3 genomes BUD2899 3 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC2866 - - Hmu0373 - - - HQ1466A

Pairwise sequence scores
Consensus score	929	Hmu0373	rrnAC2866	HQ1466A
668	Hmu0373	931	496	519
695	rrnAC2866	496	945	573
742	HQ1466A	519	573	981

133 symbols
consensus       MERERASTGTEWEAQVGYSRAIRAGDTIRVAGTTATDDAGNVVAEGDPYAQTAHAIDIIA
#oth            .1.11211..1..111.....2.2.111211..1.1.22.2..12....1.121122112
Hmu0373         ::::TVDS::::::E::::::V:V::R:E:S::::::E::G::GV::::::A:K::EN:E
rrnAC2866       :R:::T::::A::Q:::::::::T:::V:::::I::::G:E:::P::::E::K::FG:VS
HQ1466A         :::Q:::::::::::N:::::L:::N::YI:::::V:LD:::::::::::::Q:IL::::

consensus       DALAAAGAALEDVVRTRMYVTDIANQEAVGRAHREAFGDVRPAATMLEIEGLADPELLVE
#oth            1..1221.211...1...11.1.22111..1..2.2.1.1..111.21111.12.111..
Hmu0373         T::ET:::G:::::::::F::E:E:Y:::::::::::::::::TS:Y:::R:V::D::::
rrnAC2866       :::::LD::I::::Q::::::::DD::R::E::S:F::::::V:::V:VS:::T::AA::
HQ1466A         ::::DV::N:D::::::::I::::H:D::::::G:I:A:I:::::::Q:::::E::::::

consensus       VEAVAELE-----
#oth            1..1.22.11111
Hmu0373         :::::IS::::::
rrnAC2866       ::::::V::::::
HQ1466A         I::E:K::DINGS