3 genomes BUD2642 3 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - - HVO_0352 Hbo1128 - - hla1818 - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	2239	hla1818	HVO_0352	Hbo1128
1228	hla1818	2355	760	879
1584	HVO_0352	760	1919	1383
1788	Hbo1128	879	1383	2355

331 symbols
consensus       MSPHAPACRLAGWF---------------GQIGPTDLAA----YEQLVGAAAGFAAGALV
#oth            .11221222221121111111111111111121.121221111.121121221.221221
hla1818         :F::T:P:::W::SVFPAAPAVVRATTPEPEV:::E:FE:::::WPV:VRLGW:L::L:A
HVO_0352        ::SIR:SVGV:A--:::::::::::::::::LD::QF:D::::::E:AS:T::::VA:V:
Hbo1128         :::P:T:LHFL:::::::::::::::::::::::I::T:LPEG::::::::L::GI:ST:

consensus       VYLLGRLLLQPGIERVVRARNRNNPTLRSATETYAHAVAILIAGLGGASGAGYGEVLGNS
#oth            11.21.1112.122.1122..1....121.111.11112122122212221111211221
hla1818         :V::N:IFI::VL:::L:Q::H::::::N:LLR:FQI:::V::I:V:::V::::P:::::
HVO_0352        :::V:::::V::VT:L:S:::::::::Q::::::::::----------------------
Hbo1128         I::F:::::L:::V:::GS:::::::IV:::::::::AI::L::V::VV::::::::TD:

consensus       ALIIAAIALAIGVAAQEVIGSLISGLFLVADPDFNVGDWIAWPGGEGVVEAVDFRVTRVR
#oth            11222122122111211...1.1..11..1........1.2.11...1.11111.1...1
hla1818         ::L:S:::::::::::::::::V::IA::L::::::::Y:E::N:::::QSIAL:T:::E
HVO_0352        -----------------:::A:::::::::::::::::::S:::::::::::::::::::
Hbo1128         :::V::VT:VF:::G:::::::::::::::::::::::::::S::::I::::::::::::

consensus       TQNNETVAVPNTELTTNALTRPYGRDRYRVTERVAVAYADDAELALRELVEVAREDDRIL
#oth            .2.1.1121...1..1.211..1..211.1111121..2.1211.12111111121.11.
hla1818         :::G:L:TI:::I::N:EIS::F::GNH::VQQFG:::E:EIDE:IGHFKD::AST:A::
HVO_0352        :V::::IS:::::::::::::::::E:::L::::DI:::::::::::::::T::::::V:
Hbo1128         :I:::::::::::::::T::::::::::::::::::::D::V::::K:::::I:T:::::

consensus       ADPEPNARIDEFGGSSVGLRAEFWIADPMDADLVDVRSQYRRRVKRRFDEEGLTLGPASG
#oth            1..1.22112.111111111211.221.1121111.1.211..1.1..111.1.1..2.1
hla1818         :::A:MVYV::L::E-:TV:VHY::E::GRQ:ILV:Q:E:A::I::::EN::I:I::T:E
HVO_0352        D::::T:::V::A::::::QT:::VGS::::N::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1128         ::::::S::I:::D::I:::::::L:::::V:::::::SF:::::A::::V::::::P::

consensus       REVSGRLDVDDIGGRR------------DGN
#oth            111..1121.2211.1111111111111112
hla1818         I:L:::VGI::S:R::::::::::::::---
HVO_0352        ::::::::::LV:::-::::::::::::::E
Hbo1128         :A:::E:S::V:D:::TGEETTCDTRRG:::