4 genomes BUD2287 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - pNG7124 HVO_0148 - - - - NP2011A HQ3626A

Pairwise sequence scores
Consensus score	4398	pNG7124	HVO_0148	NP2011A	HQ3626A
3964	pNG7124	4393	3905	3400	3399
3977	HVO_0148	3905	4396	3448	3366
3761	NP2011A	3400	3448	4430	3621
3703	HQ3626A	3399	3366	3621	4376

570 symbols
consensus       MTRDIDREAYADLFGATEGDRVRLGDTELLAEIEEDHRTHGDEAVFGGGKTLRDGLGMAP
#oth            .11212..2.11.1.112..12..1..2.1.11.3.12.1...........1...1..11
pNG7124         ::::::::N::E:Y:P:T::K::::::::F:KV:::L:::::::::::::::::::::::
HVO_0148        ::K::::::::::Y:PS:::::::A::::F::V:T:L:::::::::::::::::::::::
NP2011A         ::KTLP::E:T::::::V:::I:::::S::::::H::A:Y:::::::::::M:::M::QS
HQ3626A         :S:KLS::::T::::::::::L:::::N:::K::K::G:Y:::::::::::M:::M::QS

consensus       GTTQADGALDWVFSNATIIDPILGIVAGDIGIRNGRIAGIGKAGNPDTMDGVDDELVVGP
#oth            11...1......21.1111..1..1211...1.1.3.1.1.............111.1..
pNG7124         :V:::E::::::LT:::::::::::::A:::::::E:::::::::::::::::--M::::
HVO_0148        DV::::::::::IT:::V:::V::V::::::::D:D:V:V:::::::::::::--M::::
NP2011A         :::::::::::::::VVVV::V:::RK::::V:::::V:V::::::::::::::::::::
HQ3626A         :::::E::::::::::V::::::::QK::::V:D:K:::::::::::::::::::::I::

consensus       STDTYPADGLIATAGGLDIHIHFNSAQLHEHALASGITTMLGGGYGGGATTCTTGPENIK
#oth            1..12..1.1...1.1....1.1..21.21.1.11.1...1............1..2.1.
pNG7124         :::V:::E:K:::::::::::::::::::::::SG:::::::::::::::::::::::V:
HVO_0148        A::V:::E:K:::::A::::V:W::::::::G::::::::::::::::::::::::Q:::
NP2011A         ::::V::::::::P::::::V::::P::VD::::::::::F::::::::::::P::N:V:
HQ3626A         ::::A::::::::P:::::::::::KE:F:::::::V:::F:::::::::::::::::::

consensus       RFLQAAEAWPVNVGFYGKGNASDPEPLIEQVEAGACGLKLHEDWGSTPAAIDTCLEVAED
#oth            ......111.......1...1.3.2112..1...1.11........1.22.1.1.21.12
pNG7124         ::::::::::::::::::::::::G::R::::::V:::::::::::::ET:N::::::::
HVO_0148        ::::::::::::::::::::::T:::::::::::::A:::::::::M::::::::D::::
NP2011A         ::::::DE::::::::::::S:Q::G:A:::::::::M::::::::::::::::::Y::S
HQ3626A         :::::::EY:::::::A:::S:G:D:I:::I:::::::::::::::::DV:::A:T::DE

consensus       EDVQVCIHTDTLNEAGFLENTFAAIDGRTIHLFHIEGAGGGHAPDILELVGEPNMLPSST
#oth            1.1...1.......1..1.2..3.1...11.1.............11.11.221......
pNG7124         ::::::M:::::::::::::::G:V::::M::::::::::::::::M:M:::::::::::
HVO_0148        ::::::M::::::::::V::::::V::::M::::::::::::::::M:::::::::::::
NP2011A         A:I:::::::::::S::V:E::D:::::A::T:::::::::::::V:::::HEH::::::
HQ3626A         ::::::::::::::S::::D::E::::::::T:::::::::::::V:::I:YDH::::::

consensus       NPSMPYTDNTFDEHLDMVMVCHHLNPDVPEDVAFAESRIRAETIAAEDVLHDMGAISMMT
#oth            .......2..............................1.1...........1.......
pNG7124         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::
HVO_0148        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::
NP2011A         :::::::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::
HQ3626A         :::::::V::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::::

consensus       SDSQAMGRMAEVISRTWQTASKMKSQRGPLPEDEGTDADNHRIKRYVAKYTINPAISAGI
#oth            1.......2..112....1.2...1...1..1.2..1...1.....2....1...11...
pNG7124         ::::::::I::::P::::::::::::::::::::::G:::::::::I::::V::::::::
HVO_0148        T:::::::Q::LV:::::A:::::::::::::::::G:::::::::L:::::::::::::
NP2011A         ::::::::::::::::::::D:::Q::::::::D::::::::::::::::::::::V:::
HQ3626A         :::::::::::::T::::::H:::::::A::A:R::::::A::::::::::::::KV:::

consensus       DDYVGSLEPGKLADIVLWDPAFFGIKPAMVIKGGFPVHSEMGEANGSLMTCEPILQRQRA
#oth            211..11....1..11..1.1.1.1..1221......1.1.............121.3.1
pNG7124         EEH::T:::::::::C::::::::V::::TF::::::::::::::::::::::::::E::
HVO_0148        :::::T::::::::V:::::::::V::::IF:::::::::::::::::::::::::::::
NP2011A         ::::::I:::::::::::E::::::::KT::::::::Y:Q:::::::::::::VEM:P::
HQ3626A         NE:::::::::M::::::E:E:Y::::KY::::::::::::::::::::::::VM::S:M

consensus       GAVGKAKHAISLSFVSPAAAEADIGDAYGLDSRVRPVEGTRTPGKADMLYNDYCPDDIDI
#oth            ..2.1...11.21...21.211111121..111.1.12.1.211.3..21.2.1.11.11
pNG7124         ::::::::::::::::::::::G:DEE:::::::V:I::A:::::D::V::S::::::EV
HVO_0148        ::D:::::GL::::::::::DN:V:E::::::::V::G:::::::E:::::::::::::V
NP2011A         ::M:N:::GL:VT:::GT:H::GV:::::::TP::::D:::SVR::::::::::::::::
HQ3626A         :::::::::::TT:::K::Y:N::::QI::E::::::::::DV::N::RH:E:A:EN:::

consensus       DPQTFEVAVDGEHVTCEPASELPLAQRYHL
#oth            .11....31...1.....12.....1..3.
pNG7124         ::E::::R::::::::::S:::::::::L:
HVO_0148        ::E::::E::::L:::::::::::::::T:
NP2011A         :A:::::SI::::::::::D::::::::::
HQ3626A         :::::::::::::::::::E:::::K::S: