3 genomes BUD2312 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG5174 pNG3011 HVO_A0247 HVO_A0358 - - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	3359	pNG3011	VNG5174	HVO_A0247	HVO_A0358
246	pNG3011	398	241	241	242
2908	VNG5174	241	3866	1118	2887
1569	HVO_A0247	241	1118	1583	1540
3312	HVO_A0358	242	2887	1540	3947

509 symbols
consensus       ------------AYRVA-LP-EYG-TR-NQLFT-GYNRY-VDGE-QP-DL--D-ERFGTA
#oth            111111111112111112112111211211111211111211112112112212111111
pNG3011         ::::::::::::-----:--:---:--:-----:-----:----:--:--::-:------
VNG5174         :::::::::::M:::::A::L:::E::V:::::S:::::V::::D::E::VN:I::::::
HVO_A0247       ::::::::::::-----:--:---:--:-----:-----:----:--:--::-:------
HVO_A0358       MTQSTPVEDERA:::::T::P:::T::I:::::R:::::I::::E::G::LT:L::::::

consensus       AFKE-VRA-AAE-PFVD-PG-LAVLATLSAICVK-HPKFEHA-PR-IQVLYDIRELY-NN
#oth            111121112111211112112111111111111121111111211211111111111211
pNG3011         ----:---:---:----:--:-------------:-------:--:-----------:--
VNG5174         ::::Q:::D:::E::::E::T:::::::::::::E:::::::S::N:::::::::::I::
HVO_A0247       ----:---:---:----:--:-------------:-------:--:-----------:--
HVO_A0358       ::::D:::N:::K::::K::I:::::::::::::A:::::::P::K:::::::::::V::

consensus       LASL-R--GDGSLQQDIA-VLY-K-PGEDGPHPGRVCTGI-EMP--GD-L-LEIPMAAAS
#oth            111121221111111111211121211111111111111121112211212111111111
pNG3011         ----:-::----------:---:-:---------------:---::--:-:---------
VNG5174         ::::I:AH::::::::::D:::S:E:::::::::::::::T:::EL::G:S:::::::::
HVO_A0247       ----:-::----------:---:-:---------------:---::--:-:---------
HVO_A0358       ::::L:EF::::::::::E:::A:D:::::::::::::::K:::KF::R:Y:::::::::

consensus       RKCLV----A--------E-LTRV--N-LYVPVGDFD-KYR-YA-RAFKKLLRVQE--LS
#oth            111112111122222222121111221211111111121112112111111111112211
pNG3011         -----::::-::::::::-:----::-:---------:---:--:-----------::--
VNG5174         :::::REDE:SAGSNDGE:I::::KD:K:::::::::S:::D::E:::::::::::DG::
HVO_A0247       -----::::-::::::::-:----::-:---------:---:--:-----------::--
HVO_A0358       :::::H::::ETETGEAG:L::::EN:C:::::::::T:::E::S:::::::::::KN::

consensus       -DQ-TWLTTNESAITERI-RF-ETGHHERIWR-W--GERTIRVLR-A--DAPD-V---GE
#oth            211211111111111111211211111111112122111111111212211112122211
pNG3011         :--:--------------:--:----------:-::---------:-::----:-:::--
VNG5174         D::L::::::::::::::E::L::::::::::N:DR:::::::::Q:LG::::D:AQK::
HVO_A0247       :--:--------------:--:----------:-::---------:-::----:-:::--
HVO_A0358       E::M::::::::::::::D::I::::::::::D:NP:::::::::D:IR::::E:VSL::

consensus       FH-AKEL--AVEAYDPEAGWKRDVCNRISSPRSLGNLLASQRDHRSLTIREHGNTNHYRI
#oth            112111122112211212212221222111121122211222212221122222212111
pNG3011         --:----::---------------------------------------------------
VNG5174         ::T::::YR::A:::A:DD:ESS:TDW::::S::AKT::DHES:SAV::DRD:RV:T:::
HVO_A0247       --:----::-::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0358       ::S::::FE:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R:::::::

consensus       QESSRGVQQIDVEAIEDLFELPCMANMAERLHEKKPVRKDLYNFARMVMWLPQYQDSDLE
#oth            222221223221221211111111111221111111111111111111111111111212
pNG3011         ------------------------------------------------------------
VNG5174         GRAGT:AE::E:RE:K:::::::::::EK::::::::::::::::::::::::::::S:D
HVO_A0247       ::::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0358       ::::::::PL::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       TIVADLKDVFSRWPWYDEQVTDYQIRYEFSNTIGGDTPLPMNCDNDDMQRYCIGQEQCPY
#oth            2112111211111111111212112111111112111111.....1.1..1...121...
pNG3011         ----------------------------------------:::::P::::H:::KSF:::
VNG5174         E::T:::::::::::::::E:E::V::::::::D:::::::::::::L:::::::D::::
HVO_A0247       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0358       :::::::G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       SIWGSLPFPDEMYDQLS-GAEGNGNQF--
#oth            1.11.....11..1.121132.2121111
pNG3011         N:YQ:::::ES:::::D:-DS:STG:YQA
VNG5174         :::::::::::::E:VEE:SA:PTE::::
HVO_A0247       :::::::::::::::::::::::::E:::
HVO_A0358       :::::::::::::::::::T:::::E:::