Home |  Text search
3 genomes BUD2446 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_B0122

Hbo1864

Hbo1928

Hmu2268

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score4268 HVO_B0122 Hbo1928 Hbo1864 Hmu2268
2843HVO_B0122 4081 2009 2023 2223
2947Hbo1928 2009 4192 2363 2259
3058Hbo1864 2023 2363 4225 2542
3258Hmu2268 2223 2259 2542 4398

574 symbols
consensus       MKDERRTGR---L-RRRVLQGIGGAGIA-GLAGCTGDSGSDTGTDGG----E-TTDGGNE
#oth            132333233122121122222322323112....2222.212121222222122222232
HVO_B0122       ---------:::-:--------------:L:::::S::::E:TSE:DGGGG:T:AG:AT:
Hbo1928         :TA:K:SPS:::-:::::::A::AT:V::::::::AS::G:-:::--::::-:AV:E:DA
Hbo1864         :S:KNN:TH:SK:N:::::::L::::::::::::A:--:::::::S:::::-:N::::::
Hmu2268         :::T:H:::IAW:S::QYVR:VA:SAL:VA::::Q::G:E:D:G:::AQQP:E::ADSED

consensus       TAAN------GSDATINFAQAKSPVEFDPIIANDVPSAQVANRVFDSLYTYDEGTNLVPQ
#oth            21321111113223223211111.22...232112.122.2312122....211.321.2
HVO_B0122       :::G:::::::::::::IG::LN::R::::TQLSN:D:L::::::SQ::::G:::DV::N
Hbo1928         A:S:::::::S:GK:FY:::::::LN:::LK:::I::L::VE:L:::::::EQ::T:T::
Hbo1864         ESN:::::::----KLKM:LV:::I::::::::::::S::ID:IVEG::::::S:GI::A
Hmu2268         ::TDTDDTEATT:GS:T::::::::::::VVL::::::E::ML:::::::::::::::::

consensus       LAAGMPEVERDGQRYIVEIRDDATFHNGDPVTAEDVAYSFRAPVEEETENAGEFNMIDTI
#oth            1.322.1111322.11.313221112...11.....1..121.22...11211121..11
HVO_B0122       ::TS::TI:::NT::::::V:N:M:::::::::::::::::T:I::::PLL:I:SV:::V
Hbo1928         ::N:D:::SKS::::V:SLK:GI:::::::I:::::K::YL::AR:::::GS::T:::::
Hbo1864         ::K:E:::SKE:K::V:KLNS:::YS:::K::::::K::YT:::T::::::S:L::::::
Hmu2268         I::D::::::GA::W::P::T::::Q::::::::::::::::::::::::::::::::SV

consensus       EVVDEETVQFDLKYPFAPFDHSLTWQVVPKSVREEDKNAFNTSRP-IGSGPFEFDEWQEG
#oth            221113......222112.323.2132.111...2.13.12123111.1...3.12.111
HVO_B0122       :AIG:T::::::SN:Y:M:Q:V::H::::EA::::::E::S:Q:::::::::K:V::E:S
Hbo1928         SI::DK::::::::::G::K:::A:SP:::::::A::K:::::N::V:::::::::::Q:
Hbo1864         T:::::::::::::AY:::MTT:::Y::::::::::::::KSGDSL::::::V::S::::
Hmu2268         :::::S::::::QFQ:GA::SY:P:EI:D:::::S:RD:Y:::S::V:A:::T::D::::

consensus       NYVRLQRWDDYWGEPLPNVAEIEFTPVTEPTTRITTLRNGENDVVETIPPKLWETVESIE
#oth            3111231211...1221222221.1.12.2...1.1.11111111221..2212..1222
HVO_B0122       :::T:E:::::::DE::D::GV::::I::S:::V:N::T:DV::::::::R:::::::T:
Hbo1928         SF::M::H::::::NGS:IETLV::::K::::::::::::::HA:Q:V::::YS:::G::
Hbo1864         Q:A:IKANEN:::::K:K:P::::V::::A:::V:::K:S::::I:E::::QYP::R::S
Hmu2268         E::::S::::::::::::L:::::V::E::::::::::T::::::KN:::AN:::::NMG

consensus       DASIQEVEGIGYFYLAFNCNEGPTADKKVREAIDYAFSMDDAVNRYVEPAGERQYSPLPR
#oth            11.13123131...2....1....1.12.......1111.2..32.11.1.3.112.2.3
HVO_B0122       :T::S:I:SV::::V::::::::::::R:::::::S:::::::D::ID:::L:::G:::G
Hbo1928         E::VT:QT:L::::::::::::::T:::::::::::I:L:E::::::::::T:MT::::Q
Hbo1864         :::::::P::::::A::::K::::::P::::::::::D::Q::SS::::T:I:::::Y:K
Hmu2268         E:::ES:L:TS:::::::::::::::PE:::::::::::::::GQ::::T:::::A:V::

consensus       AISEDWGFPLEEWDQIPHEKDQDRAKSLLDEA-GVPDDWDARIIVPPDDKREQIGISISN
#oth            32212.21.211.32..121.313122.111111.12.12331.....11..1..2.11.
HVO_B0122       QMV:E:DM:::::ME::ND::VEQ:TA:FE::::::A::::K:::::::N::N::L::A:
Hbo1928         TLIDS::::G:K::::::::::EM:RQ::::::::SK:Y:WT::::::K::::::::V::
Hbo1864         S:::::::::D::KS:::S::I:KT:::F::::::S::YSFQV:::::::::::::::::
Hmu2268         ::::::E::V:::Q:::::P:L::::::::DNDS:::::QP::::::::::::::V:V::

consensus       GIKEAGY-DASVQRLDWGAFLDKYVTGSADDYNIYTLGWAGSPDPDAFIYFLF--HEDQE
#oth            11111.212.2.1......1.22121.211...112...32211..313.2..1121132
HVO_B0122       ::::::::E:H:E::::::M:SRAY::N:S:::::V:::VRY:E::D:::N:::::::S:
Hbo1928         AL:SL:FSN:::::::::::::::A::KES:::M:A:::LDEV:::GYL:Y::::::SE:
Hbo1864         ::::::W::::::::::::::::::S::E::::::::::S::::::::S::::GRD::TL
Hmu2268         :LS:::::::T::::::::::EQ::::::::::MF:::::::::::T:M::::::AH::I

consensus       GVNNGTYYRND-----EVMEQIDAARQSNDRDERKQLYTEAITTLLEDRAHLPAYNLKNS
#oth            1211.2..2.21111111211233..213.112.221.22.12.1..111...11.2...
HVO_B0122       :::Q:V::K:::::::::::::QG::E:T:::::Q:::QS::S::::EKV::::F:Y:::
Hbo1928         AST::C:::::::::::::S:L::::R:P::E:::R:::::::::::::::::V::::::
Hbo1864         ::T:::::G:NSESGK::S:KFIK:::ML:::K::::::::T::::::::::::::::::
Hmu2268         :T::::::::E:::::SMN:::MN::::::DEQ:REW:VD::Q:V::::V::::::I:::

consensus       FGVRSEVSDFRAHPVDQFNPRIATAYNNVSVNR-
#oth            1..123.21.22.1.1322113323111111331
HVO_B0122       Y::K:T::::QV:::SPQ:::LL:G::::::D::
Hbo1928         ::::T::EG::P:T:SGI:::MTGPLGS:TL:N:
Hbo1864         :::KDY:K::H:::::S:T--V::D:::L::GTK
Hmu2268         :::::H::::::::::::S--:VS:::::::Q-: