| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||
|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5033 | hla1756 | HVO_2006 | Hbo1877 |
| 3509 | hla1756 | 5046 | 2870 | 2712 |
| 4145 | HVO_2006 | 2870 | 4997 | 3624 |
| 4073 | Hbo1877 | 2712 | 3624 | 4987 |
689 symbols consensus -RNRALTLAITLVVVVGAAPAAAAATAAAQQQNEASVSFAAQASGGSTVVVDNVTLPDGG #oth 122212122211..1.122111.1.22122122211...22121..1..1.12.11.... hla1756 M::S:F::::AV::::S:VAG::G:V::QSGT:::::::SDGT:::::::::E:HV:::: HVO_2006 :--------M:::::::GI::::::-----::ETTA:::EN::T::T::T::S::::::: Hbo1877 :MQ::::VFV::::L::T:::G::::P::::SSG::::::::S::::::::E:::::::: consensus FVTIHDASVTDGNVLGSVVGSSAYLDAGTHENVTVHLDEPVDESGTFVAMPHMDTDGDRV #oth ......1.11...1......1....11...11...1.11112.1.1.1..1.1.1....1 hla1756 ::::::G:L::::T::::::T::::EP:::A::::E:TDA:-:T:::H::A:R::::::A HVO_2006 :::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::S::::: Hbo1877 :::::::::A::::::::::::::::::::::::::::::LS:::A:::::::::::::: consensus YAFVAANGEADGPYTADGSAVIDDANVTVSATVSMSDQPTDGDSVVVDRVELSDGGFVTV #oth .2..12..11.....1..111212.1.11..1.111....2.21.1.......1.....1 hla1756 ::::SS::G::::::V::DIAM:::::::::S:TGT::::E:EY:I:::::::::::::: HVO_2006 :S:::::::::::::::::::V:T:T:NA:::::::::::T::::::::::::Q:::::I Hbo1877 :D:::D:::T::::::::::::SQ::::::::::::::::::T::::::::::::::::: consensus HDASVTEGAVFESIRGTSAYLEAGVHENVRVQLDAPVQNNTTLVPMAHMDTDGDEAYTFP #oth ..1.111.1..1.........1.....1..12..2.12211.111...1..1.112.1.. hla1756 ::S:LAD::::D:::::::::::::::D::::::D:L::DD:VFA:::R::N:N:::D:: HVO_2006 :::::::::::::::::::::P:::::::::E:::::TE::::::::::::::::T:::: Hbo1877 ::::::::E:::::::::::::::::::::IT::T::EK:::::::::::::::QM:::: consensus ESEGETDGPYTAAGSAVVDTAA-AELSDEARVNFDAQASGGNSVVVDSAYLPEGGFVTVH #oth 1.1.11....1121121.11121121112.21212..21..21....11...1.....1. hla1756 S:D:SE::::LD:SDEI:MAGID:::D::::SS::::T::::A::::EI:::::::::M: HVO_2006 ::::::::::::D::P:::::M::MP::S:S::YT:::T::Y::::::::::D::::::: Hbo1877 ::::::::::::N::::::::::VT::ET:N:T:S::S:::Q:::::::::::::::::: consensus DATLADGAVFESIRGTSAYLEPGLHRDVRVRLDAPLNEDTTLVPMAHMDTDGNEAYTFPE #oth .21121.1..1..1......1..1.11.1.2..2..11211111...1..11112.1..1 hla1756 :SS:::::::D::S:::::::::I::::V::::D::T::DA:FA:::Q::N:::::D::S HVO_2006 :G:VTE:Q::::::::::::::::::::::T::S::::T::V::::::::::D:T::::: Hbo1877 ::::N:::::::::::::::A::::KN:::S::::::NS::::::::::::D:QE::::: consensus SEGAADGPYTADGSAVV-DDGNVTVSASVDMETDASDGAAVVVDRVELSEGGFVTIHDAS #oth .1.21.....1.1121.112111.1....122121...22.1....1..1....11..2. hla1756 :D::E:::::T:S:DI:M:::::::::::AF:::G:::T::T::::D::Q:::::::::: HVO_2006 :::G::::::::::P::::S:EA:::::::YT:K:::::T::::::::::::::::::P: Hbo1877 :::E:::::::::G::::AQA:::L::::::SMQ::::HS::::::::::::::VV::S: consensus LGGGAVFDSVRGTSAYLEAGVHEDVTVTFDEPIRASQQLVPMAHMDTNDNEAYDFVDSEG #oth 121.1.11.12...2..11.1..1.11111..112112.11.1.1...1......12111 hla1756 I:::::::::::::::::::L:::::IEL:::LTDTE:::A:P:R::::::::::::::: HVO_2006 :S::::::::V:::M::P:::::::A::::::::S::V:T::::::::::::::::T::: Hbo1877 :FA:E:EG:IL:::D:::P::::N:::::A:::::::T::::::::::G::::::----P consensus EADGPYTAGGNA-VVAGARTSVNAVVTAADQDTDGQTVTVDSVTLHDGGFVTVHDATVAE #oth 1....111112.1.112.211.1.1.1.21.21..2..11......1........11121 hla1756 G::::FLT:ED:P:T:::TAQ:T:S:G:IA:::::E::V:::::::N::::::::SSL:D HVO_2006 ::::::::D:G:::::S:H:::::::::M::SG::T::::::::::::::::::::::T: Hbo1877 :::::::::::::::DT::::::::::::::T:::::::I::::::::::::::::::S: consensus GAVFESVRGTSAYLDPGTHENVEIALDAPLDEDDTVVPMAHMDTNGNEAYDFVTGDGAED #oth ....1.1....1..21...11.112.12..2.22.111...1...1.1....1121.21. hla1756 ::::D:I::::T::G::::TD::::::D::S:::::FA:::R:::A:Q::::PAT::D:: HVO_2006 :::::::::::::::A::::::::S:::::::SG:::::::::::::::::::::E:EN: Hbo1877 ::::::::::::::S:::::::TVE:SK::T:TT:I::::::::::::::::::S::::: consensus GPYVAAGGAVIATANATVEAGEMSET--DDAADSMTD--TEMADDEDAGEMGDEGAEATD #oth ...1.1.11.211.221..2.2121111222211.11111122121222.1211221212 hla1756 :::T:::AP:MSA:DL:::::-----::G::G:::S:::---G:GA:S:::S:D::SDEE HVO_2006 :::::::::::::::Y:::-:T::::TT:EPT:::::EP::TMT::P:T::T::SM:T:T Hbo1877 :::::L::::V:::E:S::D:::T::::EMN:ET::E:::::::E:TEM:T:T:MN:::: consensus GSDTDAPGFGAVVALVALVAAALVAARRR #oth 112121....2.1111..1.1..1.2.12 hla1756 ::GDE:::::::LT::::I:V::::R:HT HVO_2006 E:S:::::::L:::::::::::::::::: Hbo1877 :T::GT::::V:::II:::::::I:V::D