| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2579 | Hbo3005 | Hbo3022 | hla1115 | HVO_1603 | HQ2630A |
| 1140 | Hbo3005 | 2532 | 653 | 823 | 922 | 955 |
| 1329 | Hbo3022 | 653 | 2425 | 852 | 1125 | 1111 |
| 1674 | hla1115 | 823 | 852 | 2584 | 1388 | 1361 |
| 2138 | HVO_1603 | 922 | 1125 | 1388 | 2641 | 1875 |
| 2027 | HQ2630A | 955 | 1111 | 1361 | 1875 | 2720 |
366 symbols consensus -------RNAGVSRRRFLAAAGAAATAGL---AGCLGGRGGS------GIDELNVAYMPI #oth 112233324243111331212.32212122122113234222111122122213.122.1 Hbo3005 :::::::-M:T::::ETI:::::----::AALS::TTVL:SG::::QENSEQ:H:GWV:: Hbo3022 :::::::----------:TGG:S------:::----------::::::N::T:::::K:V hla1115 ::::MYE::::A:::S::::::G:::V:::::::::::DD:-:::::::LN::T::H::: HVO_1603 ::MTEAP:STSI::::::QGS:L:::::::::::::::S::::::::::L:::::::::: HQ2630A MSNRQDSDQTY:::::V:Q:S::VT:::IGAF:::S:T::::TGASNS::E:IR:::::: consensus YPDLQYFVMEEEGYFDELDAEVSGTEFSD-GPSIVQASATGDIDVAMFGIVPAMIVMDKG #oth 1.22.321.32212122122322233.211.121.1.313..2.2211.11.11233121 Hbo3005 ::NV:H:::S:RD:YA:::::L:T::::S:::AA:K:F:A::L:IGF::VT:::VLT:N: Hbo3022 F:F::RHI:DQQ:F::::GPS:EQ:N:A:K:LT::K:Y:D::::L:FM::T:VIKMKH:: hla1115 :::::WY:::G::::S:I:::IT:R::T:::::::::IGG::::::::::::::::I:RD HVO_1603 :::M:::::::::L::Q:SVP:::KK::::::::::::::::F::M:::::::::::::: HQ2630A :::M:::::K::::::AI::D:T:EV::::::::::::::::F::M:::::::::I:::: consensus IPAKVTAANIKNAMQILATDEFASLWE--AHGADAFAQFEAENGRKFRFGTFPPGSVPDI #oth 1122112..22121422.312.233211143.21..1423123.211211.1.3...111 Hbo3005 VD:D:LV::S::GFKMI:::G::DRYD::DD:G:::QSYT:DH:T:PIW::A:D:::::: Hbo3022 ::G::::::H::GFVAM:HE::V::::::K::::::QK:REQ:::::::S:::K:::AY: hla1115 :::Q::::::REP:G:M:EES:HETF::::E:G::::TWAE:::GP:::::::Q:::::V HVO_1603 ::::I::::::::::::::::::A:::::E::S::::E::::K::::T:::::::::::: HQ2630A ::S:I:G:::Q:::E:::R:S:::I::NAQS::E::::::::R::::T:::::::::::: consensus LLRYWLQEDLGVDPE--EDVEIKALGGAAAVRQALLSGNIDGTSIMEPVPTVAQENDAPF #oth 121..13242123131132.313422112213.12223321..211..21.333331222 Hbo3005 IT:::IER::EAGAT::T::VN::KVPP:KTP::AQ::D:V::TVQ::YA:LVA:M:G-Y Hbo3022 :VQ:::R:E:::S:-::DV:::ET::::GP:::S::T::A:::F::::I::AL:LK:::: hla1115 ::::::::-I:::::SN:N:::IEIN::S::W::IANDE::::::::::::I:::EGSSV HVO_1603 :::::I:NT::L::::::::N::G:::::::Q:::::N:V::::::::::::IDA::::: HQ2630A ::::::T:IV::E:G::S::S:TP::::GP:::::::SR::::::::::::::SM::::Y consensus QQIAWAGDFMPGQPAAVTLMHDRLR-DNPDLAQQFVEQHQRATNFIADNPDTAAQHASTV #oth 3413111321111.22.2112121231232113411.2.21..322422.121.321232 Hbo3005 R::E:S:TVL:DH:VT:AFVANSV-:-SNE:KRG:::::I::::AVY:D:TG:::D:AA: Hbo3022 EWLT:S:E::S:::GG:MF:::::WK:S:::::SI::K:V:::QL:NNK:::::KAV:QT hla1115 TMLRT:AQIL::::::::::S:AV::-DSP::V::::::V:::D::DE:::AT:G:VESG HVO_1603 :P:::::::::::::::::::::::Q::R:::TE:::L::Q::::V:::::::::::::: HQ2630A :S:::::::::::::::::::::::S:::EV::T:I:::::::A:AKE::::::A::::: consensus IGES-LPVETARRALDSKASNFITDPHEIADGAEIFSDFAANLGQIDAQLSNDEIFDFSV #oth 1.12211333.22.32121121211.22.23223312222243.21243223332.1322 Hbo3005 L:--::DEAL:E::MQ:::AA:LS:::::TSQS:TM:K:V:EV:N::GAM:AA:L::V:: Hbo3022 L::K:::LKV:KK:VR:::::Y:SN:T:::::TQL:V:EMKS::::KQTVETGT::EP:L hla1115 ::--:M:ADR:::::::PL:::V:::R::TEATPV::E::::N::::E::::EA::::E: HVO_1603 ::::A:::::::A::::P::D::::::D:EG:::::A:Y:QT::KTE:::TV::M::YGI HQ2630A ::::V:::::::::I:AR::D::::::N:::::K:::EY::QA:K::SV::::QL::::: consensus YDSV-- #oth 112121 Hbo3005 ::T:A: Hbo3022 HRE:SQ hla1115 :::L:: HVO_1603 :::L:: HQ2630A ::::::