3 genomes BUD2500 3 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - - HVO_2864 Hbo3087 - Hut0827 - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	1400	Hut0827	HVO_2864	Hbo3087
978	Hut0827	1403	756	731
1109	HVO_2864	756	1381	850
1054	Hbo3087	731	850	1401

193 symbols
consensus       VASRLARLRALLRDERVRAISRRYFVSNGFDGTLTCIGIIVGAFLGGIQDGMTVVRIGVG
#oth            .212221122..1.12.11.1....1......1..2..111.12.2.2211211.2111.
Hut0827         :S::::N::E::K::D::S::::::I:::::::::T::::::S::::S:SS:EI::VVA:
HVO_2864        :M--FG::G:::::D:::::::::::::::::A:::::LVI::Y:T:VT::V:::E::::
Hbo3087         :::PTS:FLR:::::S:L::A::::::::::::::S:::::::V:S::P::F:::K::::

consensus       AAVGLATSGVWSVWEIERAEKRAELRRIERAMLADLDGTAIERRKRAARGVNAAASGLGP
#oth            11...21.1...........11.11212.21..21.21.12112122..211.22.....
Hut0827         GT::::A::::::::::::::L:::KAV:EK::TG:E:::LHD::GD::K:::MM:::::
HVO_2864        :::::T:::::::::::::::::::G:::D::::::G:::V::DQV::::I:::::::::
Hbo3087         :::::G::A:::::::::::T::DI::L:::::V:::D:Q:::K::G::T:H:TL:::::

consensus       LIGILVPLIPFAFVGSALSMAWATLAGVALGTAILFVFGAYMGSISEQRWYVAGLRMALA
#oth            11.111.12.1211.2211.21.1221.21.121.11......11.1.1.11111.1111
Hut0827         T::M:L:I::YF:::V::::M:::VI::LI:VSL:::::::::NL:::N:VI::::TGVV
HVO_2864        :V::V:::L::LA::TL:T:T:::::S:G:::::::A:::::::::::::::::::::::
Hbo3087         ::::::::V::::E::VF:::E:GFV::::::G::A::::::::::G:::::SAF:::::

consensus       GLVVAGINIILPG
#oth            .11.111.22111
Hut0827         ::::G::::::::
HVO_2864        :VA::AV:LLF-:
Hbo3087         ::::::::VV::S