Home |  Text search
3 genomes BUD2737 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7257

- -

Hmu1472

- -

NP4464A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score3103 Hmu1472 pNG7257 NP4464A
1953Hmu1472 2955 1513 1515
2467pNG7257 1513 3188 2176
2529NP4464A 1515 2176 3120

419 symbols
consensus       --MDQVDSLECTRCGAEYDPNRERYTCPNHDGVGGILEVTYDYDAIRDAFDADLGGAIDS
#oth            1112212211122111111.122111..2.2..2...1.1..112121111221112.11
Hmu1472         ::--------------VFV:AD::LV::D::::::::D:Q::QSGA:E:VA:GV:EG::D
pNG7257         MG:T::TT::::L:::::::::II::::E:E::K::::::::::::D::::G::::P:A:
NP4464A         ::::H::::::V:::::::::QL:::::::P::T::::::::::I:V:R::EP:D:::::

consensus       QWKYAAFLPVAADADAVTLGEGGTPLLDAPNLSAELGVDLRIKDDGRNPTGCIKDRASAV
#oth            1...211..1211112.1.11...1.11..2.111.1.2222..111....22.....11
Hmu1472         L::::PL::--T:GH::D::A:::::::::T::R::::TV:L::ERG::::S::::::::
pNG7257         ::::E::::::::::I:::N::::D:F:::::::A:::ETLV::::::::::F::::::I
NP4464A         ::::R:::::E:E::P:::::::::::S::Q:G:::D:::H::::::::::VL:::::S:

consensus       AVTKAAAADADVITCASTGNAAASLAGYAARGGLDCRIFVPADAPEGKLAQPLVYGADVL
#oth            2111.22212112............1.1...112..1....2.1.11.11.........1
Hmu1472         LTSR:L:G:ES:L::::::::::::::::::T::::C::::::V::::AV:::::::::Y
pNG7257         :::::KH:GR:I:::::::::::::S:::::::M:::::::G:::T::::::::::::::
NP4464A         S:::::EF::::V::::::::::::::F::::DF:::::::E::::E:::::::::::::

consensus       AVNGNYDEAYDLSREVTARRGWYNRNAAVNPFQVEGKRTVGHELAEQS--RGAVPDWIVF
#oth            1.2.2..1.11.121112221..111..1..11...1........11111.12....2.1
Hmu1472         ::D:D::D:FS:C:R:A:N:E::DCS:::::YA:::L::::::::::::::AS::::::Y
pNG7257         :::::::::::::V:::EKY::::::::I::::::::::::::::D::IA::H::::V::
NP4464A         G:Q:S::::::::M:A:D:F::::::::::::::::::::::::::ET:::::::::L::

consensus       AMGDGCTIAGAWKGFREFADLGIVEECPRMLGVQAEGASAIHDAFHNHEDADAGAETQAD
#oth            2..1..11.12....1..11..2.112.11.....1..1....1.12211211211.2..
Hmu1472         P::N::GL:AT::::::::E:::::::::L::::::::T::::R:TG-:R:R::G:::::
pNG7257         S::::::::::::::K::Y:::Y:DDH:K:::::::::::::::::::::I:DI:::L::
NP4464A         ::::::::::G:::::::::::F:::T::::::::D::::::::::EFD:V::V:D:V::

consensus       SIAVGRPRNTQKACRALEASGGTAVLVSDREILEAERLLGRTEGIYAEPAGAAPIAGLRN
#oth            ..2..1.1.12...1...2...12.1.1.21..1..21..1.....1...1.112..122
Hmu1472         ::D::H:H:A::::::::D:::AT:V:::::::D:::T::::::::::::S::TL:::ES
pNG7257         ::::::::::I:::::::Q::::S:::::E::::::T:::S:::::S::::::::::VQT
NP4464A         ::S:::::::V:::S::::::::::::D:TD:::::S:::::::::::::::T:V:::::

consensus       ARDAGIIEPGESVVVVVTGTGLKDTASARRAGGGVDRIAPAIAAVADRY------AADD
#oth            .212.1111111111.1..1....11..221211..21212112.21211111112112
Hmu1472         :V:::TVA::D:ATL::::::::::::::DLVD:::HVPDTP:::P:PE::::::----
pNG7257         :L:R::::QD:T::::S::F:::::K::EK:T::::::D:E::E:EGL:GTAEEA::::
NP4464A         ::EN::::::::::::::::::::A:::M::::N::T:::::DD:::::::::::S::L