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3 genomes BUD2879 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_1997

Hbo1870

- - - -

HQ3083A

Pairwise sequence scores
Consensus score1844 HQ3083A HVO_1997 Hbo1870
1308HQ3083A 1945 829 862
1195HVO_1997 829 1845 905
1313Hbo1870 862 905 1890

277 symbols
consensus       MQTSSSDPDAADADGQ------------LRSLAVAIALAIAGIAIGAALVFAAAIALALA
#oth            22.2112.12122222111111111111111121.121112.222.221.1222221221
HQ3083A         -M::::::SP:::::LTGPSGTSVAFGI:W::I::GGV::I::I:::V::A::::G:QT:
HVO_1997        VS:TTRF::L:-----::::::::::::-::FLA::::GGG:LVV:TI:::ITQF:A:S:
Hbo1870         :::V::E:::SSPSS:::::::::::::::A:::::L:::::P:L:I:F::LVSVP:V:T

consensus       GIEITPLLNIVISLALLTGGGFGGVALAYLRYRGEDRSYFGIQIPSLRDIAAAGGGYVAA
#oth            1111..112112..21111211..1.12.11..12121.1.222.11..121222..111
HQ3083A         A:T:::::Q::L::::A::V::::::::::W:::SGIR:I:F:::::::::FSF:::I:S
HVO_1997        :V:L:::ALV:T::I::Q:IA::::::V:T::::L::::::VSM:::::LV:VVL:::T:
Hbo1870         ::::::I:::S:::VF::W::I::M:FL:::::N::L:::::HL:GP:::L:::I:::::

consensus       LALAISAAALVSTIGVETGPNQAAQAGMENPEVLLLLIPASFLLIGPGEELLFRGVVQNR
#oth            .2122221211.12111112.111121111..1....1.....1.11.....1..1..1.
HQ3083A         :::L:T:::II::::A::A::T::::::::::I::::::::::::A::::::Y::I::::
HVO_1997        :VA:FVG:F::::F::QA:S::VTEIAAQD:::::::V::::::::::::::::::::::
Hbo1870         :G:GY:SVI:::QLN::::T:::::L:::::::::::::::::F::V:::::::::::S:

consensus       LRESFGPAIGIALASAIFAAIHYFALAGAPQARLVSISILLLPSVVFGTVYELTDNLLVP
#oth            11.1121221.2...2...1..11112.2121..11.1..2..11...11..1.1.12..
HQ3083A         :C:TLPVP:A:I:::L:::S::::S:::::::::::::::V::TL:::::::::N::V::
HVO_1997        I::::::VP::::::::::::::V::T:GAGG:::T:G::F::::::::A::::::IT::
Hbo1870         :::::S::V::L:::V::::::F::IG:T:M:::T:::::::::::::I:::Y:::::::

consensus       ALIHGAYNATLFSLLYLAIKF-----GGVPAQTGLIF
#oth            211....1..1.111.122.111111.1112212121
HQ3083A         V:V:::::::::::::IT::::::::::RL:::PG:V
HVO_1997        ::::::::::::::A::VF:LTEMSP::::--:::L:
Hbo1870         IF:::::D::I:FF::::V::::::::T::QESF:F: