EV::::::::S::E::::::::::::G::A:::I:::::::::::::::: Hbo3082 ::::::::S:QT:T:S::::V:H:::::::::::::E::::::::::::::::I:::::: consensus GLVPSCSFPAEDGLRVRTDTPDAEESRSVNLDLVLSNHNLRCTTCNGNGRCELQETAISE #oth 121111111121112131113212121111111111111111111111111111221222 HQ1130A ------------------------------------------------------------ pNG7318 ::::::::::::::S:S::::::::A::::::::::::::::::::::::::::DA:::: HVO_B0235 :V::::::::T:::::E:::SA:::::::::::::::::::::::::::::::::::V:: Hbo3082 ::::::::::::::::::::V::A::::::::::::::::::::::::::::::::::GA consensus GVDHPRYGVFDDRAEYEPLDDTSSFIQIDRNKCILCNRCVEACNDVQVEGVLRIEGSGED #oth 212111111112132111211211111111111111111122111111111111112121 HQ1130A ------------------------------------------------------------ pNG7318 :::::::::::E:DQ:::I:::::::::::::::::::::D:::::::::::::::H::: HVO_B0235 :::::::::::::S:::::::S:::::::::::::::::::G:::::::::::::::::: Hbo3082 D:E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P: consensus TRIGFQSDAETMADSECVSCGHCATVCPTGSLTEKGIGGAGTLPLPGFTQRNSVGRVIEH #oth 111111111111211211111111111111221112121121111111111112131121 HQ1130A ------------------------------------------------------------ pNG7318 ::::::::::::H::::::::::::::::::::::::D::A::::::::::::I:K:::: HVO_B0235 :::::::::::::::D::::::::::::::A::::D:::::::::::::::::::::::: Hbo3082 :::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::T::D: consensus EDVETIDDTTAPNR--GFRPGDEGAA-----------ADRSGVARFMAQAKRRADDI--- #oth 12211211121111112332123231111111111113322.1.211221.11.312222 HQ1130A --------------::----------:::::::::::---N:::GY:QH::EQ:---::: pNG7318 ::A:::::::::::::::E:::PR:::::::::::::KSKQ:L:K:AS::::::G::AKD HVO_B0235 :::::L::::::::::SPD::SS:T:GGEAESGRAGREK::::::Y:::S::::S:FLET Hbo3082 :S:::::::P::::SF:V:D::::D:::::::::::::::::::::::N::::::::::: consensus YGRKAMLAGEHTAENIAANTLPEGRLFDIASAVGDYRLGKLNKAETTCGFCAVGCRFEMW #oth 112122121.11..31..2.2...1..11.221111..2211211....1.......111 HQ1130A -----LSNV:NI::D:::D:F:::K::E::Q:I::K::EE::V:D::::Y:::::::DLY pNG7318 ::K::F::::::::S:::::M:::::::::DI:S::::S:ID:E:::::::::::::::: HVO_B0235 :::::::::::::::L::R:::::::::V::L:S:::::N:D:::::::::::::::::: Hbo3082 -:::L::T::::::G:::::::::::::V:::::A:::::::R::::::::::::::::: consensus GKDGDSLGVVPVDDPDDAPANNFSTCVKGKFGHDFANSENRLTAPLIRNDDGEFEPASWD #oth 1111221112.21.112..1.11.........11.1..23.1.3..1.112.111211.1 HQ1130A SDGEEI:AAR:TE:-E:::I:GI:::::::::Y::I::DD::::::V:DES:Q:RE:T:: pNG7318 :::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::Q:V:E:::::::::L::TT:: HVO_B0235 ::::NAI::Q::::::N::::::::::::::::::::::::::K:::::E:::::A:::: Hbo3082 :::::::::::IE:::S::::::::::::::::E::::RK:::R::V:::A:::::T::E consensus EALDYVADRLREIQDEHGVDALGCLASSKGSNEEAYLVQKFARQVLGTKNIDNCARLCHS #oth 1..21..2113..1.2..2121111....11...1..11.......1.11....1..... HQ1130A :::SR:::G:G::R:T::GE::SVI::::AT:::N::MG:::::::Q:NS::::N::::: pNG7318 :::E:::E:FT::::A::I:S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0235 :::::::G:::::::::::::VS::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo3082 N:::::::::S:::::::::TV::::::::T::::::::::::::::::::::::::::: consensus STVAALQQTLGYGAMTNRINEDIGEADAYLISGSNTTESHPVLATRIKQNVRDGADLVVF #oth ......1..1....1111111.112..11.11......1......1...........2.. HQ1130A ::::::G::Y::::ASIS-TD:LEI::CI:LT::::::A::::::Q:::::::::::L:: pNG7318 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0235 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo3082 ::::::::::::::::::::::::H::::::::::::::::::::::::::::::::I:: consensus DPRKIGIAEHADQYTRTRPGYDVAWLNGLIRYIIEHDLHDEAFIERNTKGFEEVKEKVQA #oth ...1111..1.1...113....11.1..11..1..1..1.12.1111.11.11.221.11 HQ1130A :::E:QM::Y:S:::QVK::::AV:I::IT::::::::Y::T:VAEQ:T:::::Q:S:EE pNG7318 ::::V::::::::::::N:::::::::::::::::::::::::::::::N::::R::::: HVO_B0235 :::::::::::::::::T::::::::::::::L::::::::E:::::::::A:::R:::: Hbo3082 ::::V:::::::::::::::::::::::::::L::N::::T:::::::::::S::K:::: consensus FTPERVEELAGVSPDELASAAETLADADTVVFGWAMGMTQSSHGTENLIAMADLALTLGQ #oth ...11.1211...11.111...11.2.121....11.1.12......11...1..121.1 HQ1130A :::D:::KIT:::H::I:::::MI::::GC::::TL:L:EH::::::V::::N::AIT:N pNG7318 ::::K:K:::::::E::::::::::E::::::::::::::Q:::::::::::::::V::: HVO_B0235 ::::K::R:::::::::K:::::::::EN:::::::::::::::::::L::::::::::: Hbo3082 ::::::::::::::::::A::::::A:::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus VGKPGAGLSPFRGQNNVQGGGGDMGTLPGSLPGYQDPADDDVGEKFADAWGERPPAEPGL #oth 1..1...1.................1..111....11...1.11..111.111113.1.1 HQ1130A L::::::V:::::::::::::::::P::DNF:::::I:::::RA::E:::DCEIDP:Y:Y pNG7318 :::::::::::::::::::::::::::::::::::N::::E::::::::::::::K:::: HVO_B0235 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::EV::::::::::: Hbo3082 :::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::E:::: consensus KVPEMLSEAHEGNLRGMYIVGENPALSEPDIQHAAEALENLDFLVVQDIFMTETAEYADV #oth 1111.12.1111.11...11...1.....112..211..311..1...1.1....11... HQ1130A YTTQ:FL::A:D:I:::::I:::S:::::GVN::EDV:::::::::::L:V::::K:::: pNG7318 ::::::A:::A:::::::V::::::::::::::::::::D:E:::::::::::::::::: HVO_B0235 ::::::::::::::::::::::::::::::::::G::::S::::::::::::::::H::: Hbo3082 :::::F::I:::::K:::::::::::::::VT:::::::QI:::A:::::V::::::::: consensus ILPAATSPEKHGTFTNTERRIQRVRPSSEPPGKARQDWEITQALANRLGYDWDYDHPREV #oth 1...1111..1......1.11.1.12221.1.21.1..1.1.1..2.1.12.1..112.. HQ1130A V:::SSFV::T::::::D:TV:M:NKVM::K:DS:P::I:L:E::::M:RS::::STA:: pNG7318 V:::::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::::R:::::::::::::: HVO_B0235 ::::::::::::::::::::V::::A:A::::::::::::::E::A::::::G::::::: Hbo3082 ::::::::::::::::::::::::::::D:::E:::::::::::::::::E::::::K:: consensus MDEINSLAPIYGGVSYDRLESGDEHGLQWPCWDEDHPGTPYLYDYEEGNFNFDDGLARFV #oth .1..11.1......111.1221111........21.1..11..111211..111.11111 HQ1130A :::::::T:::::::HE:VK--ENG::::::::M:::::VR::ED:---::T:N:KVNLK pNG7318 ::::::::::::::T:::::::E:::::::::::::D::::::::D::::::E::K:::: HVO_B0235 ::::SE:T::::::::E::D:::::::::::::D::::::::::::G::::::::::::: Hbo3082 :A::S:::::::::T:::::N:::::::::::::T::::::::::::::::::::::::: consensus PADGGHPGELPDEEFPLTLTSGRVLYHWHTGQITRRVEGLMSHVGESFVEINPETAAQLG #oth 111111.1.2.1.11.1...1.....11...11.1.1..1.111111.1.12.2..1321 HQ1130A GVGYSE:A:T:T::Y:::::T:::::QY:::TM:H:E::I:QYNPSD::::::A:::GM: pNG7318 :::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::VH::::EK:: HVO_B0235 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::T:::E:D Hbo3082 :::::::::::::A::Y::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::I: consensus ISDGEYVRVESRRGDIVVKAQITDRVGPGTLFIPMHFAAGAVNKLT-QENFDPQAGIPEY #oth 121.11..1.....21..1.11.....2111.1.1..111.1.1..12.31..1111..1 HQ1130A ::G:DP::I:::::ET::P:::::::::ENV:V:I::TES:I:R::DE:HL::T:AT::: pNG7318 :A:::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::::::G:T:::T:::::: HVO_B0235 V:::::::::::::::::::TV:::::D:::::::::::::::::::::V:::::::::F Hbo3082 VE::::::::::::A:::::T::::::N::::::::::::::::::::::::::T::::: consensus KVSSVRVEPLGPDA-DEDVLRTPDAGGR--------SAATGDD #oth ...1....1111111.22.1111111232221111123311.. HQ1130A :::A:::::ADA::L:A::DTGQE:MSQSLSSDDRT:MS:::: pNG7318 ::::::::V:::ET:::T:::::::::KQIR:::::KRG:::: HVO_B0235 ::::::::::::::::P:::::::::AG:::::::::::R::: Hbo3082 ::::::::::::ET:::S::T:::V:::::::::::GET:R::