Home |  Text search
3 genomes BUD2974 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- - - - -

Hut2408

-

NP3874A

HQ3275A

Pairwise sequence scores
Consensus score10268 Hut2408 NP3874A HQ3275A
7206Hut2408 10286 5658 5376
8056NP3874A 5658 10278 6388
7875HQ3275A 5376 6388 10365

1379 symbols
consensus       MSSDTSQTDADA-SDSRQPRTESTTFINTSGGLLTEQLASKLRQRQCEESAVRPETFALP
#oth            ..11.221122211212211121....211.....11.21...1121211..1.1..22.
Hut2408         :::::-------::::I:R:L:E::::EPN::::::::IQ:::NEK:S:D::Q:K::QY:
NP3874A         ::I:::S:::E:E:S:ST:::G:::::::::::::DE:V::::::H:G::::::::::::
HQ3275A         :::Q:T:::T:M:GEN:I:Q:S:::::T::::::::::::::::::T:Q::::::::MM:

consensus       GDDPPEESALEAEIGDAWDDLRERWDELTMDNELFGMDVSDARRKWILKLFRELGFEPVF
#oth            1221121121.21.111.12.1.....1.1111.11.1.....21...1..21...1.11
Hut2408         ::P:STT::::GH:SE:::::E:::::V:R::::Y:::::::::R::::::E::::D:EY
NP3874A         NTE::::ADI::::::T::M:::::::::::ET::H:::::::T:::::::QN:::::::
HQ3275A         :G:A:S::E::N::::::ST::::::::::S::::::S:::::N::::Q:::::::::::

consensus       QRENLEAGGIEANLSHKGWPDGE-IEAYGEMQGRTAPILHTVEPDQDR---DQKPEGAPR
#oth            .11..1..111.....1...111112211.121111.11..11.2122111.21111.21
Hut2408         :QA::S::EL::::::F:::RRDSVT:NS:TPDTIP:V:::IK::K::PLD:GDHQ::VG
NP3874A         ::::::::::::::::::::::::::S::::E::::::I:::::E:KL::::E:::D:::
HQ3275A         ::::::::::D::::::::::::::GD:::::::::::::::::G:QI::::::::::S:

consensus       GAKSPHDTLQEFLNASDAHDWAVVTNGLTLRVLRDYYHTYTRGYVEFDLENMFTNRNYGD
#oth            121....1..11...11211.11..1..1..1...1........1......1..1...1.
Hut2408         RQQ::::E::RY:::TEDVQ:SI::D::K::::::::::::::::::::::I::::::D:
NP3874A         :::::::::::::::::E:::::::::::::::::F::::::::::::::::::S:::::
HQ3275A         :T:::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::I:::::::::::::::

consensus       FRALYRLCHATRFIEPVIANEED--VETPLEQLYQVALSTGVKVGQDLQSNVVSAIETLG
#oth            ......1...1...111222111111.1.1.1...1..1..1.1.11......1.1....
Hut2408         ::::::I:::S:::PRGSG::--::A:::I:S::::::A::::::E:::::::E:L::::
NP3874A         :::::::::::::::::V:ED::DD:::::::::::::::::::::::::::::::::::
HQ3275A         ::::::::::::::::::TD:::::::I:::::::I:::::I:I::S:::::::::::::

consensus       TGLLNQEIREYLQEGGEDEAKEYYQEVLRLVYRLLFLLYAEQRGMMASRDSLYTDEYSIT
#oth            1.1......11.2...121.11...11.21.......11........1.21...2...11
Hut2408         N:F:::::::A:E:::QEA:QA:::DL::I::::::::F::::::::D:GD:::K::::S
NP3874A         ::::::::::::K::::K::::::::::L::::::::M::::::::::::::::::::::
HQ3275A         :::::::::G::::::::::::::::::S::::::::::::::::::::E::::E:::V:

consensus       ALREKAETRRDGSDRNTDLWHGLQSTFRLVEQG--NDELGVPCYNGMLFDSDRLELVSES
#oth            2..11..1.1211.11....1..11..1..12.11211.1.11...1...122.12.111
Hut2408         ::::R::-:KQSQ:HQ::::E::KV::H::G::VTEED:N:SG:::G:::DEK::F:QDA
NP3874A         N::D::::::S::::::::::::::::::::K:::D::::::::::::::::::DW::::
HQ3275A         S::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::GN:::::::

consensus       ECSNDDLLDAIEDLTLVEQEGTRQRISYADLGVEEIGSVYESLLEFTPRLATEAIELEDR
#oth            1.1..11.11.11..11.21.11..........1...1..........2..1111..1..
Hut2408         T:D::AI:S::HN::H:::Q:YQ::::::::::D:::A::::::::::Q::ET:L::D::
NP3874A         :::::::::T::::::I:H:::::::::::::::::::::::::::::K::::V::::::
HQ3275A         ::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       KVSRGQFYLDDRGTERKETGSYYTDPGLVQELVQSALKPVVEDRLEDADTADEKEDALLD
#oth            21.2.1.......1..........1.1..1..11.1.....1......1.22.1.1....
Hut2408         SI:::::::::::M::::::::::K:E::D::IE:::::::N::::::::KE:::E::::
NP3874A         T::H:E:::::::::::::::::::::::::::::S::::::::::::T:T::Q::::::
HQ3275A         :::N:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::::::

consensus       IDVCDPASGSGAFLIAANNFLGQRLARIRSDSNYPPEDQIRRARRDVLQHCIYAVDLNPM
#oth            .2.....1.............11...1...111..1.111.2...1.1...1.1......
Hut2408         :::::::V::::::::::::::K:::E:::::A::D:ETV:Q:::S:V:::L:G::::::
NP3874A         :T:::::::::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HQ3275A         :S::::::::::::::::::::::::::::GG:::::::::E::::::::::::::::::

consensus       AVELAKVSLWINSAVEDKPLNFLDHHIKCGNSLIGTNSELIEGEFPVDAYETSGGRDWHV
#oth            .................1..1....1..1....1..11..11111...........1..1
Hut2408         :::::::::::::::::Q::S::::R::Q::::L::TP:::AEGL:::::::::::E::E
NP3874A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::::::::
HQ3275A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       GNEIRKRVRSENRERSKGSSESSLRNWG-ADREEYVDIAEQIEEIEEEDAEDIRKKAQLY
#oth            ...1..21.1..1111.1.1111122.11222111.11.11111.1.1121..21.21.1
Hut2408         :::V::M::::::DL::D:QLQTGL::SWD:HD:H:EL:NE::G:D:::IT::EE::E:F
NP3874A         ::::::Q::N::K:::::::::::QQ::::SK:::::::::LD::::::T:::K::R:::
HQ3275A         :::::::I:::::::A:::::::::E:::IG::-:::::::::::::QG:::::::K:::

consensus       DELRQSEAYQQEKLAHDVWTAAFYWPMDGSADEYPSPSTIEKIRRNSPPDNER-------
#oth            ...22.1111111..1..........1...11.....11.111..111112.11111111
Hut2408         :::ES::SLRRDR:::::::::::::L::::::::::RS::RV:::P:ENL::SFDELDG
NP3874A         :::Q::::::::::::::::::::::::::TK:::::::::::::::N::D:A:::::::
HQ3275A         ::::E:D::::::::Y::::::::::::::::::::::::D::::S::::::::::::::

consensus       FRNLCERAIEIAEQQRFFHWELEFPEIFSDSNDGFDCILGNPPWEKMDAEDKEFFAVRKP
#oth            1221221221..11.1....1....11112122.....1......1222121.1..1211
Hut2408         :ESM:K::V::::R:S::::K::::AVY:-::G:::::I:::::::::F:EQ::::::::
NP3874A         LQE:VTQT:::::::::::::::::::::GHSS::::::::::::TFELK:::::::E::
HQ3275A         ::::K::VTQ::R:::::::::::::::A::K::::::::::::::VK::Q::W::GKRE

consensus       DIANAGTKAKREKQIEQLQDTDPDLYEAYQQEKRAAESASKFIRESGRYPLTGRGDINTY
#oth            2.12121211.212.11.1211.1..1212111122.1111.11.....11112.221.1
Hut2408         E::::P:S:::SEM::N::::::E:::E:::AAE:::DTMN:M::::::::::::IM:::
NP3874A         Q:VE:::P:::::L::::EQ:::::::R:ER:::SL:::::::K:::::IR:NS:KTS:H
HQ3275A         :::SSTS:TY:T:::N:::EEN::::Q:WK::::NS:::::::::::::::S:T::::::

consensus       ALFAELA-LDNIDPNGRSGIVVPTGIATDANTQNFFRELVEENRLISLFDFENKRGLFPD
#oth            22.1..111211212121.1111.11111221121.2.1.111..2111..2.1211..2
Hut2408         :::::::::S::Q:DSLT:M:::::::::::::Y::::I:::R::K::::::::K::::G
NP3874A         GP::::::::::S:::Y:::I:::SLVMSSSSKD::K::::D::::KI:::I:T-:I::E
HQ3275A         PV:T::CGIEIL:DI::::::IK::::::YY:::L:S:::S::::V::Y::V:::N::::

consensus       VARRYKFSLLTISGSARKQEQFELAFHLDEIDQLRDDERRFRLSAEDIELINPNTKNCPT
#oth            122111.1..121..221222..22.2121212.212.121211211.111....11..1
Hut2408         :DS::::::::L:::D:::SS:::::Y:I:P:::Q:S::::K::R:::::::::::::::
NP3874A         IH:E::::::A:::::IVS::::MG::::::EG::::::I:EITP:E:::L:::::T:::
HQ3275A         ::T:ER:C:::MT::GN:VPE::FS:FNWTL:E:HEK:SKY::::S::QK:::::N:::V

consensus       FRTKADAELTLSLYNRAGVFQNDAEERNPWGINIRTMFNRSDDSNLFS--TEEELEDNEC
#oth            .2112.111.11112221112.22111...112221112211..21.111.211.22222
Hut2408         :ES::::::::E:::SV:::K:T:::::::S:E:SR:::T:::::::K::::T:::Q:SW
NP3874A         :::RS:::::::IFEN::::::ESRGE::::V:L::L:Q::G::D::::::S:::V:DG:
HQ3275A         :Q::R:RDI:I:::S:HPTLI::V::::::::TYH::VHMT:::SI::DN:L:K:KTE:H

consensus       NLNRNRFIENNNDLFIPLYEAKLINQYDHRFSTFEGVPQAE--ARRANANRLAAERKDDP
#oth            2122121212222212..1.1.121.111111.1..112221122221222222.21111
Hut2408         ::TG:K:-:KGS::Y::::::::V::FN::Y:::::::::::::DKG::V::G::EL:K:
NP3874A         H:E::::VC::GQT:L::::P:Y:H:::ST:A:Y:::SGDH::-EDK:PKEF:L::::::
HQ3275A         EP:NLGI::TD:KK:Y::L::::F::::::::::::I:KEKRLG:::GT:KPTP:Q:S:T

consensus       NREILPRYWVSEKEYQDKNGD-----DWHLAVRNITN-ATNRRTVIATILPGVPAGNNAK
#oth            2121.....11.211121211111112.1111.1112111.2..1.2111.111212222
Hut2408         ::LA:::::L::S::::::::::::::::::::D:::::::E:::::S:I:::AT:ETL:
NP3874A         E:Y::::::::::::TS:S:::::::G:::::::::K:S:::::::S::::::::DH:FY
HQ3275A         DY::::::::N:PDF:EQLSNLNWDRE:IFSF::VGGA:S:S::A:G:V::MY:C::S:P

consensus       QI---EGNDADNSLLLLAILNSFVLDFAARQKVGGANISAFILKQLPIPSPNRFE----E
#oth            221111122112.1.11111..111...11.1111222121111.1.1.1.121111111
Hut2408         :::::S:QS:EE::::::C::::T:::::::::::THL:H:::R:::::::::::::::R
NP3874A         IF::::DI::::::::::::::Y::::::::::D-VY:::YTI::F::::::Q:::::::
HQ3275A         VLTFE:::LG:K:V:FTT:F::::F:::LQ:SL::::FNY:::::::M:T:ESLQQTQI:

consensus       IKERGEPLRDAILRRSIRLMYTAHSLDPLAEDIG--NQRGPFEHDADAQ-RRRELRAELE
#oth            112111111221121122.1112.1..111.221112221.1222212212.21..2111
Hut2408         V:LD:::I:::::E::::::::::D:::F::EV:::EG::::TFTG:T::P:K:::M:::
NP3874A         :LF:::::KQT:RDI:FK:::NT::::S::::L:::H:GN:YS:S:P:GVS:E:::FK::
HQ3275A         ::::VNS::EFL:::GVE:IW:S::::::G:S:SSI:VN::::W:S:--::::Q::::VD

consensus       ALIAHAYDLSRDDFEDIFNSFEQLKDREQEEHGRYRTREECKNKFDELAPRIEMNRDDI
#oth            .12222.111211112112...11112.2111.2.211122121121121112222222
Hut2408         :::C:V::::S::::QL:D::::IR:::M::::::Q:::TI:Q:YE:F::::S::Q::S
NP3874A         ::MFYL:G:DE:QID:::G::::::KE:KSD::Y:::::KV::::L::Q:D::YK:GQ:
HQ3275A         :AV:K:::I::E:::Y:L::::I:::L::::Y:E:KRKK::LEA::R:KI:F-------