|
Pairwise sequence scores | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 6657 | HVO_B0014 | pNG7366 | HQ1760A | pNG7370 | HQ1761A |
4023 | HVO_B0014 | 6571 | 3053 | 3012 | 3252 | 3169 |
4959 | pNG7366 | 3053 | 6734 | 5734 | 3284 | 3250 |
4927 | HQ1760A | 3012 | 5734 | 6777 | 3298 | 3292 |
4775 | pNG7370 | 3252 | 3284 | 3298 | 6614 | 5226 |
4718 | HQ1761A | 3169 | 3250 | 3292 | 5226 | 6595 |
883 symbols consensus MSTSDS-LPERADTVIVGAGAVGCSIAYHLTELGREDVVVVDQGPLPTTGGSSTHAPGIM #oth .3132213.2212..11...2...12..1.211.11..1.2.1..112....12....11 HVO_B0014 :N:WST:F::::G::V::::C::::A::::A:S:::::::L:R:::FE::::TS::::LV pNG7366 :EPT:::::TQ:::::::::I:::N:::Q::::::::::::::::M:::::::::::::: HQ1760A :DP::::I::S:G:::::::I:::N:::Q::K:::D:::::::::M:::::::::::::: pNG7370 :::ETP:-:S:::::VI::::::::V::::::::A:::::I::::::V:::::V:::::: HQ1761A ::::::N::S:SR:::I::::::::V::::S:::A:::T::::::::V:::::V:::::: consensus FQTAESKLQTQFANYTRRLYSDAG------AYNETGGIEVARSEERMDFLQRRVEWAKSY #oth ...123.32122.4.11211112111112121212....1.11.1.11..2.12.21211 HVO_B0014 ::::GN::M:EM:S:::D::DGF:::::::DFRTC::::::YT:D:W:::K:KR::GQ:: pNG7366 :::::P:VLS:::D:S::::::LEGADGHQ:::::::::::::::::::::::::Y::AW HQ1760A :::::A:ELS:::::S:KV:::LEGADGQQ:::::::::::::::::A:::::::H::AW pNG7370 :::SP::I::KT:H::S::L::::::::::V:D:V:::::::::::::::R::::::T:: HQ1761A :::SP:::::KT:Y::S::L::::::::::V:D:V::::L::::D::::::::A:::T:: consensus GIPEPQLLSPEEVTEHLPLVDADQILGGYYSPTDGRVDGVAACDALAEEARERGAEFYGH #oth .1211...1.2..1221.1113.2.2....1.1..211114.22222121422113.111 HVO_B0014 ::D:G:::T::::ESRV:QIN::V:Y::::V:S::KA:A:S:AESM::::::A:V::::: pNG7366 ::ED:::::::::::::::::::::K:::::::::Q:S::V::::::R::M::::K:VP: HQ1760A :::D::::::::::D::::::Q:::::::::::::Q:S::I::::::R::ID:::::VP: pNG7370 :L::::::::A::::::::::K:E:::::::::::::::IG:LQWYM:HST---:S:::N HQ1761A :L::::::::Q::::Y::::NE:E:::::::::::::::I::LQWYI:QSE---:D:::N consensus TEVTDLDVTNGSITAVETENGRIECNEVVVATNIWGRQLGELAGVDLPIAPVEHQYTVTE #oth .111.221221213..1.22.1.2121211...1.121211221211.22.11...2111 HVO_B0014 :::::I:T:D::VD:::::H::::AD::L:::::::PLF::MV:T:I:LV:CA:::L:SD pNG7366 :RTE:VETE:::VQ::I::::S:::::::::::::A:::::KLD:H::VT:::::::M:: HQ1760A :RTE:VE:::D::::::::::::::::::::::::A:::::KL::HI:VT:::::::M:: pNG7370 ::::::::SG:E:N::::AQ:::D:ERA:I:::N::Y:T:Q:::L:::::::::::V::: HQ1761A ::::::T::D:R::::::N::::Q:DRC:I:::N::Y:TAQ::D::::::::::::V::: consensus PLDELAGADSDIGDNP--ENLE-VPGER--AERLLEGPDRPILRDQDNSLYYRTHGDAYG #oth 211..23423312222113221112132212232221131121.1..111.1.2..122. HVO_B0014 E::::E::ERE:----::----:-----::--------EQ:L::H::H:::::Q::ER:: pNG7366 S:::::DSAV::T:H:LF::Y:N:S::K:::K:::V::::::::::::AM:::N:::S:: HQ1760A S:A::SEN:T::T:H:LFD:Y:N:S::K:::K:::V::::A:::::::AM:::::::S:: pNG7370 :M:::::VE:SV:::T::TG::::::D:SI::YMS:::HQ:VG::::H:::F::::::L: HQ1761A :MA:::AT::N::A:T:::G::::::N:DIQ:HMS:::N::VG::::::::F::::::I: consensus IGSYNHEPLSVDPQDLGGNDEDGQAG----SVREFTEEHMNTATHPDR-DKSARQAFDEL #oth 2.....12121..33212122232211111.111..31.2232..1211212121.21.. HVO_B0014 :::::::S:L:::A:IY:P:KLDDL:LEYP:L:::::::FYEN::::H::R::FD:AS:: pNG7366 ::::::D:IVP:::::::::P::EQ:::::::H:::DY:::N::::::P::AP:::S::: HQ1760A ::::::D:IVP:::E::T::P::EQ:::::::H:::::::::::::::PH:PP:::S::: pNG7370 M::::::T:::::EAM:K:S:EH::-:::::::G::K::WE:P::RG::::::K:::::: HQ1761A L::::::T:::::NSM:T:T::S::-:::::::G::R::WEKP:::T::E:::K:::::: consensus LPATADAELEAKENGMFAFTPDGMPAMGPTAQYDGLWTALAIWVTHSGGAGRILAEWMEN #oth 1.11313.22322..1.211.1.1.23.122221...211.1.1.11..1.211.1...2 HVO_B0014 V:GFE:C:WTSAI::::S:::::::IL::DEDTE:::W:::V:::Q:::::D:V:S:::D pNG7366 :::::GK:::H:Y:::::ES:N:L:V:::VQE:::::::A::::::A::::KA::::::H HQ1760A ::::DG::::F:Y:::::ES:N:L:V:::VE::::::::A::::::A::::KA::::::: pNG7370 ::::Q:V:Y::T:::I:V::::::::V:E:::V:::::G::::W:::::Y:::::::::: HQ1761A ::::::::YA:T:::I:V::::::::I::::EV::::S:::::W:::::Y:::V:::::: consensus GVPRLDDGPVDTSGCHVRRFDEHAGSWDYARDRGAERYRQVYNIVHPRWQ-PDDQRDLRR #oth .2...22122132131.2..32.2.13112212.122.22..2211.11111241.31.1 HVO_B0014 :T::::GSR:NA::A::S::QS:T::RE:TYG:::QQ::E::QL::::E::::G::A::: pNG7366 :::::LS::I:LAH:D:N:::::E::::F:::I:G:E::I::::M::K:VWTET:::I:: HQ1760A :::::::::M:V:H:D:N:::::E::::F:::I:::E::I:::VM::K:VWT:M:::I:: pNG7370 :::::PS:::::G:I:::::EP:::EK::FV::::K::E:::S::E::::::::H:T::T HQ1761A :I::::::L:::::V:::::AP:::EPE:FV:K::K::Q:::S::E::::::SEH:G::T consensus SPFYHRQKELGAEFYASAGWEEPQWYESNADLLDEYADRIPDRDGWEGINWSPIEGAEHL #oth 1.111411211..11212...2.1.11..12.22214231.1131.22211.1121..11 HVO_B0014 ::::D::AD::::::D:D:::V:::::::ET::ET:D--V:::PD:LSQ:::KVQ::::Q pNG7366 T:M::TH:KYD::LW:E::::::H:FD::::::A::G::::::E:::AKY::::::::A: HQ1760A T:M::SH:::D::LW:E::::::::F::::::V:R:T:E::E:N::::KY::::::::A: pNG7370 :::::Q:::::::::Q:G:::T::::::::N:VET:E:::::Q:::Q:::R:K::A:::: HQ1761A :::S:K:A:::::::Q:G:::T::::::::::A::H:EA::EQ::::S::R:::T::::: consensus HTRENVGMHDMTSFNKIEVEGSGAGEFLQQLCTNDMDIDPGDVRYSLMLNEGGGVLADIT #oth 12.12.112...2.2212.3.3113312.3211..11213.311.1111..1..11..1. HVO_B0014 :L::K:::V:::T:TP:::S:P::L::::G:L:::::VT::RM:::A::::D::::::L: pNG7366 NV:N:::L::::::::M::I::D::::V:Y:::::::::V:::K:T::C::::::R:::: HQ1760A NV:::::L::::A:::M::A:::::T:I:::::::::L:I:E:K:T::C::::::R:::: pNG7370 ::::K:S:F:::T:SS:M:::E:SQA::::V:S::::L:T:Q:::::L::::::I::::: HQ1761A :::NA:S:F:::::SS:I:::VD:ESY::RM:S::VA::::::::::L::::::I::::: consensus VTRLDDERYLVLTGGGESGNNHGAWVREHAPDD--VSVNDEESSLAAIGCTGPNARKVLS #oth .22112211212.1.121223.24112221.2211.3.2332112221122..21.11.1 HVO_B0014 :A::G:::FVLF::::S:ATL:SR::T::::::GS:D:TAHV::RTG::VF::DS::::: pNG7366 :::T:ED:::L::T:R:V::::V:::::QS::::::V:::VT:::::MV::::::::::: HQ1760A :::T:TN::::::T:R:V::::VS:::K:::EG:::I:::AT:::::MV::::::::::: pNG7370 :VK::::EFM:T::::N:PGI::GHLEDE::AT:::::HV::GAKST::LW:::::LL:Q HQ1761A :VG::::::M:T::::S:PGV::T:L:::::ET:::::HI::GAKST::LW::QS:LL:Q consensus RVTDADLSNDAFPFFSAQQMYVGNVPVTALRVSYAGELGWELYAPSEYGERLWETLREAG #oth 32112.11112..111111211131..11..1..1......211.2..121..13141.. HVO_B0014 DLVE::::::E:::Y:::ET:L:SI:::M::L:::::::::I:::T:::SQ::DAI:::: pNG7366 K:::V:::D::::::TS::FF:K:I::::::::::::::::F:T::::::::::HIM::: HQ1760A E:::I:::D::::::TS::F::K::::::::::::::::::::T::::::::::I:L::: pNG7370 :C::::VT:NG::Y:::K:::::D:::I::::::V:::::::W::T:::Q::::::QD:: HQ1761A ::::::V:::G::Y:::K:::::E::::::::::V:::::::W::V::A:::::::W::: consensus EDYGIRPMGNGALDSLRIEKGFRLWGTDLDTEHNPYEAGLGFAVDLDTDFIGKEAL---- #oth 221121.2.31..31212...11...2.121221.2211121.1.11.1.1..2121111 HVO_B0014 :E:D:A:V:WA::::TSM:::::::::::TP::::::::I:::A::::::V::A:::::: pNG7366 :E:::::Y:::::N::::::::::::K::H:::::::::::W::::E::::::::V:::: HQ1760A KS::L::Y::::::A:::::::::::E::H:::T::QSN::W::::::E::::D:IKSRQ pNG7370 ::L:V::::G:::S:M:L:::Y::::::I::DS::F::::P::::M::E::::::::::: HQ1761A Q:LDV::::A:::E:M:L:::YA:::::I::GAT:DA:::S:::::E:::V:::GV:::: consensus ---AAAARGDGIDSKIAPLTLDDETAIVLDGRPVFD--DDEAIGYVQAADYGYTIGACIA #oth 1112322233323332211...1231232212.1331111222..322121..1211211 HVO_B0014 :::V:DKND:SPSDR:V:I:::E:E:V:DA:H:::V:::::VV::CCR:::::::D:G:: pNG7366 :::::::D::N::H:V:C::::::D:V:::NK::L:::G::T:::LHS:E::::E:::V: HQ1760A QQP:T::D:GTRAKQV:C:::::PN:SI::N:::::VN:::TL::IHS:E::::V:::V: pNG7370 :::-ET::EK::E:::T::::::S:D:M:S::::TK:::GD:::::::GN:::S:DES:: HQ1761A :::-Q:H:AE::::ILT:I::::S:D:LSS:::IHA:::GN:::::::::F:::::ES:V consensus YAYLPPEYAEAGTSVEIQCEGERYDATVRDEPLFDP-RDKIIR #oth .2.1.211.22.11.1.22..1313....21..2223122212 HVO_B0014 :::::E:::SS:QD:::RY::DAHP::::SG:::::D:::M:: pNG7366 :T::::::::P::::::LY::::::::::E:::VS-:------ HQ1760A :S::::::::P::D:::LF::D::A::::E:::I--:------ pNG7370 :T:V:T:H:::::::Q::::::T:::::::::::::T::R::K HQ1761A :::::TA::D:::::Q::::::N:N::::::::::QE:E::::