|
Pairwise sequence scores | ||||
---|---|---|---|---|
Consensus score | 3419 | rrnAC0307 | HVO_2530 | hla1700 |
3123 | rrnAC0307 | 3419 | 2867 | 2891 |
3099 | HVO_2530 | 2867 | 3434 | 2896 |
3145 | hla1700 | 2891 | 2896 | 3422 |
443 symbols consensus --MARFLFVSADAALIADLAWQVRREGHDVRYYIEAESDREIGDGFVPKTDDWRAEVEWA #oth 11222...1.1.1...2.1....21.....1.....11.1..11..........1111.. rrnAC0307 ::::N:::C:L:::::G:I::::TE:::::::::::N::Q::A:::::::::::EDLD:: HVO_2530 ::-MK::::::::::::::::::::::::::::::::H:::::::::::::::::::::: hla1700 MDTE::::::::T:::T::::::H::::::K::::::::::::E:::::::::::::::: consensus DVIIFDDIWVGSDIGTGALARELREEGHAVVGGTPNTDALEEDRGYAMEILEDHGVNTVE #oth ..11.........1...11.2...11.1..........2.........11..1.....1. rrnAC0307 ::V::::::::::::::EI:::::A:::::::::::::::::::::::::::::::::I: HVO_2530 :::V:::::::::V::::::Q:::::::::::::::::R:::::::::DV::E::::::: hla1700 ::::::::::::::::::::E::::Q:K::::::::::H::::::::::::::::::::: consensus HHVFRDFDAGIRHVQENPAPYVIKPLGEVQNVKRLLYVGNEDDGSDVVDVLRAYKKAWGH #oth 111.2...1..21.11.1.......................1....1.1..1...1.... rrnAC0307 ::::E::::::Q::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::: HVO_2530 QR::::::E::EY:RR:R:::::::::::::::::::::::E::::::E::::::Q:::: hla1700 ::I:H::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N:::::::: consensus RMKGFQLQRKVEGVEIAVCGFFNGNEFVDPVNFNFEHKKLFPGNIGPSTGEMGTSMFWAG #oth ...........1...1.1....1.22.111.............................. rrnAC0307 :::::::::::A::::::::::::DS::E::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2530 ::::::::::::::::::::::D:ET:::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1700 :::::::::::::::V:I:::::::::I:Q:::::::::::::::::::::::::::::: consensus RNRLFEETLGKLEGWLANEGYVGSIDINCIVNEHGIYPLEFTPRFGYPTIALQEESFESS #oth 1.2..1..1.11.1...2........1.....12................1.....1..1 rrnAC0307 ::E::::::::V:::::D::::::::::::::DS:::::::::::::::::::::::::E HVO_2530 ::::::::::R::P:::E::::::::::::::::::::::::::::::::T::::::::: hla1700 Q:K::K::F:::::::::::::::::L::::::T::::::::::::::::::::::I::: consensus TGQFFADLAHGNDPELDVHRGYQIAVRIVLPPFPFDDEKTYDENSRNAAVVFETDSREGI #oth .11..2...1.11.112..2...1...1.......1..1..............11..1.1 rrnAC0307 :::::L:::::R::D:K::::::V:::V::::::::::E::::::::::::::S:::::: HVO_2530 :A:::F::::::::::S::G:::::::::::::::T:::::::::::::::::::::::V hla1700 ::A::::::R::E::V:::N::::::::::::::::::::::::::::::::::E::D:: consensus HIEDAKRVDGQWRVAGESGMPLVVTGKGETMQAAREQAYDRVDDIVIPNRYYRDDIGERW #oth .1....1..1...1..11.1.1......1...1..1...1.1.1.11..2.......... rrnAC0307 :::::::::E:::::::::::::::::::::::::::::K:::A:R:::::::::::::: HVO_2530 ::::::L::::::A:::::I::::::::::::E::K:::::::::::::L:::::::::: hla1700 :L::::::::::::::NN:::I::::::D::::::::::::I::::M::M:::::::::: consensus IDGDGDRLQAWGYLGPAL----- #oth ........1.......1211111 rrnAC0307 ::::::::::::::::::::::: HVO_2530 ::::::::L::::::::SERKIS hla1700 ::::::::::::::::--:::::