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| Pairwise sequence scores | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2982 | HQ1363A | HVO_0414 | Hbo1089 | hla0326 |
| 1277 | HQ1363A | 3414 | 841 | 892 | 904 |
| 1583 | HVO_0414 | 841 | 2892 | 1091 | 1047 |
| 2107 | Hbo1089 | 892 | 1091 | 2959 | 1808 |
| 2254 | hla0326 | 904 | 1047 | 1808 | 3259 |
482 symbols consensus VND---RADP-------RGRLPA-RTDRTPIDAAVAAADAVGFVAVGRRFDD----DLRY #oth 211222331211111112132232322322213.2222..21..21232212111132.. HQ1363A M::NTSLKSATDAGFGIN:PSVVVTPS:::VVT:IESH::I:::NINTTESEYPTASF:: HVO_0414 :--::::WS::::::::::G---:----DA:::::SER::::::::S:GA:P::::TS:: Hbo1089 ---:::MP:::::::::H:S:::PE::PAFL:S:L::::::::::::N::::::::G::: hla0326 :::GSDD::S::::::::D:::L::::L:::VE:::::::DA::T::D:::::::::::: consensus LTRFSGPDRAY-LAFVRAD---GEAVLCAPSLFTEQAER--------------EFAAC-- #oth ..2211222322112.32.11112221111122222122111111111111112232322 HQ1363A ::AI:SSNNS-:-:Y:HT::::SGP:::VQ:EA:KK:MQAEYRALSKQIEYSDSLI::DE HVO_0414 ::---:REFDCD:V:::V::::::TH:RV::TVEPPSLP::::::::::::::-----:: Hbo1089 :::::::::N::-:::Y::::::::I::::A:::::::::::::::::::::::::GT:: hla0326 :::::::::::A:VI:P::DAG:R::C::::::R:::::::::::::::::::::V:SAR consensus ---A---G--------VRTERVDDRPAGERAAAVLADL---G---ASDGTVLVPRSIPHD #oth 222122212222222212232112113.32..11132222221111132.1.1.311... HQ1363A ISA:SEP:DNRVNSDIAIPIYQ:S::I:VQ:::::DSARTTDAEC:DTQ:::::ST:::: HVO_0414 :::-:::-:::::::::ASV::::::P:TA::::::EH::::::::::::::A::TV::: Hbo1089 :::-:::-:::::::::::TD:G:-:T:I:::NT:S:::::::::::S::::::Q::::: hla0326 SRS:DDG:FHDGVARE::::::GN-H::::::::IR::LGGE:::D:EP:L:::P::::: consensus AAVHLEQAGYDLASTNAVAAARARKDDAERDAIRRVQRAAVAGMARAETILAAAEVEDAE #oth 1.21..2..12.2..3..23..23.121.1121221.2.121122.11221122113132 HQ1363A S:I:::::::T:Q::S::TN::VK::A:::Q::KI::S:GL:AI::I::QI:DMT:S:GQ HVO_0414 ::L:::S::::::::P::E::::V:::::::::EAA::::TR:VG::AA::S::T::E:D Hbo1089 ::::::::::::E::T:::D::LI:TES:I:CL::::::::R::R:::E::::::PM:D: hla0326 :::Y::R::NA::::::::R:::::T:::I:RL::::C:::::::::::M::ES::VEV: consensus ---D--------LRWQGAPLSTERLRRQVNAELAARGVRDAGATAIGAGPSAA-----DL #oth 222122222222.31211.11.11.11211.1..32..2211313121112221111122 HQ1363A :::-:::::::::LL::E:AT:RH:EQIAA::::H:::GSGDCVCVITTE::VSRLSRNI HVO_0414 DGD:NGDDEQSV:H:D:::::::::::::::T:::E::DA::::TVR:::RGD:::::-- Hbo1089 :::-:::::::::I::D:::::::::::::::::VY::::::N:V:::::TC:::::::: hla0326 SVE:TDTERRPA:::E::::T::::::A:::T::D:::::::D::::::::::::::::: consensus HYGGDDP--IRPGEPILIDISPRGPNGYRGDLARTFVVDSDGGWERRAHVAVEAAREAAL #oth 222132222111111122212....3..2.213..2..122.......12.111.11221 HQ1363A GS:VLSSTS:QS:V:VQ:GVC:::::::H:LVW::I::E:E::::::::I:::::L:T:I HVO_0414 -G::GE:VEL::::::VVSVG::::T::::A::::::::P:::::::::::CD:::KVS: Hbo1089 ::T:M:V::L::D:T::L:::::::H::Y:::S::Y::::N:::::::Y::::::LK:G: hla0326 ::V:::::::::::TV:::::::::D::::::T::::::G::::::::YL:::S:::::: consensus AEAEPGADANTVHREAAAELAAFGFDPNADEGEAGFTHDAG---HGIGLSLRERPSLDGA #oth 1111..33232223.12..11.2..212.2.12122121311111.1.2121.3.21223 HQ1363A ET::::ISPT::YN::L::::::::N:S:S::S:KKSE:INIMI::::::K::::YI:SE HVO_0414 :::D::D::GFLGS:LR::T:::::-SM:::----V:R:V::::G::::AA::D:P:::D Hbo1089 ::I::::H::EI::::::::T:H:::::::::::::::GT::::::V:I::H:G:::REP hla0326 ::I:::VPTK:::G::::::::Y::::::G::::::::G:::::::V:V::H:S:::S:: consensus RELRPGNVVTVEPGVYDPDQGGVRLCDLVVVTEDGYEVLG-------EYPRGLTPRAR-- #oth 31132.3.221221.22213.1.1.31111121..2221211111112212122.33321 HQ1363A MTMD::T::SIAL::FNIEY:::::::V:TIS:::VS:A:SRATSPDDMN:S:::TTNSY HVO_0414 :::VA:::LR:RAA:THA:H:R:E:T:VL::GD::PRL:::::::::GA:T::D:SRW:: Hbo1089 V::ES:M:F:::::::::E::::::EE::::::::::T:H:::::::::::SF::::D:: hla0326 G:::::H::::::::::::V:::::G:::::::::::::A::::::::::F:IV:NE:E: consensus -- #oth 11 HQ1363A SS HVO_0414 :: Hbo1089 :: hla0326 ::