Home |  Text search
3 genomes BUD2451 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_1999

Hbo1872

Hmu2231

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score3539 Hmu2231 HVO_1999 Hbo1872
2626Hmu2231 3746 2052 2148
2824HVO_1999 2052 3542 2359
2835Hbo1872 2148 2359 3632

551 symbols
consensus       -IVAIDPIFDAIGALGFVGAAALGLLNYRDSDAESPFWLTFTFASVLGIAWTISLMMEKA
#oth            12121111..1..11..1..12.12....111..11..2111.....121.111.11..1
Hmu2231         M:TGL:::::G:::V:::::SI:::::::::E::A:::VA::::::::F:::G:::::::
HVO_1999        :-:I::AL:::::T:::I:::G:AW::::NT::::S::::YV:::::A:L:M:::T:::L
Hbo1872         :M:::A::::::::::::::::::Y:::::::::::::M:::::::::V::::A::L:::

consensus       GIYAEVFNLATGPLMTATVAVFAIGGTATLAIVEDMKVLVDDAE----------------
#oth            ..12.1.1.1.11..11.............11.11..1..2..11111111111111111
Hmu2231         ::GE:I::::::S:::::::::::::::::SV::E:::::Q:::RKNEEAQQAKEQAEQA
HVO_1999        :::T:::::V:A:::::::::::::::::::::A:::E:::::D::::::::::::::::
Hbo1872         :::::::D:::::::AS:::::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::::

consensus       -------------------ERREELNALTNALEQQAESYSAAMAAAADGDLTVRVDPESR
#oth            1111111111111111111.121.1211122...1..1.122.22.11..1.1.1.11.2
Hmu2231         REEAQQQRATAEKAQREAK::K::FEEIS:::::K::::::T::R::S::F:T:M:::::
HVO_1999        ::::::::::::::::::::::R::D:::TD::::::T:GD::QK:::::::::::A::Q
Hbo1872         ::::::::::::::::::::KS:::::::ET:::::::::EK:E::S::::::::::D:E

consensus       NDAMTRIGQAFNEMLDDIESVIGRIQSFARRVDDDSTEVTASADAVKTTSTDVANSIEEI
#oth            111.11..22..1.211.1..122..1..22..22.1.1.11.11111..11..2.1...
Hmu2231         :ES::Q::ER::::M::::::::E::::::E::S::::L::G::EIA:::EQ::Q:::::
HVO_1999        ::::R:::LG::::::A:D:::V:::T::EQ:::K:S:::::::::::::::::::::::
Hbo1872         S:::::::::::S:VA:::::TLQ:::::Q:::EE:::::T::N:::Q::::::S:V:::

consensus       SAGTETQHRNLDAAASELSNLSATIEEIASSADEVARESQRTVERAKESQEAASETIEKM
#oth            .111.1..11.12121.111...........12.1.11.111111111.111.1212...
Hmu2231         :T:::N::QK::QT:::MND::::::::::::S::::Q::QAA::GEQ:::T::::V:::
HVO_1999        :::N:::::::N::E::::::::::::::::SE:I::::R:::G::::::::::S:::::
Hbo1872         ::A:::::::::N:SG::::::::::::::::::::A:::::::Q::::RK::NKGT:::

consensus       EQLESRATETVAEVEELQASVEQIGEVVDLIDDIAEKTNILALNASIEAARAGDAGEGFA
#oth            11..1111...1...1.121.21.1...2......11.1...........2..1......
Hmu2231         AA::TQ:::::::::::E:A:GR:::::K:::::::Q::::::::::::::::E::::::
HVO_1999        ::::::S::::S:::D::Q::T::S:::::::::::::S:::::::::::G:::::::::
Hbo1872         :::::::S::::::::::S:::::::::E::::::D::::::::::::::S:::::::::

consensus       VVASEVKSLAEETAEATQEVESLIGDVEQSTENVADDIFETQAEIERSRDTVGETVEELG
#oth            ...1...1..1..11..1..1...121.2..11.22.1111.21112..2..111112.1
Hmu2231         :::N::::::Q::V:::::::::::T::S::DR:ST:::DM:DD::T::Q::ED::G:::
HVO_1999        :::::::T::::::::::::D:::::I::::::::E:T::::::V:S::E:::::::V:E
Hbo1872         ::::::::::::::K::E::::::DG::T:::::T:::Y:::N::Q::::::::AI:K::

consensus       DIVEAIEDSNNSIQSISDATDEQADSTQEVVGMIDEVTNLSDRTAEEAQNVSAAAEEQTA
#oth            21.221.11.21....11...1.12.1.1..2.2..1.21..1..2....1.........
Hmu2231         Q::::V::A::G::::D::::Q::::S:::::::::::EI::::::::::A:::::::::
HVO_1999        E::HK:::::D::::::S::::::Q::::::T:M::I::::::::S::::::::::::::
Hbo1872         :V:GR::E::E::::::::::::SK:::G::S:V::::D:::Q::T::::::::::::::

consensus       ATQQIASASSSLSERAQQLQSLVSQFEANRAAGEAADGER-ATDAATATDRALAAD----
#oth            1.11.112111..12.11.111.12..2222222222.1212122212112222111111
Hmu2231         T:R::S:GA::::TK:ER:::::AE::::------:::N::QSETG:T::EHV:T:::::
HVO_1999        ::::::AS:::::::::::K:::::::SG::::G:PG::T:::P::S:PN::MR::::::
Hbo1872         :::E:::::NE:::Q:::::AI::G::VSQTPM:LNE::SDE::EP:Q::DT:S:NQQAV

consensus       -------GQDD
#oth            11111111221
Hmu2231         :::::::----
HVO_1999        ::::::::G::
Hbo1872         PNNAAGM::S: