4 genomes BUD2215 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - - HVO_B0188 Hbo2917 Hmu3288 - - - HQ2246A

Pairwise sequence scores
Consensus score	2209	HQ2246A	Hmu3288	Hbo2917	HVO_B0188
1460	HQ2246A	2463	1190	1166	1176
1520	Hmu3288	1190	2174	1256	1187
1735	Hbo2917	1166	1256	2360	1371
1695	HVO_B0188	1176	1187	1371	2268

355 symbols
consensus       -MSTRRAERS---------------LLARIRQA-ARDVANPQTERERERRRIVALCAPFL
#oth            222213313.111111112222222323133321323133.3...2.21...12.11..2
HQ2246A         :-MSTLD:S::::::::::::::::V:G:::ETRLGQ:IF:T:::G:K:::::::AL::F
Hmu3288         MST:TWF:L::::::::::::::::-------:::::TLT:E:::D:R::::LV::::::
Hbo2917         V:::::IA::YVGDALGRAVAVLEPF:S:LP:P:I:G:VL:::::::::::::G::::::
HVO_B0188       :::D:H::N:::::::::SLSTVRA:T::VVG::VET::::V::::::Y::::::::::A

consensus       ALAAVAALYPLAEMVRISVSEA-RYASVGFSLDAYRQLFT--------------------
#oth            3.1211112..1212.1...22131222.11221121.2211111111111111111111
HQ2246A         I::TFG:FI:::K:F::::::EFL::AQ:WTIEP:::::ASIAAFIPIIGTELSSTIAGG
Hmu3288         V::::::FV:::T:I:M:::AD::F:N::::VS:W:T:A:::::::::::::::::::::
Hbo2917         L:::::G::::::::::::::::K:V:E:::::::H::V:::::::::::::::::::::
HVO_B0188       ::VL::G::::S:V::::::T::Q:R:::::::::AT::G::::::::::::::::::::

consensus       ----DPYYRAVAFNSLWFSAGTTVVSVGLAVAIAHALEKYDLPFEDLLVTLVSFPISLPG
#oth            111111211121211..1222.121.12112131.111..2..2122.1112...11...
HQ2246A         TEAV:DV:G:TIW:::::::I:::S::I:GI:L::G::::E::DK:::I::I::::::::
Hmu3288         ::::::L::R::V:T:::A:A:SA:::A:G::VS::FA::S::::RV::SV:::::A:::
Hbo2917         ::::N::L::S:::T::::L::::::L:V:T:T::::::::::::GT::::L:::V::::
HVO_B0188       :::::::::R:::D:::LTT:::L:::::::P:::::::::::G::::::::::::::::

consensus       IVAAFMIIVLLGNTGLLTNAAAALSGQRPIDL-------ATATAVTGLFVAYVYSMIPRA
#oth            ..1...221.1.22.21.122.311.23121111111111212312...1112..12...
HQ2246A         ::::::M:::F:Q::F:::FF:V:T:AE:LNIQLTGQPSG:VL:I::::FG:L:::::::
Hmu3288         ::V:::VVA:::RQ::V:::V:FF:::G:::::::::::::::T::::::G::::LL:::
Hbo2917         ::::::::::::::::::::::WF:::SA:::::::::::V::G:V::::::C:::::::
HVO_B0188       :::::::L::F::N:VV:AV::::T:S::T::::::::::F:VS:P:::::F::::V:::

consensus       TLLLRGTYAEVNTDAEEAARALGATPARTFRYVTLPQIRPGIVGALILTFRTALAIFGTV
#oth            112...1....112..1..11...2.32..11....111..121.21.....1......1
HQ2246A         ::::::::::::::::::::::::::MQ:::::::::::::::::C::::::::::::::
Hmu3288         :MV:::::::::::::Q:::::::D:L:::Y:::::E::::::A::L:::::::::::::
Hbo2917         L:::::S::::::R::::::S:::S:::::YH:::::VK::LI::F::::::::::::::
HVO_B0188       ::I::::::::DSA:::::Q::::::FE::::::::::::::T:::::::::G::::::L

consensus       LVLQALRVWTLQLDQALSVGYDIQIAAAMATVYFAFTLLFTFLGLRYTSAEVGR-
#oth            1111313.2.222123221.11312.21212.2.2.2221.121....1.1.231
HQ2246A         :::KS:S:V:FRF::LVK:::ELN::S:L:G:F:I::V:::::S::::::::AQ:
Hmu3288         ::::G:N:A::::S:VI::::ES::::SIGL:::::I:AV::V:::::E:D:I:R
Hbo2917         :I:::M::::YEI:Y:::N:F:::L:::::::W:V:V:G::VF::::::::::L:
HVO_B0188       V:I:T:V::::::SRE:G::::V:V:G::::::::::F:::V:::::::::::I: