|
Pairwise sequence scores | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2092 | Hbo3023 | hla1497 | Hbo3004 | HVO_1602 | HQ2631A |
1196 | Hbo3023 | 1981 | 867 | 814 | 909 | 983 |
1373 | hla1497 | 867 | 2003 | 817 | 1050 | 996 |
1218 | Hbo3004 | 814 | 817 | 2107 | 1032 | 1047 |
1614 | HVO_1602 | 909 | 1050 | 1032 | 2150 | 1348 |
1535 | HQ2631A | 983 | 996 | 1047 | 1348 | 2246 |
302 symbols consensus MAT----EFD-DAVRSGLALGRRADDARLL----GF-------RIGRGVAGLAGFLAVWH #oth 1232122323122232.343343234422233331233311112222133.443.122.2 Hbo3023 :::::::::::---:G:ESD:S::SS::QMLFGG::ERK::::::S:::L:TGC:::L:W hla1497 :::DTGR:::G:EL::::G:---D:PR:::::::--:::::::---::L::VV::VV::: Hbo3004 :SL::::RTR:P::E:::NV::K::VNQSV::::--:::::::---L:AI::TS:::::W HVO_1602 ---::::MSN::E:G::V::SETEA:E:::DRLA::SSE:::::A:LA:::F:::::::: HQ2631A :SVETPTDSE:P::PT:DRNQD:DEETGSVETTQ:LFGDIDPAS::Y:IV:SSI:VTI:Q consensus LAA-LTQPTYLLPSPVEVGAAFVTELTAGA-LSLP-TG-TVP-TRLTTALAQSLLHYVPG #oth 112122222.1..2.32.24.133.212323222132132223212324.31122.22.. Hbo3023 ::G:R:::S::::T:P:::L:LW::::S:E:----:--:---:--:FVH:G::::::::: hla1497 :IS::::AA:V:::::A::D::AE:FAS:T:----:--:---:--M::::WS:IR:WI:: Hbo3004 :::A:VE::::::G:LP:LS:L:::V:TT:P::::V::G::ELP:AM:R:::TS::L::: HVO_1602 V::::F::::::::::::L::::V::::P:S::I:F::AEL:A:::LVK:V:::Y::::: HQ2631A V::AAVDQ:::::::I::AT::II::::S:TFT::IA:I:::M::::AN::::::::L:: consensus LVVGTTLGVAAGIAMGWSGRLDDAATPVTRILRPIPPLAWIGFAIIWFGIGHAGAAFIVA #oth 212.331.232.213112222.3241.22.4...1.1..1.2..12.2.21.4..1..12 Hbo3023 V:::V:V:S:V:::V:::DA::::C::II::::::::::::V:::::::L::S::::::F hla1497 T::::G::::::V:FS:::L:::VTA:LV:T:::V::::L:::::A::::N:::::::I: Hbo3004 :LA:AFV:NG::LVI:YAT:A:AI::::V:V:::::E::::A:::V::::::T::T:::: HVO_1602 :LI::S:::F:::::::NT:V:SVF:::::L:::::::::::::V::L:VN:Q::T:::: HQ2631A ::::S::::SL:L:::::::::N:L:::::F::::::::::V:::V:I::::G::::::G consensus IGAFWINFYAAYGGVEGVSEDLKEVAATLGVDDDLTMIRKVVLPAAMPSITTGIRTSIGQ #oth 1.11..11.21.21.111133121.121..11212312.3111.112.3131.2..12.1 Hbo3023 ::::::T::N::S:::SA:RE:M:::E:::::T:WRL::R::::D:T:ELL::L:::V:: hla1497 V:::::::::S::A::::::::LD:GR::::RG::D:V:SI::::S::G:::::::GL:R Hbo3004 :::L:::Y::::S::R::RDGY:::::S::IRTHVG:L:Y:I::::S:A:VN:F:::::R HVO_1602 ::S::::::S::::::::::::::::::::::::W:::::::I:::S:::M::::::::: HQ2631A :::::::::N::A::::::TH::::::S:::::::::::::II::::::::::L:::::: consensus CWMIVVAAELFGAPGVGYEILNAANNLAMDVSIAYMLVISLVFLVSDGAFRAVERRVLEW #oth .1.2.111.11121.1.3211122211332322112222.3221311241222221323. Hbo3023 :::M:I:::::::::S:TRL:RV-------QT:SLRSEV:PIC:R:APC:---------: hla1497 :::L:::S:I::V::::R:::R:S:::LV:KV:::I::L::M::LV:V:::::Q::::V: Hbo3004 :L::::G::::::::::::::::S:::D:AR:M::::L::A:YICV::GYA:L:S:WFA: HVO_1602 ::::::::::IVGV::::::::T:Q:::::::V:::::::I:::::::L::R:::::::: HQ2631A :::::::::::::::::FQ:I:::Q:::T:::V:::V:::::::::::V::R::::L::: consensus RA #oth 23 Hbo3023 -- hla1497 :: Hbo3004 HP HVO_1602 :: HQ2631A :V