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3 genomes BUD2417 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7182

rrnAC3383

-

Hbo0141

Hmu2198

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score4727 Hbo0141 pNG7182 rrnAC3383 Hmu2198
2234Hbo0141 4606 1595 1562 1603
3254pNG7182 1595 4729 2452 2310
3425rrnAC3383 1562 2452 4758 2427
3289Hmu2198 1603 2310 2427 4650

656 symbols
consensus       --------KARKLLTLAVVALLVASGTATAAVTGSPDIDATVADDTVAPGEENTLDVVLV
#oth            111112222322212122132111.12121.1111..13222312112..113.1222..
Hbo0141         ::::::::MI::S:::FL:IAV:::TVPV::A:SN:::QTI:PQP::S::V:::VNFQ::
pNG7182         :::::MAP::Q:::L::::GIV:T::::::::V:::::V::LE::G:::::QK:VEIS::
rrnAC3383       MSEVSLRM:P:T::::::::::M:::::IG:::::::F:::FV:N::T::::T:::::::
Hmu2198         ::::::::------------:::T::L:::::::::::SVH:::::L:::::S:::::::

consensus       NSGDLDSGSARNGALNSEVTTARGTTVSVSSGNAPITVETNKQAVGSLPEGKT-EPIPFE
#oth            .21222111231122.111.2.2122.212211..12.313222112122.221123112
Hbo0141         :D--------P::PE:NAI:-:TNVR:R::D-::::N:L:ERLY:SK:AD::P:VMKTLR
pNG7182         :T:::Q::::Q:P:::::::A:K:L:::L:::D:::S:KNS:RSL:T:QV:PK:VTV:::
rrnAC3383       :::TI::::STQ:VQ::::::::::M:K:N::D:::::T::::::::V::::::::::::
Hmu2198         ::::::::::::P::::::::::::::::DN::::L::::GE:::::::::S:R::L::K

consensus       VSVDDDANPGTYRVQLTVEYKYASYASEESGARDENQNSRTIDVEIRIDNDARFDVTDVD
#oth            21.121131.113211212.2131231122.211233311232121313321212.1121
Hbo0141         MQ:PS:I:S::::IP:::T:E:------:::TG:SK:IT:SMG:SV:VQSGP::T:::TN
pNG7182         I:::E::DS::HEA::KLR::H::FI:::T::::::E:T::V::::DVT:::T:N:::I:
rrnAC3383       :::::S:S::D:T:PVI:::::T:::::SD:::A:TTT:ER:EL::E::D::A:::VN::
Hmu2198         :::P:::E::::D::V::::D:Y::V::A::S::RESE:::Y::QVK:EES::L::::::

consensus       STARVDGTGTVAVTVENTGSEAARDATVTLASNNADLTLGGGASASRFVDNWEPGEQRTF
#oth            1211..11..121.11.1.223.111221.2.3131111112.222.1123..21121.1
Hbo0141         :::T:::R::LT::MR:::Q:::S:::F::::::N:IA:::::K:T:::S:::K:ATK::
pNG7182         :N::::S:::::::::::::SS:::SA:::E:QSQ:::VS:::AT:::::K:::::V:::
rrnAC3383       :G::::S::::::::::::D:P::ESS:::K:T:SE::V::D::S:::I:T::A:::::L
Hmu2198         T:T::::::::EL::::N::AT:::::LS:::PS::::::QS:::E:Y:EQ:::D:::::

consensus       RYRVSAAEAAEPEPYQFELTVAFDDADGNRKTSAAQSVGVTPNPEQTFTVSSIDSSVAVG
#oth            3.122122312211.312121112231.312213331222213..12.2.2232.2.2.2
Hbo0141         E:DARLG:S:Q:GN:SL:G:::YK::S::S:::PSLT::MRAL::M::D::DVQ:::R:A
pNG7182         N::::::::::::::G:::S::::NE::L:TQ::G::IA:E:D:::R:S:VNSS:::::S
rrnAC3383       ::::G:SGDTRA:::::D:Q:D:::T::V::STT:S:L:I::::::::::E:T::D::::
Hmu2198         T::L:::QT::S:::P:T::ADYELGS:ESR::QPVT:E:::E:::E::::::::T:P::

consensus       DSGTYNVTLRNDGPLTVDDASVALASQNADITFGQSNSTSQYVGSWEPGEERTVSFDASA
#oth            11.2131111.1.12.232.2.312121221111113112221121..113112211121
Hbo0141         :::KIKG:IT:T::::AHS:V::FQ:NSPT---A:AVE:EYAI::L::N:STSF::TV:V
pNG7182         NT:::E:Q:::T::::::::::TF::R:::::::K:S::TA:::N:::::V:::RV::T:
rrnAC3383       ::::::::::::::V::SG:T:S::T::TA::::::E::::F::::::::T::::V::::
Hmu2198         :::D:T:::::::SE:LT::::Q:T:::::::::::::A::::EE::::A:::LT:::R:

consensus       SDDAERRSYALSANVNYDDPDGDAGQADDVSLSLR-PEPEQNFAVRNVDSTLQAGDDGTL
#oth            221.2322122213.3.12211123331112.2221122113.32322122.21.11.1.
Hbo0141         DSK:NPGPRQYGVQ:::RNG:::PV:S:T:D:PVTVG:SDAG:DI::LE:::RV:EE:::
pNG7182         :P:::D:::::::::Q:::HE::TSTY:::Q:::S::A:::::G:S:I:TS::::E::S:
rrnAC3383       ::::KTQ::::::S:S::::E::::V:::I::GI:::::::S:ELGD:E:::::::::::
Hmu2198         G::::::N:TVD:T:E::R::DS:THRQ:::::::::VA::T:::DT::AD:EV::::::

consensus       SATLTNTGDRTVENVVLAWESAQRNVSPKETQYAIGNLDAGESANFSFDVDVSDSARAGP
#oth            112.1..12121211.23121323122.2..1.11.2.11..11311.1111.21132.1
Hbo0141         :G::V::D:DP:T:A::RFNP:GQTIT:V::E::::R::P::ARE:::::E::S:SSG::
pNG7182         ::::::::T:D:::::I::::Q:STL::::::::V:::::::::::::G::::N::E::A
rrnAC3383       E:S:::::::::R::::N:::SHD::::::::::V:D:EP::::TV:::A::::N:N:::
Hmu2198         ::E:::::P::A:D::VV:A:E::::D:I::E:S::::::::::S:D::::I:::::S::

consensus       RQFDFQVRYRNDDDDRRTADTLEVRADVDGSADEFDVEIRNAAVAAGDSRELTVTITNTK
#oth            ...21223.112212112322211.3212223...21233123231.323222121..22
Hbo0141         :::N:::N::DE:NQQ::TNPI:::T:IGAKS:::E:TPVSN:Y:::E:G:FR:NV:::R
pNG7182         :::::G:S::D:N:::VV:E:::::ST::::Q::::I:MQ:STLGV:QD:SI:F::::::
rrnAC3383       :::::VAT:::SE::::ES::::I:QS::::::::I::TT::S:NV:G:ST:E:::::DA
Hmu2198         :::TL:T::T::::EQ::G:SMN:::::APER:::::A::S:N:S:::GT::::E:::A:

consensus       NQTLTDIEAKIFAESPISSSDDEAFIDELDPGESETIEFQISAGGAALAKTYPVSMDFQY
#oth            321.11.21.2.221.1.2111111121.311..2113131..113.13.2..122....
Hbo0141         EE:::::S::::P:::L:::NS::::E::E:::::::V:KL::S:D::::::::K:::::
pNG7182         DK:::S::G:A:VND:L::::::T::A::G:R::::VSV:L:::SN::D::::LNL::::
rrnAC3383       G:R:::::::L:::::::V:::Q:YV:S::Q:::T::::G:::S:::MT:S::::V::::
Hmu2198         ::::S::K:::::D::::AN:::::V:::S::::RE:T:S::::SS::S:P:::::::::

consensus       EEPDGDTRVSDTYRLPVEVTESSG-GGSPLTLIGGVALLAVAAVG--GYVRFRRQ-
#oth            1221.1132..1.32.12.1212.1.12..32121132122312.11.21211111
Hbo0141         :DSQ:E:TI::A:QV::D::::D::::L::----:LIA:VIV:L:AI:F:YY:::D
pNG7182         :T::::K::::::S::I:::DQ::S::T::W:::::G::::--:::::V:WYS:::
rrnAC3383       :::::::P:::::::::S::N:G:::S::::A:I::::V:AL:I:::::F:::--:
Hmu2198         D:A::::VT::::NI::::E::::::S:::V:::V:VV:I:::::::::::::--: