|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3462 | Hmu2106 | Hmu2115 | HVO_B0217 | rrnAC0370 | rrnAC2624 | rrnAC3132 | HVO_0899 | HQ1619A |
1244 | Hmu2106 | 3192 | 1905 | 780 | 1025 | 966 | 945 | 871 | 838 |
1492 | Hmu2115 | 1905 | 3303 | 878 | 1165 | 1171 | 1149 | 1100 | 1056 |
1593 | HVO_B0217 | 780 | 878 | 3705 | 913 | 1133 | 1413 | 1363 | 1200 |
1819 | rrnAC0370 | 1025 | 1165 | 913 | 3447 | 1583 | 1578 | 1551 | 1499 |
2242 | rrnAC2624 | 966 | 1171 | 1133 | 1583 | 3431 | 2011 | 2024 | 1932 |
2869 | rrnAC3132 | 945 | 1149 | 1413 | 1578 | 2011 | 3636 | 2854 | 2719 |
2831 | HVO_0899 | 871 | 1100 | 1363 | 1551 | 2024 | 2854 | 3514 | 2865 |
2716 | HQ1619A | 838 | 1056 | 1200 | 1499 | 1932 | 2719 | 2865 | 3567 |
501 symbols consensus ---------R-GGGSSV-RRRVLKSAGAAG-TAGLAGLAGCLGGG-G---G--------- #oth 1111223444655354461143.324.331142111.111.5.12213221221121111 Hmu2106 :::::::::-:------:---M:E:V:G::::LA:::---:::SD:-:::-::::::::: Hmu2115 ::::MTTDD:G:C::RAT:::::E:L:GT::AVA:::---:::SD:-:::-::::::::: HVO_B0217 :::::::MTDQPALTDES:::Y::AI:T::L::::::---:S:::G:NGG:GDGGGDSDG rrnAC0370 :::::MDSG:N:::P::F::DL:R:I:::::L:::::---:G:SE:-:::-::::::::: rrnAC2624 :::::::MGLEN::AA:D::S::QI::GV::S:::::::::Q::::-:::-::::::::: rrnAC3132 MIDTDTVWNMPTN::::N::QL:::T:V:::V:::T:::::S::DG:DGG:D:::::::: HVO_0899 :::::::::-:------:---:::AT::V::::::::::::T:::D:G:G:DGGGG:::: HQ1619A :::::::::MVRDND:LH::D:::A:::S-::V:I::::::A:::G:GDS:DGGGE:::: consensus ----SG-GGDSSGDGGDDYPALGNFPIEGDSVTFGFNVPQSGPYAPEGQDELRGFELAVK #oth 11112333353444233333331121331221121123131.41234.42132113..13 Hmu2106 :::::SSTAT:::::---------------:::IALTA:ET:H:::V:EH:RD::::::R Hmu2115 ::::--:-:ATTETST:------------::::I:LSS:E::R:S:I:DH:R:::::::T HVO_B0217 ENNAG:G:::D:SG::E::E:I::::P::N::SI:::G:T::ALG:D:::QEK::D:::: rrnAC0370 ::::--:-:VTD:::TPAPTPV::::VS::::::::::AS::A:STA:KQ:I:::K:::: rrnAC2624 ::::--:---:RAENTPEH:P:::Y::D::A::L::::::::T::A::R:::::Y::::T rrnAC3132 ::::G:D:::GG::::::::S:::::V:::T:::::::::::::SS:::::::AY:::Q: HVO_0899 :::::DG::GDG::::::::::::::::::TA:::::::::::::S::E::::AYQ:::: HQ1619A ::::::SDDT::DSSSEE:::::::::D::TA:::::::::::::S:::::::AY::::Q consensus HLNEGGGWVDSQ-FDR-LSGDGVLGYTVETVVADTAGDADTARQNASRMIQRDDVIMISG #oth .1.1...2.24542441.1...21142115243..212222134334422431243243. Hmu2106 :::::::I::DSEYGS:::::::::S::::A:L::E:SPA:TESKVRPRLDG:EFAAVF: Hmu2115 :::::::L:GGDG:A::::::::::R::::A::::E:::S::ET:LQQRLGD:ELA:FT: HVO_B0217 :::::::L::Y-:W::::::::IM::Q::PTK:::::S::::QD:IE::::::NIQFWT: rrnAC0370 :I:N:::::T:EKYNSP:D:::L::KD::F::E::G:SS::::S::Q:LVDGEE:::LA: rrnAC2624 :::::::::GQRS::V:::::::::K:::Y:T:::ETKP:V:TA::TE:VEQ:::::F:: rrnAC3132 :::N:::::::-::EA::::::::::::DS:NG:::T:::::::A:::::N::::V:::: HVO_0899 :::::::::::::::D:::::::::::IDH:DG:::T:::Q:::S::G::::::A::::: HQ1619A :::N:::::::::::D::::::::DF:IDY:DG:::T:::::::S::::::::NAV:::: consensus GSSSSVAIAVQGLAQNEKVPFMACLTHSNDTTGKDCSRYSFREMFNAYMTAQALAPVLRS #oth .3112134141311253312113242232421.42131131123.124231311322262 Hmu2106 :VAG:::QTNRD::DEYET:YFVGSSTVDAL::SG::PHVY:HL::STTL:RS:VSE:A: Hmu2115 :VAG::VTTHRD::DEHET:YFVGTSTL:QL::EN::PHVY::L::SRTL:R::V:EVV: HVO_B0217 :M::T:TM:M:NV::R::::::GGNST:AGIS:EN::::Y:HPT:H:EIIGM:MGEAAP: rrnAC0370 :T:::AGL:N:EV:AQNQ:IY::TMANT:SL::A::N:::::::::NH:A:E::::A:SD rrnAC2624 :::::::::Q:EV::A::::Y:C::::::::::T::V:::::::::::::::::L:::KE rrnAC3132 ::::A::::::::C:T:N:M::::::::::::::::A::G::::::::::G:::::::E: HVO_0899 ::::A::::::::C:::::M::C:::::::::::::V:::::::::::::G::::::V:D HQ1619A ::::A::::::::C:::N:::::::::::::::::AA::G:::V::::::G::::::V:E consensus EYGSDASFFQIYADYSWGQTQQDSMRQFLTDV--GWEPVGSVATRLGTTDFSSYLSEAQS #oth 4324543322223.342.2234422443425431214344332334.2112163244363 Hmu2106 DIT:QQ:T:HV:::APE:NDLFH:ISDVVSRRDLP:R:T:GI:V:P:::N:E:AIN:GTL Hmu2115 DIDGAQF:::VTT:TIE:RDLKR:INRYA:ASDLDLR:I:TTTV:S:S:::ERA::::S: HVO_B0217 VL:E:R:L:H::M:::Y::SNR:AA:KY::EQG:P::DA:GA:IAE:E::H:FQIQALED rrnAC0370 :F:KN:NYVK:FQ:ND::::LR:D:DAA:GN:::::A::WDTTAQV::S:Y:Q:AADIK: rrnAC2624 RF:RE:QYV::::::N::::MES:I:D:F:SS::::VELT:IP::::::NYEEP:KQ:RD rrnAC3132 :::::N::Y:L::::::::::::::N:::SEI:::::E:D::P:P:::S:::::::::AN HVO_0899 A::EGLQ:Y:L:::::::::::A::E::M:::A::::Q:E::::P:::S:Y:T::::::: HQ1619A :::::L::Y:L:::::::::::A::E::M:::A:::SQID::::P:::::::N:::G::: consensus SGADVLFLNHYGLDAANSLQQARDAGLDEDMEIVVPLYNRPMAQAAGGAIEGIYGTVAWD #oth 42323231332.11111234324131231255222.332243225114332114.132.4 Hmu2106 :DVTLV::DVF::::V:AI:W:::T-:S::TTV:::YLTQSI:DLL:DRVA:::::TG:H Hmu2115 NSV:IV::DLF::::V:AI:::KEI-:S::AV:::::LTQSVSDSL:ERV::V::::G:H HVO_B0217 ::::T:YFSSF:NF::SG:A:L:::::TD:IDVII:HVSAFTLDPL:ADA::VL:MEP:N rrnAC0370 VDF::IV:GLG::::V:A:RAF::E-FP:S-N::L:MAS:EI:ET:::::::VI:::::S rrnAC2624 A::E:V::D::::::::::TT:QEI-:PDEVG::::::::IV::N:ST:LG:VV:::::: rrnAC3132 ::::::V:::::::G:::VS::V:::I:::::L:::::::::::::::S:::::::I::: HVO_0899 ::::::I:::::::G:::M:::I:::I::::::I:::::::::::::::::::::::::: HQ1619A ESP:::I:::::::G:::V:::V::::::E:::ML:::::::::::::S::D:F:::::T consensus EQIDNPLSNAFTQAFQDEYD--------RVPSGPAQLAYAQTLQYAAAVERAGTFYPPAV #oth 5433232133.433124.12122322424412131242.413222.2.1.3..1.31331 Hmu2106 :DLGT::AGT:GE:Y:R::G::RSDSDAL:AP::::TV:::VVLF:H:A::::S:DAT:L Hmu2115 :NL:T:::SK:GD:Y:N::S:GTMSTTAL::P::::NT:G:V:LW:S:A:A::::DAD:: HVO_B0217 PNA::EA:Q::VESY:A:::::::::::ET:NQSSLHT:ESMMV::::::E::::H::T: rrnAC0370 RA:NS::::T:RET:RE::GSSTGSSKSAA:::A:HI::T:A::::S::::::::N:ID: rrnAC2624 TSVSSD:::::KN::TA:HG::::::NAQR:::V:H::::::::::::::Q::::::::: rrnAC3132 S::::EA::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::A:::::::::E: HVO_0899 S::::TP:QE:::::R:::::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::E: HQ1619A A::::TP::E:::V:::::::::::::::I:::V::::::::::::::::::::::::E: consensus IRQLEDYEYD-IGMGSETMRACDHQAQRDVPVVRGLPESE-QSEGNFYELVNV--RDDVG #oth 243..151121313.4232.3....23.521212.4443312151434223541133423 Hmu2106 RTE::GLG:A:A:A:TQE:::::::SI:S::I:::RAQT::-:ID:NL::RA:::KRGME Hmu2115 RSE::GV::A:L:A::::::::::::M:A::::::STGTD:-:V::YF::L:G:::RN:E HVO_B0217 V:T:::F:WS:LAW:DSAF:T::::VE:PWYM:Q:VGDDRAEEL:IRT:I:ET::T:PLV rrnAC0370 :GA::GH::::A:L:PQ:L:::::::M:Q::::::KS:IQ:::Y:TY:D:IGE::PA::Q rrnAC2624 ::E:::Q::S:V:L::Q:::R:::::::G::::E:::::::::L:R::D:LR:::TKA:: rrnAC3132 :::::::::SN::::Q:::::::::::::I::AQ:::A:::::D:::IDI:EITS::::: HVO_0899 :K::::::::N:::::::::G::::::::::::Q:::A:::::::TYFNI::ITS:::L: HQ1619A :K:::G::::N::::Q:L:::::::::::::::::::::::::::S:::V:T:TS::::: consensus YACDEGPAAECELGD--YG-- #oth 13.232..1313115112211 Hmu2106 PG:E:P::SS:D:--::--:: Hmu2115 PG:::P::SA:::--::--:: HVO_B0217 :E:S:F::SN:AM::NE::DE rrnAC0370 ::::S::::N:S::G::S-:: rrnAC2624 :D::G::::::::::::::D: rrnAC3132 ::::S:::::::::E::::DE HVO_0899 ::::A:::::::::S:::E:: HQ1619A ::::A:::::A:::P:::E::