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3 genomes BUD2475 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7203

rrnAC0426

-

Hbo3529

Hbo3795

-

Hut1228

- - -

Pairwise sequence scores
Consensus score3579 Hbo3529 Hbo3795 pNG7203 rrnAC0426 Hut1228
1900Hbo3529 3763 981 1305 1367 1371
1475Hbo3795 981 2973 924 1141 1118
1985pNG7203 1305 924 3596 1426 1427
2672rrnAC0426 1367 1141 1426 3762 2440
2631Hut1228 1371 1118 1427 2440 3526

506 symbols
consensus       ----------------------M---MAPPNIIWITLDSVRSDHTTIGGYERDTTPNLAR
#oth            111111111111111111111123333232111..1.1.2.3.1.121.13.1...3132
Hbo3529         :::::::::::::::::::::::TQPQSR::::::S:E:::A:::SV:::H:::::::R:
Hbo3795         ::::::::::::::::::::::-:::-M:RD:V::::E:::Q:::SLD::R:::::F:QS
pNG7203         :::::::::::::::::::::::SEST::S:::::::::I:Y:R::LD:HA:A::::ME:
rrnAC0426       MRDKSSFSGWNRNINYRRRNQQIVHY:ST:::V::::::L::::::::::::::::EM:D
Hut1228         ::::::::::::::::::::::-:::::A::V::::::::::::::::::::::::Y::D

consensus       IAD--DGAGFDTCIAHANWTLPSSASILTGLAPSHHRTGIAGNR----LPDDVTTVAERL
#oth            1.2333.42.23.1112311311222.1..232232321343231111113223.22.21
Hbo3529         :::LR::RS::E:F:::R::PAV:T:::::TYLTT:GV:H:NT:DVRQ::G:LK:AP:L:
Hbo3795         L::RS:::T:KH:FS:DV::RA::::::::::S:S:::WTQE:::::::SS::P:IP:A:
pNG7203         ::NQAG:VS:SS:::A:::S:::A:::H::TF:E:::::YGT:K::::::QS:N::::::
rrnAC0426       :::::S:H::::::::GKS::::TGA::::Y::T:TNI::E::A::::V::GI::::::F
Hut1228         L:S::A:F::::::S:G:S:H:::GT:::::S::RNTV::T:DV:::::::S::::S::F

consensus       QEAGYRTACLSRNPYVSEATGLDRGFDRFQ-WLASDTLIREAGVRTLLRYLRNIRSHSAG
#oth            3331.3.112.3.223.2211.2...12.213223312242323312341132222111.
Hbo3529         KSE::T::GF:S::WI:DVI:::::::::KANPNR:DFLSPR:::AGCN:::EFTTMG::
Hbo3795         :RTD:::::V:P::QL::V:::A::::H:H:Y:GK:::LD::::L:V:G::TKLNQ::::
pNG7203         ::V::Q:VGV:A:H:F::S:::S:::ET:K:HINPTD:F::VSP:::::F:S:L::::G:
rrnAC0426       RD:::::::::::S:::S::N::::::::::::::S:-:HR::AK::AS::W::::::::
Hut1228         S::::H:::::::S:::S:::::::::::::::::E:-:T:LPLS::IK:V::::T::::

consensus       LTTDTAKHA---PPYLMNEVAKRWLADAANEDEPFFLYLHYNEPHRPYYPPLSYQDRFTD
#oth            2211221.211122233233222224244423212.113.2232.2..1..332213132
Hbo3529         FE:EPIY::QCL:::YQYQSLCE:VD:LS:::R:Y:::T:M:SS:H::N::::LLK::LG
Hbo3795         Y:::::::S:::VG:VSDAI:R:HIRE::QA::DL:::V:LGDS:H:::::KP:::L:A:
pNG7203         :S:EKT::R::::DFFV:::V:KQVSSRTERE:::::SA::HGA:L:::::PAW::::SS
rrnAC0426       ::::::::::::S:L:::G::::::G:FES:S::::F::::::::::::::GK:L:T:::
Hut1228         ::L:::::::::S::::::T:::::::MRT:-Q:::F:::::::::::::::::I:KY::

consensus       DLEMSPREAAERALEHHYNLHRIVANGCDFTDAEWAALRAMYDAEIAYSDEMVGRLVDHL
#oth            222212211323122423223331.21221234211..311..121112.3312311212
Hbo3529         EFDGT:K::I:T:K:LTN:IW:E::H:::::AQQR:::K:V::::::F::HF::K:FE:V
Hbo3795         GF:::VG:SLDLV::MSS:::GYI:R:VP::ND::N::Q:::::T:R:V:DT:RSI:E-C
pNG7203         ::VE:::A:S:::FK:TAD:::GI::VSE:GE:D:N::NV:::TLV::::SLI:E:F:::
rrnAC0426       :::::G::::K::::I::S:DE:::::::L::E:::::::::::::::T::::::::S::
Hut1228         :I:::::::::F::DV:::MEK::::::ELD:R:::::::::::::::T:::IE:::::V

consensus       RALDLEDTVFVVTADHGELFGEQGLLGHSYVLHDAVTRVPLVVAGLNESLTVDENDLVQH
#oth            2213133112.1.2...1.1..312.2.33113.1122..2.34.2222332432322..
Hbo3529         ::NTDQK::::I:G::::::::::V:::NLT:::GL:K::M:TY:M:F:ES:T::-V:::
Hbo3795         AENR:N:PIV:::S:::::::::EM:A:MV:AD:::SH:::::C:IE--AVESH:GV:::
pNG7203         K:::::N::::::::::D:L::C:::::KF::::GLIH::A::H::D-:VADKQDE::::
rrnAC0426       :S:::G:::V:::G::::::::W:::S:::::N:::::::::IN::D::::::DS:II::
Hut1228         :S:P::E::I::::::::::::Y:::S:::::T:::::::::L:::::E:::G:D::L::

consensus       ADVMRTLLEVAGGDTSDFIGVDLREERREFAVSQR-GPR---DLDEILEHNPDFDASAFH
#oth            4.212.11231.2123333.2..1314.12.12..1123332423333121221.31411
Hbo3529         M:::Q::VSAV:::::Q:Q::::AR:T:TY:LM::::::MD:::NTV::::::C:I:KY:
Hbo3795         ::A:K:V:NEV:VEFEVP::Y::::QD:::::T::S:V:CASK::M:G:RDDA::::SY:
pNG7203         I:IV:::V:I:::::T::D:I:::N:::TA:L::::AADIQGP:SA:Q::D:S::TGY:D
rrnAC0426       S:::::::::::V:G::T::::::::G:::::::::::N:::TYE:L:T::::::Y::::
Hut1228         T:::::::::::A::DGML:::::S:Q::Y::::::::V:::EF::FY:Y:E:::::R::

consensus       AGALNALRTDEWRYQESAEGAELFALPDEESDVREAYPDAAAELDAALDRWLDE---NDQ
#oth            422243112433211314324311412122221434212423224341443242111423
Hbo3529         :::IDC::SV::K::R:DDRT:::K:::::TN:VDK:::::::M:::::EM:P:AQFD:D
Hbo3795         V:VT--------------------------------------------------:::---
pNG7203         DA::SS:::HDFK::Q::::DV::E::::Q:::SMS:::RRD::K:G:Q:R:S::::I:S
rrnAC0426       T:T::::::E:::::::G::::::D:A:Q:T:::::::EV:ES:QSD:TD:VEA::::G:
Hut1228         LP::T:::::TY:::::ES:SD:::::::::::T:DR:EI::::SGS:EK:::::::HG:

consensus       PVEAGEQVEFSGAVQRQLRDLGYI-E
#oth            33432333121343322131111412
Hbo3529         DR::AN:::L:SQMKDH:A::::L:-
Hbo3795         ------------------------:-
pNG7203         QKLD::E::::DDIRD::S:::::V:
rrnAC0426       ::SE:Q:E::::T::::::::::M::
Hut1228         ::G:::RG:::::::::::::::V:D