|
Pairwise sequence scores | ||||
---|---|---|---|---|
Consensus score | 3539 | Hmu2231 | HVO_1999 | Hbo1872 |
2626 | Hmu2231 | 3746 | 2052 | 2148 |
2824 | HVO_1999 | 2052 | 3542 | 2359 |
2835 | Hbo1872 | 2148 | 2359 | 3632 |
551 symbols consensus -IVAIDPIFDAIGALGFVGAAALGLLNYRDSDAESPFWLTFTFASVLGIAWTISLMMEKA #oth 12121111..1..11..1..12.12....111..11..2111.....121.111.11..1 Hmu2231 M:TGL:::::G:::V:::::SI:::::::::E::A:::VA::::::::F:::G::::::: HVO_1999 :-:I::AL:::::T:::I:::G:AW::::NT::::S::::YV:::::A:L:M:::T:::L Hbo1872 :M:::A::::::::::::::::::Y:::::::::::::M:::::::::V::::A::L::: consensus GIYAEVFNLATGPLMTATVAVFAIGGTATLAIVEDMKVLVDDAE---------------- #oth ..12.1.1.1.11..11.............11.11..1..2..11111111111111111 Hmu2231 ::GE:I::::::S:::::::::::::::::SV::E:::::Q:::RKNEEAQQAKEQAEQA HVO_1999 :::T:::::V:A:::::::::::::::::::::A:::E:::::D:::::::::::::::: Hbo1872 :::::::D:::::::AS:::::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::: consensus -------------------ERREELNALTNALEQQAESYSAAMAAAADGDLTVRVDPESR #oth 1111111111111111111.121.1211122...1..1.122.22.11..1.1.1.11.2 Hmu2231 REEAQQQRATAEKAQREAK::K::FEEIS:::::K::::::T::R::S::F:T:M::::: HVO_1999 ::::::::::::::::::::::R::D:::TD::::::T:GD::QK:::::::::::A::Q Hbo1872 ::::::::::::::::::::KS:::::::ET:::::::::EK:E::S::::::::::D:E consensus NDAMTRIGQAFNEMLDDIESVIGRIQSFARRVDDDSTEVTASADAVKTTSTDVANSIEEI #oth 111.11..22..1.211.1..122..1..22..22.1.1.11.11111..11..2.1... Hmu2231 :ES::Q::ER::::M::::::::E::::::E::S::::L::G::EIA:::EQ::Q::::: HVO_1999 ::::R:::LG::::::A:D:::V:::T::EQ:::K:S::::::::::::::::::::::: Hbo1872 S:::::::::::S:VA:::::TLQ:::::Q:::EE:::::T::N:::Q::::::S:V::: consensus SAGTETQHRNLDAAASELSNLSATIEEIASSADEVARESQRTVERAKESQEAASETIEKM #oth .111.1..11.12121.111...........12.1.11.111111111.111.1212... Hmu2231 :T:::N::QK::QT:::MND::::::::::::S::::Q::QAA::GEQ:::T::::V::: HVO_1999 :::N:::::::N::E::::::::::::::::SE:I::::R:::G::::::::::S::::: Hbo1872 ::A:::::::::N:SG::::::::::::::::::::A:::::::Q::::RK::NKGT::: consensus EQLESRATETVAEVEELQASVEQIGEVVDLIDDIAEKTNILALNASIEAARAGDAGEGFA #oth 11..1111...1...1.121.21.1...2......11.1...........2..1...... Hmu2231 AA::TQ:::::::::::E:A:GR:::::K:::::::Q::::::::::::::::E:::::: HVO_1999 ::::::S::::S:::D::Q::T::S:::::::::::::S:::::::::::G::::::::: Hbo1872 :::::::S::::::::::S:::::::::E::::::D::::::::::::::S::::::::: consensus VVASEVKSLAEETAEATQEVESLIGDVEQSTENVADDIFETQAEIERSRDTVGETVEELG #oth ...1...1..1..11..1..1...121.2..11.22.1111.21112..2..111112.1 Hmu2231 :::N::::::Q::V:::::::::::T::S::DR:ST:::DM:DD::T::Q::ED::G::: HVO_1999 :::::::T::::::::::::D:::::I::::::::E:T::::::V:S::E:::::::V:E Hbo1872 ::::::::::::::K::E::::::DG::T:::::T:::Y:::N::Q::::::::AI:K:: consensus DIVEAIEDSNNSIQSISDATDEQADSTQEVVGMIDEVTNLSDRTAEEAQNVSAAAEEQTA #oth 21.221.11.21....11...1.12.1.1..2.2..1.21..1..2....1......... Hmu2231 Q::::V::A::G::::D::::Q::::S:::::::::::EI::::::::::A::::::::: HVO_1999 E::HK:::::D::::::S::::::Q::::::T:M::I::::::::S:::::::::::::: Hbo1872 :V:GR::E::E::::::::::::SK:::G::S:V::::D:::Q::T:::::::::::::: consensus ATQQIASASSSLSERAQQLQSLVSQFEANRAAGEAADGER-ATDAATATDRALAAD---- #oth 1.11.112111..12.11.111.12..2222222222.1212122212112222111111 Hmu2231 T:R::S:GA::::TK:ER:::::AE::::------:::N::QSETG:T::EHV:T::::: HVO_1999 ::::::AS:::::::::::K:::::::SG::::G:PG::T:::P::S:PN::MR:::::: Hbo1872 :::E:::::NE:::Q:::::AI::G::VSQTPM:LNE::SDE::EP:Q::DT:S:NQQAV consensus -------GQDD #oth 11111111221 Hmu2231 :::::::---- HVO_1999 ::::::::G:: Hbo1872 PNNAAGM::S: