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3 genomes BUD2444 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_1580

HVO_1802

Hbo1683

Hbo2195

Hmu3110

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score2922 HVO_1580 Hbo2195 Hmu3110 HVO_1802 Hbo1683
1465HVO_1580 3066 1051 612 794 927
1531Hbo2195 1051 3847 766 966 913
1374Hmu3110 612 766 2927 912 922
1908HVO_1802 794 966 912 3012 1547
1848Hbo1683 927 913 922 1547 2807

542 symbols
consensus       --------RRAAALAVVLLVVLAGCSAPDP--------------P-T-GTEAPTAVDAAT
#oth            111112332244222112.12.1..32342111111111222221323323213213222
HVO_1580        VSPAADRGIAPL:::L::::::S::TSSS:::::::::::::::-:-:---S:PV::::L
Hbo2195         ::::::::M:IRIAL:AF:LL:::::GT::FAGEPSSEIAKTTV:S:EK:R::SPT::::
Hmu3110         ::::::MS:T::TVV::V::T:::::GLLV:::::::::PEDAA:TVSE::T::::ESQ:
HVO_1802        ::::::::M:GST:L:AV:::::::A::VS:::::::::::::::G:D::T:T::TS::S
Hbo1683         :::::MSA::SP:V:L:::L::S::L::FS::::::::::::::-:-::A:S:IP:GDE:

consensus       PT----------------------------------------------------------
#oth            321111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
HVO_1580        GA::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo2195         ::SEPATDRVNPWGHENVSVAVSADLGTYGYGTFHEEIRTALEYWNTRENTSYPVQYELT
Hmu3110         A:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1802        :-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1683         --::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       -------------PSADTSTERPAATST-T-SP--TA--S--------------------
#oth            1111111111111.2232321432233232312332233222222111111111111111
HVO_1580        :::::::::::::::::A:DGDNG:V:-:-:--::--::-::::::::::::::::::::
Hbo2195         NTTYDADIVVNVE:RVN:CNG:R::Y:FDYC:DVLS:ED:IDSQIDVSMTGRYDENETRQ
Hmu3110         ::::::::::::::T:-:E::T::S:P:A:P::TE::TP:::::::::::::::::::::
HVO_1802        ::::::::::::::TT:SA::S::::A:P:T::PS:TATVTPTAA:::::::::::::::
Hbo1683         ::::::::::::::::T::::QA-----:-:--::--::-::::::::::::::::::::

consensus       ------AAESATQNPATTAAP-DPGDNPWG-QEPVVVGVNAPADGGRDYAALVAEAIAYW
#oth            11111112322.342432441122333..1133212.313112222.122211431311.
HVO_1580        ::::::::VGG:GSS:SETR:A:TA::::::HA::::::D:::::-::::S::ES:VD::
Hbo2195         VAKRMF:GL:G:KDAEASVE::::NGT::PW:ST:T::I::S:G:N:::KPF:::T::::
Hmu3110         ::::::PT:T:::T:DD:LSS:---::::::::V:P:RI:DS::D::NTT::TLRT:D::
HVO_1802        ::::::PT::P:PE:T::FT::A::YG::::S:::::S:A::D::-:::::::S::T:F:
Hbo1683         ::::::::RT:::::S::::::-T:AS::::DD:I::A:SD:EHT:::WTP::RQ:A:::

consensus       EANAERYAEYEIDFEVRPDAADPDVEVRFVEDIPRC---DDGAADAAGCAPLLD--DGTQ
#oth            23.32313312431212213421122.32212114.11112344112...2212111233
HVO_1580        R:::SAV:-:DPA:V:::NSS::::T:SV::R:DG:G::::AG:::V:::::::GD:P:A
Hbo2195         :K:QDE:G::TT:::L::NEPS::::::I::S::N:GKN:NSTS::L:::SV::::::AH
Hmu3110         N::I:::TDF:YR:ALAE:PD:AR:::Q:R:S:D:::::::RETNV::::AY:H::E::R
HVO_1802        :G:DS::L:::::Y::DA::R:::LV:::TD:::V::::-S:LD:::::::Y:T::::W:
Hbo1683         :T:::Q::G:TVEY:::::::N::IV:E::D:V:D::::-:::E::::::::IT:::RR:

consensus       ADDPETVAVATRYSDDSTVATLKHEFGHLLGLTHDDAPA-DLMAERGRLYTLPRPNATER
#oth            23321114143232122224233..1..12..3.2121211113314432221321.111
HVO_1580        PTE:V::V::VG:D:ET:QMV::::::::::::::::D:FPVLS::VETTR::E:D:G::
Hbo2195         :S:T:V:RIMYDQ::E:I:Q:M:::::::Y::E:GEG:M:P::D:TY:SE::::::::::
Hmu3110         :R:L:VA::ES:G:NSGVL::TR::::::V::N:S:E:L:::::Q:---:EGDIRD::D:
HVO_1802        I:R::::Y:R:G:G:::::DIVA::L::T:::A:G:E::::::NAT:I::::::T::::K
Hbo1683         I:T::::SIQ::F:N::::LV:E:::::T::::::::::::V::S:SV:::T:Q::::::

consensus       AFPWRDRTLTVHVD-SNTNAGDPEQAREQVRHALDYYEGGADG-MPANLTFEYVDDPANA
#oth            22.1234223.211222332222332121121.22.113..2.32.4.11222111124.
HVO_1580        ES:F:E::VA::::L::VSP:ERATHEAEID:::S::::::::VA::::S::R:SN:EM:
Hbo2195         PL:::SN::S:Y::Y::ITDS:S::VEREI:D:T::::A::E:YV:G:::::::S:::E:
Hmu3110         ::::YGD::N:A:E:PD:ID:::TVV:::::::VE::DD::::TV:T:VSVVVS:::DF:
HVO_1802        ::::D:PNF:::I::-D:::S::DA:::::::::::F::::P::::D:::YT::::::D:
Hbo1683         ::::D:GEF::Y:::-SA::TKS:::::::Q:::::::R::E::::N::::TV:::AE::

consensus       DVTISFSDESPCAFAAGSCGIR---SGRDPDGDGALETYTRGRIVL-VDLDTDAVGWHVG
#oth            112232332221234212223222231413.2.222.3.243322213123322.1.11.
HVO_1580        :::L:V:-----::RD:GS:V:WRRT:V:A:D:A:::W::G:DL:VDA::APSL:D:Y::
Hbo2195         :I::R:YN----T::S:TGES:LSA::E:T:::::::F::T:T:YI:T:IYH:R::::::
Hmu3110         E:VVTNDS:RG:TVTD::G:::::::V:NL:T:ERA:L:::MVVCV:GPVGE::::::T:
HVO_1802        E:R:::A:S::::AG:A::A:A:::G:Y:::::::::::GSY:V::::::::E:::::::
Hbo1683         :IVVG:::::::SPD:A:::AT:::R:W::::::VV:::SNL::::::::::::::::T:

consensus       YWLGHLFGAESDADLPPPFRDADYAERRSEWWE---------------------------
#oth            121143211233312131.22222413.321.3111111111111111111111111111
HVO_1580        AG::Y::A:DER:::::::::G:P:DD:A--:RGLAGETAGNATTPAMTPRRTQEFPSVA
Hbo2195         AN::S:M::K:HS::::::DGS:--DN:DD-:N:::::::::::::::::::::::::::
Hmu3110         ::::TA::L::-GERAAV:Q::S:S:I:::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1802        ::TA:YL:::A:D:K:E:::N:T:G:::::::A:::::::::::::::::::::::::::
Hbo1683         :::AFG::::D::EK:D:::::S:R:::N:::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       --
#oth            11
HVO_1580        RE
Hbo2195         ::
Hmu3110         ::
HVO_1802        ::
Hbo1683         ::