Home |  Text search
3 genomes BUD2491 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_2088

Hbo3595

-

Hut1863

Hut2070

- - -

Pairwise sequence scores
Consensus score5604 Hut2070 HVO_2088 Hbo3595 Hut1863
3692Hut2070 5655 2482 2606 2718
3724HVO_2088 2482 5643 2712 2638
3827Hbo3595 2606 2712 5619 2810
3910Hut1863 2718 2638 2810 5822

773 symbols
consensus       -----------MMNDDPPYRRSNQSTEARIEDLLERMTLEEKAGQLVGTAVG-------E
#oth            1111111111122312121132322122112...11..12..1..2..132111111112
Hut2070         ::::::::::::TQ:::L:::PD:P::H:V::::S::::::::::V:::WA:::::::::
HVO_2088        :::::::::::-:TSQ:::MG:G::::::VA::::::::R:::::M::LH::SFTVLQR:
Hbo3595         ::::::::::::GS:TQAD:PLPTVSA:D:D::::S::::::V::::::Y:::::::::H
Hut1863         MDEDRPTDEDLS:::::::MD::R::GD::::::S:::PA::V:::::::PT:::::::L

consensus       RGATETLDDAADAIADHHVGSVSPFGHGGSPRNTPAEAVEVANALQRVAIEETRLGIPVL
#oth            2232312322322131122.1121..3121233113222121.3..12.221.111..21
Hut2070         ::E:HDIPVVR:TV:E:GF:::AA::WA:AAVS::R:I::AV:T::ET:M:::::S::::
HVO_2088        TSW:T:::::K:::R::Q:::AT:::T:F::Y::AVV:GR:::Q:::::VN:::::::L:
Hbo3595         M::EK::E::ISE:V:D:::::::::I:I:T:DD:KL:A:T::R:::::::::QH:::IH
Hut1863         :PGR::VSGI:E:VTE::L:A::::::::::WE::::C:::::::::E::QN::::::::

consensus       FPVDAVHGHAYVEGATVFPHNLGMAATRDPALVERAAAVTAREVAATGAHQNYAPTADVA
#oth            221..2...122211....11.11..111.3.2..1132.12.21....21.13.11..1
Hut2070         :T:::::::::::D:::::NG::A:::W::K:I::S::A:::::R::::::::S::C:::
HVO_2088        V::::I::::HI::::::::::A::::WN:D:A::::RI::V:M:::::N::::::::::
Hbo3595         I:I::::::::LN:T:::::::::::V:::E::::SGE::G::A:::::TV::G::C:::
Hut1863         :Y:::D:::GF:K:T::::::::::::::::::::::S:::T::::::::::LN:V:::G

consensus       REPRWGRVYETYGESPSLCAAFAAAEVRGLQGEAIRDPESVAATAKHFPAYSDPTRGEDG
#oth            .12....22..2...12.22322..221.11.2323.23212..2..1..112.2..1.2
Hut2070         ::::::::Q::H::::R:A:D::::K:W:::::G:D:::::V::::::::::::E::Q::
HVO_2088        :::::::T:::::::S::VE::V:::T::::::SL:::T:::::V::Y::S:E::::::T
Hbo3595         :DQ:::::F:::::::Y::GEL::::A:::R:S:--:NPTI::::::::::GQ::::::A
Hut1863         ::A::::I:::F::::::::SMS::A:::Y::DD:G:EGN:I::P:::::::::V:::::

consensus       APVDISEYTLRRVFLPPFEAAIDAGVASVMPAYNALNGEPAHGSTRYLTDLLRDELDFDG
#oth            11.11.1211112.1....11111.1321..2.122211.1.2.232.122..11.1.1.
Hut2070         :::EV:::V:GNT:::::::::::::E::::::S:T::::::A:IQL:::R:::::::::
HVO_2088        ::::::MG:::::::::::R:::E:::G:::M::::GN::::S::F::::::::R:G:E:
Hbo3595         SV:E:::S:F::D::::::RVLE:::DV:::C::SID:::::::K:F::S::::::G:::
Hut1863         S:::V:::::::::R::::::::::AG:I:::::E:::Y:V::::E::EGW::G::::::

consensus       VVVSDWNGINMLHERHRTAASRREAVWQAATAGLDVASVGGTQHAEELCELVESGDLSEA
#oth            2121..31132.123.211213211121232..1.22..11231112121.11212.2.3
Hut2070         H::A::S::KQ:::S:GVT:DW::S:RRTRE:::::G::DH:V:V:::V::::D:Q:D::
HVO_2088        :TC:::LAVW::V:::Q::::FA:::E:V::::::I:::::::::DT::::::::::P:S
Hbo3595         ::T:::D:VEH::QY::::D:::T:A:::FS::::LV::::PSY:::V::::RAEE:::K
Hut1863         Y::::::::::::HD::::R:MD::::::T:::V:::::::VE:::R:LD:L:::::::N

consensus       RIDRSVRRVLALKFRLGLFEDPYVDAEDAVEAVGRDDHREVAREAARQSMTLLRN-DEVL
#oth            21.2....1.32.11....11.112221122311312..221111.11.1...3.2112.
Hut2070         IL:D::::::RV::E:::::E:FI:V::::STL:C:E:::L:::T:S::::::E:::GI:
HVO_2088        LL::::::I:::::E:::::::::SPRS:IID::SE:::R:S:::::::V:::Q:DE:T:
Hbo3595         ::::::::::K::A:::::D:::::::S:T:::S:ES:::MSLD:::E:::::K:::G::
Hut1863         :::E::::::EA::::::::::::E:-:R::Q::T::::A:::::::E:::::::E::::

consensus       PLSASLDDVFVTGPNADNLRNQFGGWSVHDEAELAGDTVREGIEAAVAGETTVTYEQGAG
#oth            ..23121322.2.....2.3112...123222223.3.1.111.33132122.21.1.22
Hut2070         :::G-DET:::G:::::::VH:V::::H:E::G::::::::A::ERA:::--:LF::::T
HVO_2088        ::GD-V:EL::::::::S:D:LL:::T:F:FD:NE:P:::D:L:HV:DDG::::::P:V:
Hbo3595         :::E:::::L:::::::D:HH:::::::M:D:D:T:V::::::::I:-::ES::::P:S:
Hut1863         ::D::::SIA:L:::::::::::::::TIS:P:PP:T:I:::::R::PV::::R:::::S

consensus       ITETADRDAAAEAAERADAAVVVLGEDWYLHEFGPQDMRG-DTGEFPTRSELELPPAQRE
#oth            32.23131.1322.221111.211..31.2...1123232122.11.1.22.2..2...2
Hut2070         LI:ER:I:::V:K:S:::V::LG:::G::I::::::::L:T::::W::::::R::::::R
HVO_2088        SD:S:G:::V:SR::::::T:A::::P::::::::ASL:::EN:G::Q:NS::::::::D
Hbo3595         ::::E:VA::TD:::D::::::::::::::::::::Q:NR:A:::::::TQ:G::D::::
Hut1863         M:::V:L:::R:::DASE:::::V::TG:R:::HRSET--::R::::::::::::E::::

consensus       LLEAVAATGTPTVLVLVTGRPLAIAWAAEHVDAILMAYFPGSEGGRAVADTLFGDANPGG
#oth            .12.132.1..1.2.112....33313211111212.12..21..3.1.11.1.231.1.
Hut2070         :A::IH:::::V:G::L:::::IVD:L:::A::L:::::::::::Q:::E:::::RD:::
HVO_2088        ::D:::::D:::::::::::::VLTDVLDQ:::VVV:F:::L:::::I::V:V:NT::S:
Hbo3595         :::::QT::::::::::S::::S::::D:::PG:::::Y::MD::T:::E::::RH::S:
Hut1863         ::G::RE::::::A:F:A:::::ME:T::::P:::F::L::::::N::::V:::::D:::

consensus       RLPISIPRSHGDLPTRYDYLRHPHPIGAD---------EHPDSYDPLFPFGHGLSYTAFE
#oth            1..1121..3.11.2221221..311132111111111..121....12..1....13.1
Hut2070         ::::::A:::::::QLH:HA:::LTL:KA::::::::::::::::::Y:::::::::T::
HVO_2088        ::::TF:::M::F:V:::W:P::S:L:M::::::::::::LP::::::E::F:::::E:T
Hbo3595         :::::V:::V:H:::::N:::::T:::::::::::::::::::::::YA::::::::D::
Hut1863         S::V:::::S:H:::HF::RP:::::EGSPREENPRPP:::ET:::::::::::::A:::

consensus       ARDLSLSEETVGPAGTVTVAVTVENTGDRAGTDTVQLFGEDEHSSRVTPVRELVGFDRVT
#oth            332.2112221113.2111311.1.111.3.2322211122231.1.1.1..11.13112
Hut2070         R:::E:T:TA:::D:::S::M::::V:S:P:E:VI:VY:RQ:TP:::R:D:::::Y:::A
HVO_2088        YDS:DV::::IADG:E:::S:::T::::::::E:::::::HR:::V:::::::Q::TK::
Hbo3595         VT:::::SS::::::::::E:::::::::D::KA:D::V::VV:::::::::H:::EKT:
Hut1863         :GE::V:T:R:::E:SL:TT:A:::VS::G:ST:LH:Y:T::F:::::::::::::Q::E

consensus       LAAGEARTVEIEVPVEDLGVHKPDGERVLEAGAYELHCADETAEITVE---D-
#oth            131..321132322222121322222122.31323231212222321222211
Hut2070         :DP::::::::G::::HF:FY::GEGH:::GDT:HVTV:GME:AF::::::-:
HVO_2088        :SP::T:::M:TLTAD::R:V::::S:T::S:::::FVG:R:QTLAIS:::-:
Hbo3595         VE:::SA:LSMS::::R:A::GR:Y:::-:P:EFVF::E::::::::RTGR::
Hut1863         :::::GTE:TF:INLA::::LTEN:::RA:::SIT:S::G:SV:VV::GRF:R