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3 genomes BUD2820 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7357

rrnAC3451

HVO_B0007

- - - - -

HQ1861A

Pairwise sequence scores
Consensus score1617 rrnAC3451 HVO_B0007 pNG7357 HQ1861A
810rrnAC3451 1662 595 557 589
846HVO_B0007 595 1613 600 613
1229pNG7357 557 600 1633 1238
1267HQ1861A 589 613 1238 1641

224 symbols
consensus       -MSITAKVHIEHERLALTPTLQSLEDIAIRVISQGATDPGSGRFFFHIEYADRDALEAAL
#oth            11112112211.2111.11.2222221311111123...2113.1131123.2231.23.
rrnAC3451       MTD:K:V:RV::PDIV::E:VTHAP:SNV:SV:EAG:::T:::::Y:::SP:FQQF::G:
HVO_B0007       :::LITVAD:A:DD::::::I::EAASE:D::::S::::ET:L:::VVKG::VS:F::::
pNG7357         :::::T:I:::::::::V::::N:::::::::T::N:::::TV:P:L:::R:::R::EM:
HQ1861A         :::::::::::::::::V:::N:::N:Q::::T::T:::::TT:P:F:::H:::E::TT:

consensus       DVDATVASYE-LVDERDETAIYYIEHTPETKLISPVITDVNGFLLDT-ENDGNGWLVRLL
#oth            22.3.1322111122122221.2111.121211.1111321.222121111121.21112
rrnAC3451       QN:S:IGEF:RVIET::NE:::SF:Y:D:A:IL::::SSA::VI::M:::::SA:ILTIW
HVO_B0007       E::H::SDWQ:::S::E:S:V:R:G:::D:I:L::I::ELG:LM::ACS::TA::R:::Q
pNG7357         :A:P::Q:::::::WT:Q:G::::::::K:::::T:V:::::::VH:::TK:::::::::
HQ1861A         :::::::::::::::TG::S::::::::::Q:::T:V:Q:::::IH:::TK:::::::::

consensus       LPDREALNAIWEYANENDISLDIIRIYRNDDAGGESSAGLTDEQREALQAAYEHGYFEEP
#oth            111.2..232.2.231.1.22112122323232122231...2.12..33.212...2..
rrnAC3451       M:E:T::AHL:D::Q::::DI:LL:V-NEYASL:NTD:::::S:::::LV:L:T::::::
HVO_B0007       :S:::::SEV:V:CEA::::FELN:MF:Q:GWMNGEPSK:::A::D::V:::::::::::
pNG7357         ::::::::T:::::::::::::::E::G:T:T:::::Y::::::LT::IT:::::::G::
HQ1861A         ::::S::::::::ST::N:T::::E::S:E:::::::F:::::::::::I:FRE:::N::

consensus       RDASLSDVADDLDISSTAVSGRLRRGMRNLIAATIADRDQ----
#oth            .222.211123111.21.2..11...222.12121313332221
rrnAC3451       :N:T:::::A:::::QP:A::L::::IKR::ISSLR:D:GPPN:
HVO_B0007       :E:A:D:LSEV::::P::::::I:::TAE:VESILL:E--::::
pNG7357         ::I::NE:::EIGL::::M::::::::::::::::I::EE::::
HQ1861A         ::V:::::::K::L::::::::::::::::V:::::EHT:THSD