| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 8427 | VNG5136 | VNG6132 | VNG5147 | pNG3029 | pNG4036 | VNG5013 | VNG6013 | HQ3590A |
| 5439 | VNG5136 | 8525 | 8525 | 7059 | 2342 | 2337 | 2198 | 2198 | 2042 |
| 5439 | VNG6132 | 8525 | 8525 | 7059 | 2342 | 2337 | 2198 | 2198 | 2042 |
| 5192 | VNG5147 | 7059 | 7059 | 8535 | 2244 | 2242 | 2141 | 2141 | 1921 |
| 3903 | pNG3029 | 2342 | 2342 | 2244 | 8737 | 8613 | 2527 | 2527 | 2370 |
| 3893 | pNG4036 | 2337 | 2337 | 2242 | 8613 | 8738 | 2506 | 2506 | 2365 |
| 4886 | VNG5013 | 2198 | 2198 | 2141 | 2527 | 2506 | 8309 | 8309 | 6190 |
| 4886 | VNG6013 | 2198 | 2198 | 2141 | 2527 | 2506 | 8309 | 8309 | 6190 |
| 4417 | HQ3590A | 2042 | 2042 | 1921 | 2370 | 2365 | 6190 | 6190 | 7763 |
1230 symbols consensus ----HT-WLVGCS-CSELW-TAA-RDTT--CPRCR-TYRT-TLRKFAEDTDRDVLVEKRT #oth 111222322111131221132223222231112123122234123213221122333312 VNG5136 MSGH::I::::::H:::::F:::G:K::D::::::T::::R::::::::::::A:::::: VNG6132 MSGH::I::::::H:::::F:::G:K::D::::::T::::R::::::::::::A:::::: VNG5147 MSGD:PR::::::T:E:::L:::T::::T::::::S::::Q::::::::::::::I:::: pNG3029 ::::M:FHV::::D::A::IIDESG:SKAC::T:GR:HSRER::SL:SAA::E:AAQR:S pNG4036 ::::M:FHV::::D::A::IIDES::SKAC::T:GR:HSREH::SL:SAA::E:AAQR:S VNG5013 ::::--:------:-----:---:----::-----:----:M:PG::P----::V:KH:- VNG6013 ::::--:------:-----:---:----::-----:----:M:PG::P----::V:KH:- HQ3590A ::::--:------:-----:---:----::-----:----:------------------- consensus QILASRSDPRARDL------------DSLDDATDSSVIDERAYLRH-GADD-ADL--CGR #oth 211111222333321121111112232222222333222334223231211322233333 VNG5136 :::::::::::::QYRATVDDALTDY:::E::AQ::L:::A:VR::I::::A:::RSAND VNG6132 :::::::::::::QYRATVDDALTDY:::E::AQ::L:::A:VR::I::::A:::RSAND VNG5147 :::::::G::::EQYRTTVDDALATH::::::AR::L:::EVV:::L::::T:::LYNT: pNG3029 A:::::R:ESDA:::::::::::::RAYW:Q:::DP:::D:E::DGM:L::DLVDNL::E pNG4036 A:::::R:ESDA:::::::::::::RAYW:Q:::DP:::D:E::DGM:L::DLVDNL::E VNG5013 -----::G:AEPV:::::::::::::-----N::GA:LSV:S::Q-:----:---::::: VNG6013 -----::G:AEPV:::::::::::::-----N::GA:LSV:S::Q-:----:---::::: HQ3590A --------------::::::::::::--------------------:----:---::--- consensus ESSTSFRSDSGCERPDSGHDN-SFDPLGTPN-------PVAQDQGIRRIPP---GGTLSS #oth 22222343324434131324213413223221111111221322.122131121112113 VNG5136 ::T::SS:S::M:E:E:E:T::::::::I:L::::::::::A:S::S::::EQD:Q:DL: VNG6132 ::T::SS:S::M:E:E:E:T::::::::I:L::::::::::A:S::S::::EQD:Q:DL: VNG5147 ::T:--AP::AA:D:::::A:PTL::::VAL::::::::::G:P::S::::ERD:Q:DL: pNG3029 S::::TT:::STT:::::P:V:DV:VANK:QLRGSAYPDA:EEP::ALLD::::R:Q::I pNG4036 S::::TT:::STT:::::P:V:DV:VANK:QLRGSAYPDA:EEP::ALLDL:::R:Q::I VNG5013 :G:NW::DPRI:RL:R:P:F-::T:CMH::::::::::---:Q::::K:V:::::::::T VNG6013 :G:NW::DPRI:RL:R:P:F-::T:CMH::::::::::---:Q::::K:V:::::::::T HQ3590A ---------------------:----MH:Y::::::::---:Q::V:K:I::::::N::A consensus TGITYRGVQPQMREWIPDLLEDLLPTLTAAVAQF--IHDEDPDVLDHARTNGIARRLQDE #oth 112112212.1321.112..22.1.32332.23211232121431332311423211223 VNG5136 :TVV:::L:::::R:::S:::::::::::::::W::TV:Q:TLT:ED:N:E:::TA:L:K VNG6132 :TVV:::L:::::R:::S:::::::::::::::W::TV:Q:TLT:ED:N:E:::TA:L:K VNG5147 :TVV:::L:::L:R:::S:::::::::::::::W::TI:Q:TVA::ERD:EA::TA:L:T pNG3029 ::L::HD:A::SS::LG:::A::I:MTARC:QDLAVL:E:G::PS:PRQ::YEVP:FVQ: pNG4036 ::L::HD:A::SS::LG:::A::I:MTARC:QDLAVL:E:G::PS:PRQ::YEVP:FVQ: VNG5013 A:::ITE:T:RVT::::::::E:::RSIQS:RK::::RQ:::E::T:::Y:TVY::::E: VNG6013 A:::ITE:T:RVT::::::::E:::RSIQS:RK::::RQ:::E::T:::Y:TVY::::E: HQ3590A A:::IT::T:::T::::N::DN:::SSVES:RG:::::E:N:A::A:E:Y:PVL::::ED consensus -LDIDHQTWEIDGD--RDAPVEAREWVRDLVAFAVRY-AVDEDE-LD-LSGYH--ERCND #oth 213212232232212121.31112121221121111132131131223222221323432 VNG5136 :::::PG:V::::::::Q::::V:A::::::::T::-:::E::-:--:-----::VTI:: VNG6132 :::::PG:V::::::::Q::::V:A::::::::T::-:::E::-:--:-----::VTI:: VNG5147 ::E::PG:V::::::::Q::::V:A::::::::T::-::::D:G:--:-----::VAVD: pNG3029 V:AGEVAGL:A---::A::S:G:I:EA:AYLDA:A::ALLWDN:CYRAQR:FKGT:QFER pNG4036 V:AGEVAGL:A---::A::S:G:I:EA:AYLDA:A::ALLWDN:CYRAQR:FKGT:QFER VNG5013 T:RF:::E:CSTT:IWS::EA::V:Y:ES::E:::K:SD::::D:::E::E:::QQ::KS VNG6013 T:RF:::E:CSTT:IWS::EA::V:Y:ES::E:::K:SD::::D:::E::E:::QQ::KS HQ3590A :I:FE::R:HTTT:CWS::KA::V:Y:NS::E:::K:ND:N::::::Q::::::R::Y:S consensus AKRTLTTIGTGRGPLNAGRAALRAGPVALHDELEDTPQPATLVLDGE-WSG-DDRETRAR #oth 2241..111.1..12...22..221111.1322121.11212221..3.2312121.23. VNG5136 :PES::R::::::L:::::::::::::::L:V::V:::V:ATLNE::::V::TRK::::: VNG6132 :PES::R::::::L:::::::::::::::L:V::V:::V:ATLNE::::V::TRK::::: VNG5147 :PNS::R::::::LV:::::::::::A::LES::VA::V:ATLNE::::V::TRQ:::T: pNG3029 IQ:::::T::S:::F:::VD:::HSL::::A:R:-::L:V:F:::::A:TA:A::::VK: pNG4036 IQ:::::T::S:::F:::VD:::HSL::::A:R:-::L:V:F:::::A:TA:A::::VK: VNG5013 L:Q:::::S:::::::::LE::AK:::R:::::D:A:::I:::::::L::KL:::G:GI: VNG6013 L:Q:::::S:::::::::LE::AK:::R:::::D:A:::I:::::::L::KL:::G:GI: HQ3590A L:D:::::S:::::::::VE::VK::AR::N:VD:::::I::MF:::S::TL:::G:G:: consensus ALAALDVLGDALDIRLVIS-P------------ALDAAIERDHPDWTDRHLRLTETAETS #oth 1.41113.2211.11.22.1.111111111111211222221211.232114..134211 VNG5136 S:G:::S:S:::::Q::F:T:::::::::::::RMESLLVE::::::S:::N:::D:D:: VNG6132 S:G:::S:S:::::Q::F:T:::::::::::::RMESLLVE::::::S:::N:::D:D:: VNG5147 S:D:::T:SE::::Q::F:T:::::::::::::RMETLLLE::T:::R:::S::DIT::: pNG3029 ::RV::::A::::V::QM:::GVRQRVRRLTLR::::DD:A:I:A:AE:FSF:::---AG pNG4036 ::RV::::A::::V::QM:::GVRQRVRRLTLR::::DD:A:I:A:AE:FSF:::---AG VNG5013 ::::IA:::STF:V:::::::::::::::::::::::::::RY:::Y:S:::::::R::: VNG6013 ::::IA:::STF:V:::::::::::::::::::::::::::RY:::Y:S:::::::R::: HQ3590A ::T:IAA::S:F::::I::::::::::::::::T:::::::RY:::Y:A::G::D:H::: consensus YPSRAGGDGDEDA---ALAEEAWDAIRNRE-SETGRLRILGNLPADGARDRRDLKADDDI #oth 332431212332111231222..22222231121.2212.211232.212211112..21 VNG5136 :::KTDTAAG:::::::::R::::IL:E::W:G::YT:::::I::S::-T:G::A::::V VNG6132 :::KTDTAAG:::::::::R::::IL:E::W:G::YT:::::I::S::-T:G::A::::V VNG5147 H:AAPDTA::A::::::::RQ:::IL:E::W:G::YT::::::S:S::-T:G::A::::V pNG3029 :S::R:::V:::SDEGQ:D::::GWVDTNR::Q::P:TV:AH:DT::E:SV:AI:R::A: pNG4036 :S::R:::V:::SDEGQ:D::::GWVDTNR::Q::P:TV:AH:DT::E:SV:AI:R::A: VNG5013 SVES:::::QPS::::EQL::::E::Q:LP:E:S::::L:R:::IE:S::Y::::Q::E: VNG6013 SVES:::::QPS::::EQL::::E::Q:LP:E:S::::L:R:::IE:S::Y::::Q::E: HQ3590A TTECP:D::HQPS::SDQLNL::E::Q:LS:E:S::V:L:::::V::S::Y::::R::E: consensus DLSEGSIGRYVLDLEAEGLVTIDRSGRPNSVSLTALGASAAD-YVDTDGRVQHPAQSSL- #oth 3233.1121.131.11412112.122221312..31.231221.112223121.3.12.1 VNG5136 S::::::YA::D::A:T:F::::D:T::SR:V::E::::I::::::AK:S::N:V:A::: VNG6132 S::::::YA::D::A:T:F::::D:T::SR:V::E::::I::::::AK:S::N:V:A::: VNG5147 G::::::YA::E::AEA:F::L:DTT::SI:Q:::::::I:::::::E:A::N:::A::: pNG3029 AYAD:::D:::SF::::DII:V:::HAS:Q:::::::EA:QQ::::RE:NPV::S::R:: pNG4036 AYAD:::D:::SF::::DII:V:::HAS:Q:::::::EA:QQ::::RE:NPV::S::R:: VNG5013 :VQA:TV:::I::::EL:::D:::R:QY::A:::G::QV:VEQ::T::Y::I::T::T:E VNG6013 :VQA:TV:::I::::EL:::D:::R:QY::A:::G::QV:VEQ::T::Y::I::T::T:E HQ3590A :VES:TV:::I::::EF:::D:::R:QY::A:::QI:QT:VEQ:IT::N::I:::::T:E consensus ---TQSPNRGASECTPARSQTCPGDA-QEGD-RPSTAESWLAATGSASEDG-YVQWLG-- #oth 111122222211222.22333433333231.112331.312.1..2211211.111.211 VNG5136 ::::::::::T:::::QHQ:DP:::SH:L::D:V:A:::F::R::DV::::::TRF::RY VNG6132 ::::::::::T:::::QHQ:DP:::SH:L::D:V:A:::F::R::DV::::::TRF::RY VNG5147 :::::::::DTR::::QPD:EL:R::PRP::D:V:GT::F:::::D:K:::::TRF::RY pNG3029 :::-----S:::YGH:S::RK:SVS:::KR:::YPP::R::::::::::S:::::::::: pNG4036 :::-----S:::YGH:S::RK:SVS:::KR:::YPP::R::::::::::S:::::::::: VNG5013 THL:PT:QPQ::TVY::::D:-----:R::::Q:G:::D:I:::::P::GAD:::::D:: VNG6013 THL:PT:QPQ::TVY::::D:-----:R::::Q:G:::D:I:::::P::GAD:::::D:: HQ3590A THL:PTSQPQT:TVY::HMN:GK:EGEG::::::E:::E:V::::TP:DGAD:::::N:: consensus -GGTGPREIEPAGLHQRLLAGRRDRGVTLVDD-NIQRFED--------GRVSYLS---CF #oth 21211211211221.2123.11122.1121111313212.111111111....1.1112. VNG5136 S:::A:::::::T::HQ:Q:::CTE::SV:E:A:L:K:D::::::::::::::::GGPS: VNG6132 S:::A:::::::T::HQ:Q:::CTE::SV:E:A:L:K:D::::::::::::::::GGPS: VNG5147 N:::A:::::::T::HQ:G:::CTE:ISV:E:A:L:D:::::::::::S::::::GGPS: pNG3029 :DR::S::V::PV::R:FS:AK:VD:::FA:G:D:LDWT:DDDAPDGD:::::I::::T: pNG4036 :DR::S::V::PV::R:FS:AK:VD:::FA:G:D:LDWT:DDDAPDGD:::::I::::T: VNG5013 ::PS:V--LDAW:M:::Y:::::::::::::::R:E:::::::::::::::::::::::: VNG6013 ::PS:V--LDAW:M:::Y:::::::::::::::R:E:::::::::::::::::::::::: HQ3590A ::PS:V--LDAW:M:::Y:::::::::::::::C:D:::::::::::::::::::::::: consensus DDDLLVVLQWGGPLGTLGRLAGALLSDRALSKILRRSRLGSQLENIWDG-VEQFDRALAD #oth ..123.311..1.22..1.12.1.1131111.2.2211..23213232211121132121 VNG5136 :::VA:::E::N:::::A::V:T::GS::W:::::::::::S:::L:A::AD:::S:::: VNG6132 :::VA:::E::N:::::A::V:T::GS::W:::::::::::S:::L:A::AD:::S:::: VNG5147 :::VS:::E::N:::::A::V:T::GG::W:::::::::::N:::L:A::AD:::A:::: pNG3029 ::EA::I::::::VV:::::C:::F:N:M:::A:NTDA::K:WNRAH:::::T:END:H: pNG4036 ::EA::I::::::VV:::::C:::F:N:M:::A:NTDA::K:WNRAH:::::T:END:H: VNG5013 ::::F:AT::::::P::::I:::::::K::::::TP::::N:F:E:N:AV:::L::EAGE VNG6013 ::::F:AT::::::P::::I:::::::K::::::TP::::N:F:E:N:AV:::L::EAGE HQ3590A ::E:::TT:::::IP:::::::T::::K::N:V:TP:::::EF:K:DNSV::KLE:EAGE consensus VARFGAQIGWMSSDEEEDYDGWRERIGAVRSLLLEQVGRFDDLD-SEARSALLRDLHGLA #oth 123312.2..2121.22.1121.1.113..121.33..21121.1412122.211.1..3 VNG5136 ::K::::M:::::R::S::LSY:::LE:::CS:::D:::::::::Y:Q:::::SK:I::: VNG6132 ::K::::M:::::R::S::LSY:::LE:::CS:::D:::::::::Y:Q:::::SK:I::: VNG5147 ::T::::L:::::R::D::LSY:::LED::CS:::E:::::E:::H:Q:::::SK:I::: pNG3029 :LIQAK::::L::::L::L:N::::::::::M::S:::D:::::::GLQAQ:M::::::L pNG4036 :LIQAK::::L::::L::L:N::::::::::M::S:::D:::::::GLQAQ:M::::::L VNG5013 II:R:H::::F:E::-:::::::::::S::::C:Q:::ELTNS:DV:::TE::::::::V VNG6013 II:R:H::::F:E::-:::::::::::S::::C:Q:::ELTNS:DV:::TE::::::::V HQ3590A :I:W:H::::FGK::-:::::::D:::T::::C:KR::ELTNS:DT:::TE:I::::::I consensus ASATQLYHAAGYDVTINIRVPDTKQLRRDERRYGRFLDFARYTIAKQGVYRGPDGVHSGY #oth 21.121.2...211.112.1..332.111131232..2.1.1112..32.1222.1..2. VNG5136 TT::T::::::::L:VHL::::S::::::DD::::::A:F:SVV::::::::::::::I: VNG6132 TT::T::::::::L:VHL::::S::::::DD::::::A:F:SVV::::::::::::::I: VNG5147 TT::T:::::::EL:VHL::::AA:::::DG::::::G:F:SVV::::::::::::::I: pNG3029 C::MNV:D:::L:::::::L::PDA:::N:NQ:EK:::::::::T::AG::DDY::::W: pNG4036 C::MNV:D:::L:::::::L::PDA:::N:NQ:EK:::::::::T::AG::DDY::::W: VNG5013 :::::::Y:::V:::::V:::::GM:IS::::LDD::G::::::P::S::----:I:::: VNG6013 :::::::Y:::V:::::V:::::GM:IS::::LDD::G::::::P::S::----:I:::: HQ3590A :::::::Y:::V::::::::::::M:I:::::CND:::::::::P::PA:----:I:::: consensus RMQREDRPEKLKRRLGYEIDDADPTAELTASWVFAGDGM-GDLHDDIEDAIDEEAHRLRE #oth ..22.2.22..11.12.1111211312.11...1212231421331114.234.2312.1 VNG5136 :::::R:S::::::::::::PG::R::::C:::V:V::TG:EVAS:::G:LCV:D::V:: VNG6132 :::::R:S::::::::::::PG::R::::C:::V:V::TG:EVAS:::G:LCV:D::V:: VNG5147 :::::Q:A::::::::::::PGE:E::::C:::V:V:EAGDEVV:E::A:LRA:D::V:D pNG3029 ::CI::::Q::RA:SE:D:::T::V:D:L:::::T:P:V:S::LP:VQE:V::::T:::: pNG4036 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HAALGTQDRGPRACPHDVAAAMQALESKDRNSDFLDVRALARGLATLPANRLLPEL---- #oth 211.1121121221121.12112221122422.3111412231111..22111.2.1121 VNG5136 :::::::E:A:--S:F::::V::::::::EP::K:::G:::::I::::::::::S:FDEG VNG6132 :::::::E:A:--S:F::::V::::::::EP::K:::G:::::I::::::::::S:FDEG VNG5147 :::::::E:::--S:F::::V::::::::DPA:E:::S:::::I::::::::::S:FDDG pNG3029 E:::AAA::::DP:L--::D:LDS:::R:SV::R:::D:VEAA:::::SEAIF:T::::: pNG4036 E:::AAA::::DP:L--::D:LDS:::R:SV::R:::D:VEAA:::::SEAIF:T::::: VNG5013 LRV:::E::PH::::::::E::LHVAQSS::Y::IT::DISY::SN::TK:::::::::: VNG6013 LRV:::E::PH::::::::E::LHVAQSS::Y::IT::DISY::SN::TK:::::::::: HQ3590A LRV:::E:QPH:::::::VE::LHIAQSTQ:Y:::TIQDVSF::SN::TK:::::::::: consensus ---PPAAQKMLRALLGSDDPMGRSDLIETA--SESSYDRYINRLRALDIVER---VGHGR #oth 1111112211121.13132122.311222211.21.11.1222.1.2111.21123.212 VNG5136 ERPKL:I:::V:::::::GAVS:G::V:VS:::QN:V:::LQ:::::::::::::::P:E VNG6132 ERPKL:I:::V:::::::GAVS:G::V:VS:::QN:V:::LQ:::::::::::::::P:E VNG5147 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