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3 genomes BUD2591 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- - -

Hbo3600

Hmu1127

Hut1196

- - -

Pairwise sequence scores
Consensus score3216 Hut1196 Hbo3600 Hmu1127
2168Hut1196 3167 1377 1553
2077Hbo3600 1377 2993 1659
2414Hmu1127 1553 1659 3279

404 symbols
consensus       ----MADQYRRARWLRRRARDVLEFYHQRGIDTEHGGYIPQISDRDGAIYDARAKHLVAT
#oth            1111222221222212222221121122222.122..112.21111.21..112.1.11.
Hut1196         ::::::::::::D::VD:L::::T::YPT:::E:K::::V:LDEET:E::::ES::::::
Hbo3600         ::::--------------------------M::HF::::T:V:::::::::S:T::::P:
Hmu1127         MLARTDTTV:DP:Y:::H:LS::::::::SV::T:::FV::::::::TV::::::L:P::

consensus       ARFVFNCSIGALLDGPEPCEDAAEHGIRHLRRGHRDDEHGGYDWLLEGANVADRGRRCYG
#oth            1.1.11212..11.11221121.1..222.12212.211...2.111.2212.22121..
Hut1196         T:Y:V::CL::RF:DQ::WL::::::VEF::E::F:P:T::::::::::ETV::K:V:::
Hbo3600         :::::AF:::::::::VW::P:::::LSY::NVAY:E:::::S::F::R::T:ET:ST::
Hmu1127         ::::::Y:V:::::::HY::EM:A::::::E:H::::R::::V:Q:D:QD:::G:K::::

consensus       HAFVLLAYATAARAGIDGARERIEETYDLLDEHFWEDEHGACASERDADWAEA-SDYRGQ
#oth            .........1.21..1211112.121111.1.1...21.12121121211221111....
Hut1196         :::::::::R:HE::::::::G::G:::::M:::::PA:HL:Q::F:G:F:::::A::::
Hbo3600         :::::::::::T::::GDVEDD:R::F:I:::R:::E::::F::N:T:E:DP:EP:::::
Hmu1127         :::::::::::::::VP:::::::PA:A::::::::::::R:RV:L:R::SGT:::::::

consensus       NANMHTCEALLAAYEATGEERYLDRAARIAEALARDLADEADGLLWEHYTSDWDHDWEYN
#oth            .....1...1...1....111..1..221.12111.111.2....1..1.12.11.11..
Hut1196         :::::::::M:::H:::::A::::::RE::H::TV:::G:H:::::::::ES::::M:::
Hbo3600         :::::S:::::::::::::::::S::VTV::TI:::KP:::::::C::F::::EI:::::
Hmu1127         ::::::::::::::::::T:E::::::::::G::::::::G::::::::::E:::::A::

consensus       RDKPADLFRPWGYQPGHHLEWAKLLAILARHADANWAADRAERFFDAAVENGWDDERGGF
#oth            .1112............21..1...21.2112122.22...211.111.12....11..1
Hut1196         :E::K:::::::::::::I:::::::::D:D:EVE::I::::EL:EI:::H:::::Y::L
Hbo3600         ::QK:::::::::::::M:::::::VR:HH:H:G::YL:::K:::::S:TD:::::::::
Hmu1127         ::::G::::::::::::L:::S:::L:::::R::P:F::::V:::::::::::::D::::

consensus       YYTFDRDGAPIVDAKYGWPLAEGIGAAAALAARTNDDRYRAWYDRIWAYAQDHATNDRLG
#oth            1.11....211.12..2.112..1..1.2.22112..1.22.1..112.2211111222.
Hut1196         ::::::::EA:::D:::::V::::::::::SE::G::T:LS::::F:E:T:::L:APG-:
Hbo3600         :::I::::::::::::T:A:E::L::::R:G:V::::::WE:F:::H::LHEN:::HS::
Hmu1127         V:N:::::D:L:EN::Y:::C:::::T:L::D:FD::::::::::::N::L:::V:::Y:

consensus       NRYFRLTPDNEIAPDAIDETPAVKPGYHQINACYEGLRSLDAA-
#oth            12.12..1111221221.11.2.12...221.11.2.1112221
Hut1196         :V::K::RE:D--:IDT::G:::E::::P:G::F::::::---:
Hbo3600         I::E:::::G::H:-T:::::K::S:::HV:::::V:E::::V:
Hmu1127         :W::Q::::::V:T::::D::E::V::::L::I::T::ADGF:E