Home |  Text search
4 genomes BUD2248 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_1602

Hbo3004

Hbo3023

- -

hla1497

-

HQ2631A

Pairwise sequence scores
Consensus score2092 Hbo3023 hla1497 Hbo3004 HVO_1602 HQ2631A
1196Hbo3023 1981 867 814 909 983
1373hla1497 867 2003 817 1050 996
1218Hbo3004 814 817 2107 1032 1047
1614HVO_1602 909 1050 1032 2150 1348
1535HQ2631A 983 996 1047 1348 2246

302 symbols
consensus       MAT----EFD-DAVRSGLALGRRADDARLL----GF-------RIGRGVAGLAGFLAVWH
#oth            1232122323122232.343343234422233331233311112222133.443.122.2
Hbo3023         :::::::::::---:G:ESD:S::SS::QMLFGG::ERK::::::S:::L:TGC:::L:W
hla1497         :::DTGR:::G:EL::::G:---D:PR:::::::--:::::::---::L::VV::VV:::
Hbo3004         :SL::::RTR:P::E:::NV::K::VNQSV::::--:::::::---L:AI::TS:::::W
HVO_1602        ---::::MSN::E:G::V::SETEA:E:::DRLA::SSE:::::A:LA:::F::::::::
HQ2631A         :SVETPTDSE:P::PT:DRNQD:DEETGSVETTQ:LFGDIDPAS::Y:IV:SSI:VTI:Q

consensus       LAA-LTQPTYLLPSPVEVGAAFVTELTAGA-LSLP-TG-TVP-TRLTTALAQSLLHYVPG
#oth            112122222.1..2.32.24.133.212323222132132223212324.31122.22..
Hbo3023         ::G:R:::S::::T:P:::L:LW::::S:E:----:--:---:--:FVH:G:::::::::
hla1497         :IS::::AA:V:::::A::D::AE:FAS:T:----:--:---:--M::::WS:IR:WI::
Hbo3004         :::A:VE::::::G:LP:LS:L:::V:TT:P::::V::G::ELP:AM:R:::TS::L:::
HVO_1602        V::::F::::::::::::L::::V::::P:S::I:F::AEL:A:::LVK:V:::Y:::::
HQ2631A         V::AAVDQ:::::::I::AT::II::::S:TFT::IA:I:::M::::AN::::::::L::

consensus       LVVGTTLGVAAGIAMGWSGRLDDAATPVTRILRPIPPLAWIGFAIIWFGIGHAGAAFIVA
#oth            212.331.232.213112222.3241.22.4...1.1..1.2..12.2.21.4..1..12
Hbo3023         V:::V:V:S:V:::V:::DA::::C::II::::::::::::V:::::::L::S::::::F
hla1497         T::::G::::::V:FS:::L:::VTA:LV:T:::V::::L:::::A::::N:::::::I:
Hbo3004         :LA:AFV:NG::LVI:YAT:A:AI::::V:V:::::E::::A:::V::::::T::T::::
HVO_1602        :LI::S:::F:::::::NT:V:SVF:::::L:::::::::::::V::L:VN:Q::T::::
HQ2631A         ::::S::::SL:L:::::::::N:L:::::F::::::::::V:::V:I::::G::::::G

consensus       IGAFWINFYAAYGGVEGVSEDLKEVAATLGVDDDLTMIRKVVLPAAMPSITTGIRTSIGQ
#oth            1.11..11.21.21.111133121.121..11212312.3111.112.3131.2..12.1
Hbo3023         ::::::T::N::S:::SA:RE:M:::E:::::T:WRL::R::::D:T:ELL::L:::V::
hla1497         V:::::::::S::A::::::::LD:GR::::RG::D:V:SI::::S::G:::::::GL:R
Hbo3004         :::L:::Y::::S::R::RDGY:::::S::IRTHVG:L:Y:I::::S:A:VN:F:::::R
HVO_1602        ::S::::::S::::::::::::::::::::::::W:::::::I:::S:::M:::::::::
HQ2631A         :::::::::N::A::::::TH::::::S:::::::::::::II::::::::::L::::::

consensus       CWMIVVAAELFGAPGVGYEILNAANNLAMDVSIAYMLVISLVFLVSDGAFRAVERRVLEW
#oth            .1.2.111.11121.1.3211122211332322112222.3221311241222221323.
Hbo3023         :::M:I:::::::::S:TRL:RV-------QT:SLRSEV:PIC:R:APC:---------:
hla1497         :::L:::S:I::V::::R:::R:S:::LV:KV:::I::L::M::LV:V:::::Q::::V:
Hbo3004         :L::::G::::::::::::::::S:::D:AR:M::::L::A:YICV::GYA:L:S:WFA:
HVO_1602        ::::::::::IVGV::::::::T:Q:::::::V:::::::I:::::::L::R::::::::
HQ2631A         :::::::::::::::::FQ:I:::Q:::T:::V:::V:::::::::::V::R::::L:::

consensus       RA
#oth            23
Hbo3023         --
hla1497         ::
Hbo3004         HP
HVO_1602        ::
HQ2631A         :V