|
Pairwise sequence scores | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2922 | HVO_1580 | Hbo2195 | Hmu3110 | HVO_1802 | Hbo1683 |
1465 | HVO_1580 | 3066 | 1051 | 612 | 794 | 927 |
1531 | Hbo2195 | 1051 | 3847 | 766 | 966 | 913 |
1374 | Hmu3110 | 612 | 766 | 2927 | 912 | 922 |
1908 | HVO_1802 | 794 | 966 | 912 | 3012 | 1547 |
1848 | Hbo1683 | 927 | 913 | 922 | 1547 | 2807 |
542 symbols consensus --------RRAAALAVVLLVVLAGCSAPDP--------------P-T-GTEAPTAVDAAT #oth 111112332244222112.12.1..32342111111111222221323323213213222 HVO_1580 VSPAADRGIAPL:::L::::::S::TSSS:::::::::::::::-:-:---S:PV::::L Hbo2195 ::::::::M:IRIAL:AF:LL:::::GT::FAGEPSSEIAKTTV:S:EK:R::SPT:::: Hmu3110 ::::::MS:T::TVV::V::T:::::GLLV:::::::::PEDAA:TVSE::T::::ESQ: HVO_1802 ::::::::M:GST:L:AV:::::::A::VS:::::::::::::::G:D::T:T::TS::S Hbo1683 :::::MSA::SP:V:L:::L::S::L::FS::::::::::::::-:-::A:S:IP:GDE: consensus PT---------------------------------------------------------- #oth 321111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 HVO_1580 GA:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2195 ::SEPATDRVNPWGHENVSVAVSADLGTYGYGTFHEEIRTALEYWNTRENTSYPVQYELT Hmu3110 A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1802 :-:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1683 --:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus -------------PSADTSTERPAATST-T-SP--TA--S-------------------- #oth 1111111111111.2232321432233232312332233222222111111111111111 HVO_1580 :::::::::::::::::A:DGDNG:V:-:-:--::--::-:::::::::::::::::::: Hbo2195 NTTYDADIVVNVE:RVN:CNG:R::Y:FDYC:DVLS:ED:IDSQIDVSMTGRYDENETRQ Hmu3110 ::::::::::::::T:-:E::T::S:P:A:P::TE::TP::::::::::::::::::::: HVO_1802 ::::::::::::::TT:SA::S::::A:P:T::PS:TATVTPTAA::::::::::::::: Hbo1683 ::::::::::::::::T::::QA-----:-:--::--::-:::::::::::::::::::: consensus ------AAESATQNPATTAAP-DPGDNPWG-QEPVVVGVNAPADGGRDYAALVAEAIAYW #oth 11111112322.342432441122333..1133212.313112222.122211431311. HVO_1580 ::::::::VGG:GSS:SETR:A:TA::::::HA::::::D:::::-::::S::ES:VD:: Hbo2195 VAKRMF:GL:G:KDAEASVE::::NGT::PW:ST:T::I::S:G:N:::KPF:::T:::: Hmu3110 ::::::PT:T:::T:DD:LSS:---::::::::V:P:RI:DS::D::NTT::TLRT:D:: HVO_1802 ::::::PT::P:PE:T::FT::A::YG::::S:::::S:A::D::-:::::::S::T:F: Hbo1683 ::::::::RT:::::S::::::-T:AS::::DD:I::A:SD:EHT:::WTP::RQ:A::: consensus EANAERYAEYEIDFEVRPDAADPDVEVRFVEDIPRC---DDGAADAAGCAPLLD--DGTQ #oth 23.32313312431212213421122.32212114.11112344112...2212111233 HVO_1580 R:::SAV:-:DPA:V:::NSS::::T:SV::R:DG:G::::AG:::V:::::::GD:P:A Hbo2195 :K:QDE:G::TT:::L::NEPS::::::I::S::N:GKN:NSTS::L:::SV::::::AH Hmu3110 N::I:::TDF:YR:ALAE:PD:AR:::Q:R:S:D:::::::RETNV::::AY:H::E::R HVO_1802 :G:DS::L:::::Y::DA::R:::LV:::TD:::V::::-S:LD:::::::Y:T::::W: Hbo1683 :T:::Q::G:TVEY:::::::N::IV:E::D:V:D::::-:::E::::::::IT:::RR: consensus ADDPETVAVATRYSDDSTVATLKHEFGHLLGLTHDDAPA-DLMAERGRLYTLPRPNATER #oth 23321114143232122224233..1..12..3.2121211113314432221321.111 HVO_1580 PTE:V::V::VG:D:ET:QMV::::::::::::::::D:FPVLS::VETTR::E:D:G:: Hbo2195 :S:T:V:RIMYDQ::E:I:Q:M:::::::Y::E:GEG:M:P::D:TY:SE:::::::::: Hmu3110 :R:L:VA::ES:G:NSGVL::TR::::::V::N:S:E:L:::::Q:---:EGDIRD::D: HVO_1802 I:R::::Y:R:G:G:::::DIVA::L::T:::A:G:E::::::NAT:I::::::T::::K Hbo1683 I:T::::SIQ::F:N::::LV:E:::::T::::::::::::V::S:SV:::T:Q:::::: consensus AFPWRDRTLTVHVD-SNTNAGDPEQAREQVRHALDYYEGGADG-MPANLTFEYVDDPANA #oth 22.1234223.211222332222332121121.22.113..2.32.4.11222111124. HVO_1580 ES:F:E::VA::::L::VSP:ERATHEAEID:::S::::::::VA::::S::R:SN:EM: Hbo2195 PL:::SN::S:Y::Y::ITDS:S::VEREI:D:T::::A::E:YV:G:::::::S:::E: Hmu3110 ::::YGD::N:A:E:PD:ID:::TVV:::::::VE::DD::::TV:T:VSVVVS:::DF: HVO_1802 ::::D:PNF:::I::-D:::S::DA:::::::::::F::::P::::D:::YT::::::D: Hbo1683 ::::D:GEF::Y:::-SA::TKS:::::::Q:::::::R::E::::N::::TV:::AE:: consensus DVTISFSDESPCAFAAGSCGIR---SGRDPDGDGALETYTRGRIVL-VDLDTDAVGWHVG #oth 112232332221234212223222231413.2.222.3.243322213123322.1.11. HVO_1580 :::L:V:-----::RD:GS:V:WRRT:V:A:D:A:::W::G:DL:VDA::APSL:D:Y:: Hbo2195 :I::R:YN----T::S:TGES:LSA::E:T:::::::F::T:T:YI:T:IYH:R:::::: Hmu3110 E:VVTNDS:RG:TVTD::G:::::::V:NL:T:ERA:L:::MVVCV:GPVGE::::::T: HVO_1802 E:R:::A:S::::AG:A::A:A:::G:Y:::::::::::GSY:V::::::::E::::::: Hbo1683 :IVVG:::::::SPD:A:::AT:::R:W::::::VV:::SNL::::::::::::::::T: consensus YWLGHLFGAESDADLPPPFRDADYAERRSEWWE--------------------------- #oth 121143211233312131.22222413.321.3111111111111111111111111111 HVO_1580 AG::Y::A:DER:::::::::G:P:DD:A--:RGLAGETAGNATTPAMTPRRTQEFPSVA Hbo2195 AN::S:M::K:HS::::::DGS:--DN:DD-:N::::::::::::::::::::::::::: Hmu3110 ::::TA::L::-GERAAV:Q::S:S:I::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1802 ::TA:YL:::A:D:K:E:::N:T:G:::::::A::::::::::::::::::::::::::: Hbo1683 :::AFG::::D::EK:D:::::S:R:::N::::::::::::::::::::::::::::::: consensus -- #oth 11 HVO_1580 RE Hbo2195 :: Hmu3110 :: HVO_1802 :: Hbo1683 ::