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| Pairwise sequence scores | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2184 | HQ1588A | hla1148 | HVO_1023 | Hbo0520 |
| 1049 | HQ1588A | 2501 | 634 | 559 | 705 |
| 1336 | hla1148 | 634 | 2204 | 821 | 905 |
| 1355 | HVO_1023 | 559 | 821 | 2059 | 1020 |
| 1509 | Hbo0520 | 705 | 905 | 1020 | 2453 |
389 symbols consensus MSDRRD-RD---DDLADLLDDLNDTLSELRAELRDERDRNRG--S----DRRERDRRGRG #oth ..2.22221111..1222.11.321.22.23211112323222212222112212.1232 HQ1588A ::::KPENQDDT::::V::::::T:::A:EEAVD::QQSSSSRS:QTSR::NSAS:DSSV hla1148 ::S:D:R::::::::EER::E:E:V:::::RD::E-------::-::::--T::::::-- HVO_1023 :::::-::::::::IL:V::E:G:::D::G::::E:::::::::-::::--:A::::VT: Hbo0520 ::E::::P:::::::::::A::DR::GD::H::::-:E:G::SR:ESED:::::R::::: consensus DRR-------R--DR----------------RP-PRPPSFGEVLRFTEEYTIPTVIAVLE #oth 21122222221221121111111111111111111111221112....2..1.11.12.. HQ1588A Q::DGAQTDN:SE:-::::::::::::::::--:DGGS:I:N:F:::::::L:AL:SI:: hla1148 ---:::::::-::--::::::::::::::::-::::::RLS:LV::::Q::::::::L:: HVO_1023 :--:::::::-::::F::::::::::::::::::::::T:::::::::S::::::::::: Hbo0520 :::RRDEPSE:EA::YGYRRRDDSDRSRGRD::L::::::S:::::::::::::::S::: consensus TTIASLELLRGVLRLADPERSAF--DD------RRGATAARLGMRRVGREALSGLDRALD #oth 1..3....11221.12..1113122121111112123233.222322121.21.11.1.1 HQ1588A :::E::::::::::FV:::Q:::RDRSQTQNRR:::KSPR:DPVST:::::::::::::S hla1148 :::K::::VQ:T::::::G::L-:::E::::::-T::ATD:::DV:D:AS:--::S:S:S HVO_1023 A:::::::::RLM::S::G:AM-::::::::::A:TE:E::--::N:PKS:V::V::::: Hbo0520 :::R:::::QS::::::::::V:DA::::::::::RS::E::::T:M:::::::V::::: consensus ELRNALS---EADLPSDAESRDIIADARDLAAEIEARIDEAERERDAARRRRREDR---- #oth 11231.1111221..22222.12331..1.32.221.131221222231113.2212222 HQ1588A :IEET:AADNDQS::::RIP::LL::::::S::VAD:LGDVQNRP:--:::Q:DT:ELPR hla1148 :::T:::::::::::EE:A::S::G:::::T:::::::::GR::A:::::G::---:::: HVO_1023 ::::::::::::::::NP:A::VMDR::S::D:LD::LS::::::T:RE::W:::-:::: Hbo0520 D:GD::::::--:::P:::::::VT:::::MG:::D::E::::Q:ERS:YGY::::GESG consensus DRTDE--RQGRDDARDSNR--GDRDSRGAVRIDVAPPRIDVNNEAGENGRADDSDDD--- #oth 2.112222221123121132222.222222322232122123313131133212311111 HQ1588A N:P:DTT::E:QRSQ:::NTAEQ:QNE:::T:::DA::KTA::DD:::KSST:THS:VTM hla1148 ::::-::--:::ET:TT:EVN::::D::-:::::TD:DA:REG:NDG::E:::::::::: HVO_1023 E::F:SEW:R:::::P:GD:::T:A::D:EPVGTG:V::::TE:::PD:GD:G:GS:::: Hbo0520 ::::::::S:GQ:G:::G:::R::::SRRDSATN::VT:::SD:R:-D::TE:PE:E::: consensus ----------APNVDVDAELESIKREVD---------------------GDAGDDTTDAD #oth 1111111112313...11..1..1221211111111111111111111121322221..1 HQ1588A MDNNAASNSESV::::ES::A:::DT:::::::::::::::::::::::P:ERFID:::: hla1148 :::::::::P::E:::ES:::::::QI:DREADTAADAGDETVDTEGAAA:::GE::::: HVO_1023 ::::::::::E:T::::::::::::::N:::::::::::::::::::::::D:::G:::- Hbo0520 ::::::::::T:Q::::::::::RK::R::::::::::::::::::::::EGA:::E::: consensus ADGA----------DDEPSDDNDDDRNS- #oth 3122111111111121122.223312312 HQ1588A ::NN::::::::::T:SSD:::SG::Q:E hla1148 H:S:DNGSSAGNER::::A:GD::::D:V HVO_1023 --::::::::::::G:::::R-------: Hbo0520 V::E:::::::::::E:T::::TT:N:-: