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4 genomes BUD2204 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0370

rrnAC2624

rrnAC3132

HVO_0899

HVO_B0217

-

Hmu2106

Hmu2115

- - -

HQ1619A

Pairwise sequence scores
Consensus score3462 Hmu2106 Hmu2115 HVO_B0217 rrnAC0370 rrnAC2624 rrnAC3132 HVO_0899 HQ1619A
1244Hmu2106 3192 1905 780 1025 966 945 871 838
1492Hmu2115 1905 3303 878 1165 1171 1149 1100 1056
1593HVO_B0217 780 878 3705 913 1133 1413 1363 1200
1819rrnAC0370 1025 1165 913 3447 1583 1578 1551 1499
2242rrnAC2624 966 1171 1133 1583 3431 2011 2024 1932
2869rrnAC3132 945 1149 1413 1578 2011 3636 2854 2719
2831HVO_0899 871 1100 1363 1551 2024 2854 3514 2865
2716HQ1619A 838 1056 1200 1499 1932 2719 2865 3567

501 symbols
consensus       ---------R-GGGSSV-RRRVLKSAGAAG-TAGLAGLAGCLGGG-G---G---------
#oth            1111223444655354461143.324.331142111.111.5.12213221221121111
Hmu2106         :::::::::-:------:---M:E:V:G::::LA:::---:::SD:-:::-:::::::::
Hmu2115         ::::MTTDD:G:C::RAT:::::E:L:GT::AVA:::---:::SD:-:::-:::::::::
HVO_B0217       :::::::MTDQPALTDES:::Y::AI:T::L::::::---:S:::G:NGG:GDGGGDSDG
rrnAC0370       :::::MDSG:N:::P::F::DL:R:I:::::L:::::---:G:SE:-:::-:::::::::
rrnAC2624       :::::::MGLEN::AA:D::S::QI::GV::S:::::::::Q::::-:::-:::::::::
rrnAC3132       MIDTDTVWNMPTN::::N::QL:::T:V:::V:::T:::::S::DG:DGG:D::::::::
HVO_0899        :::::::::-:------:---:::AT::V::::::::::::T:::D:G:G:DGGGG::::
HQ1619A         :::::::::MVRDND:LH::D:::A:::S-::V:I::::::A:::G:GDS:DGGGE::::

consensus       ----SG-GGDSSGDGGDDYPALGNFPIEGDSVTFGFNVPQSGPYAPEGQDELRGFELAVK
#oth            11112333353444233333331121331221121123131.41234.42132113..13
Hmu2106         :::::SSTAT:::::---------------:::IALTA:ET:H:::V:EH:RD::::::R
Hmu2115         ::::--:-:ATTETST:------------::::I:LSS:E::R:S:I:DH:R:::::::T
HVO_B0217       ENNAG:G:::D:SG::E::E:I::::P::N::SI:::G:T::ALG:D:::QEK::D::::
rrnAC0370       ::::--:-:VTD:::TPAPTPV::::VS::::::::::AS::A:STA:KQ:I:::K::::
rrnAC2624       ::::--:---:RAENTPEH:P:::Y::D::A::L::::::::T::A::R:::::Y::::T
rrnAC3132       ::::G:D:::GG::::::::S:::::V:::T:::::::::::::SS:::::::AY:::Q:
HVO_0899        :::::DG::GDG::::::::::::::::::TA:::::::::::::S::E::::AYQ::::
HQ1619A         ::::::SDDT::DSSSEE:::::::::D::TA:::::::::::::S:::::::AY::::Q

consensus       HLNEGGGWVDSQ-FDR-LSGDGVLGYTVETVVADTAGDADTARQNASRMIQRDDVIMISG
#oth            .1.1...2.24542441.1...21142115243..212222134334422431243243.
Hmu2106         :::::::I::DSEYGS:::::::::S::::A:L::E:SPA:TESKVRPRLDG:EFAAVF:
Hmu2115         :::::::L:GGDG:A::::::::::R::::A::::E:::S::ET:LQQRLGD:ELA:FT:
HVO_B0217       :::::::L::Y-:W::::::::IM::Q::PTK:::::S::::QD:IE::::::NIQFWT:
rrnAC0370       :I:N:::::T:EKYNSP:D:::L::KD::F::E::G:SS::::S::Q:LVDGEE:::LA:
rrnAC2624       :::::::::GQRS::V:::::::::K:::Y:T:::ETKP:V:TA::TE:VEQ:::::F::
rrnAC3132       :::N:::::::-::EA::::::::::::DS:NG:::T:::::::A:::::N::::V::::
HVO_0899        :::::::::::::::D:::::::::::IDH:DG:::T:::Q:::S::G::::::A:::::
HQ1619A         :::N:::::::::::D::::::::DF:IDY:DG:::T:::::::S::::::::NAV::::

consensus       GSSSSVAIAVQGLAQNEKVPFMACLTHSNDTTGKDCSRYSFREMFNAYMTAQALAPVLRS
#oth            .3112134141311253312113242232421.42131131123.124231311322262
Hmu2106         :VAG:::QTNRD::DEYET:YFVGSSTVDAL::SG::PHVY:HL::STTL:RS:VSE:A:
Hmu2115         :VAG::VTTHRD::DEHET:YFVGTSTL:QL::EN::PHVY::L::SRTL:R::V:EVV:
HVO_B0217       :M::T:TM:M:NV::R::::::GGNST:AGIS:EN::::Y:HPT:H:EIIGM:MGEAAP:
rrnAC0370       :T:::AGL:N:EV:AQNQ:IY::TMANT:SL::A::N:::::::::NH:A:E::::A:SD
rrnAC2624       :::::::::Q:EV::A::::Y:C::::::::::T::V:::::::::::::::::L:::KE
rrnAC3132       ::::A::::::::C:T:N:M::::::::::::::::A::G::::::::::G:::::::E:
HVO_0899        ::::A::::::::C:::::M::C:::::::::::::V:::::::::::::G::::::V:D
HQ1619A         ::::A::::::::C:::N:::::::::::::::::AA::G:::V::::::G::::::V:E

consensus       EYGSDASFFQIYADYSWGQTQQDSMRQFLTDV--GWEPVGSVATRLGTTDFSSYLSEAQS
#oth            4324543322223.342.2234422443425431214344332334.2112163244363
Hmu2106         DIT:QQ:T:HV:::APE:NDLFH:ISDVVSRRDLP:R:T:GI:V:P:::N:E:AIN:GTL
Hmu2115         DIDGAQF:::VTT:TIE:RDLKR:INRYA:ASDLDLR:I:TTTV:S:S:::ERA::::S:
HVO_B0217       VL:E:R:L:H::M:::Y::SNR:AA:KY::EQG:P::DA:GA:IAE:E::H:FQIQALED
rrnAC0370       :F:KN:NYVK:FQ:ND::::LR:D:DAA:GN:::::A::WDTTAQV::S:Y:Q:AADIK:
rrnAC2624       RF:RE:QYV::::::N::::MES:I:D:F:SS::::VELT:IP::::::NYEEP:KQ:RD
rrnAC3132       :::::N::Y:L::::::::::::::N:::SEI:::::E:D::P:P:::S:::::::::AN
HVO_0899        A::EGLQ:Y:L:::::::::::A::E::M:::A::::Q:E::::P:::S:Y:T:::::::
HQ1619A         :::::L::Y:L:::::::::::A::E::M:::A:::SQID::::P:::::::N:::G:::

consensus       SGADVLFLNHYGLDAANSLQQARDAGLDEDMEIVVPLYNRPMAQAAGGAIEGIYGTVAWD
#oth            42323231332.11111234324131231255222.332243225114332114.132.4
Hmu2106         :DVTLV::DVF::::V:AI:W:::T-:S::TTV:::YLTQSI:DLL:DRVA:::::TG:H
Hmu2115         NSV:IV::DLF::::V:AI:::KEI-:S::AV:::::LTQSVSDSL:ERV::V::::G:H
HVO_B0217       ::::T:YFSSF:NF::SG:A:L:::::TD:IDVII:HVSAFTLDPL:ADA::VL:MEP:N
rrnAC0370       VDF::IV:GLG::::V:A:RAF::E-FP:S-N::L:MAS:EI:ET:::::::VI:::::S
rrnAC2624       A::E:V::D::::::::::TT:QEI-:PDEVG::::::::IV::N:ST:LG:VV::::::
rrnAC3132       ::::::V:::::::G:::VS::V:::I:::::L:::::::::::::::S:::::::I:::
HVO_0899        ::::::I:::::::G:::M:::I:::I::::::I::::::::::::::::::::::::::
HQ1619A         ESP:::I:::::::G:::V:::V::::::E:::ML:::::::::::::S::D:F:::::T

consensus       EQIDNPLSNAFTQAFQDEYD--------RVPSGPAQLAYAQTLQYAAAVERAGTFYPPAV
#oth            5433232133.433124.12122322424412131242.413222.2.1.3..1.31331
Hmu2106         :DLGT::AGT:GE:Y:R::G::RSDSDAL:AP::::TV:::VVLF:H:A::::S:DAT:L
Hmu2115         :NL:T:::SK:GD:Y:N::S:GTMSTTAL::P::::NT:G:V:LW:S:A:A::::DAD::
HVO_B0217       PNA::EA:Q::VESY:A:::::::::::ET:NQSSLHT:ESMMV::::::E::::H::T:
rrnAC0370       RA:NS::::T:RET:RE::GSSTGSSKSAA:::A:HI::T:A::::S::::::::N:ID:
rrnAC2624       TSVSSD:::::KN::TA:HG::::::NAQR:::V:H::::::::::::::Q:::::::::
rrnAC3132       S::::EA::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::A:::::::::E:
HVO_0899        S::::TP:QE:::::R:::::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::E:
HQ1619A         A::::TP::E:::V:::::::::::::::I:::V::::::::::::::::::::::::E:

consensus       IRQLEDYEYD-IGMGSETMRACDHQAQRDVPVVRGLPESE-QSEGNFYELVNV--RDDVG
#oth            243..151121313.4232.3....23.521212.4443312151434223541133423
Hmu2106         RTE::GLG:A:A:A:TQE:::::::SI:S::I:::RAQT::-:ID:NL::RA:::KRGME
Hmu2115         RSE::GV::A:L:A::::::::::::M:A::::::STGTD:-:V::YF::L:G:::RN:E
HVO_B0217       V:T:::F:WS:LAW:DSAF:T::::VE:PWYM:Q:VGDDRAEEL:IRT:I:ET::T:PLV
rrnAC0370       :GA::GH::::A:L:PQ:L:::::::M:Q::::::KS:IQ:::Y:TY:D:IGE::PA::Q
rrnAC2624       ::E:::Q::S:V:L::Q:::R:::::::G::::E:::::::::L:R::D:LR:::TKA::
rrnAC3132       :::::::::SN::::Q:::::::::::::I::AQ:::A:::::D:::IDI:EITS:::::
HVO_0899        :K::::::::N:::::::::G::::::::::::Q:::A:::::::TYFNI::ITS:::L:
HQ1619A         :K:::G::::N::::Q:L:::::::::::::::::::::::::::S:::V:T:TS:::::

consensus       YACDEGPAAECELGD--YG--
#oth            13.232..1313115112211
Hmu2106         PG:E:P::SS:D:--::--::
Hmu2115         PG:::P::SA:::--::--::
HVO_B0217       :E:S:F::SN:AM::NE::DE
rrnAC0370       ::::S::::N:S::G::S-::
rrnAC2624       :D::G::::::::::::::D:
rrnAC3132       ::::S:::::::::E::::DE
HVO_0899        ::::A:::::::::S:::E::
HQ1619A         ::::A:::::A:::P:::E::