|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3381 | VNG6148 | HVO_1520 | VNG5044 | VNG5253 | VNG6042 | VNG6484 | HVO_C0053 | HVO_0276 | HVO_A0077 | HVO_A0260 | HVO_0275 | HVO_1835 | HVO_0924 | HVO_A0007 | HVO_A0238 | HVO_A0355 | HVO_2051 | HVO_A0144 | HVO_A0431 | HVO_B0157 |
2402 | VNG6148 | 2856 | 1660 | 1747 | 1747 | 1747 | 1747 | 2383 | 2395 | 2395 | 2395 | 2397 | 2397 | 2377 | 2377 | 2377 | 2377 | 2377 | 2391 | 2400 | 2414 |
1862 | HVO_1520 | 1660 | 2209 | 1471 | 1471 | 1471 | 1471 | 1860 | 1854 | 1854 | 1854 | 1869 | 1869 | 1852 | 1852 | 1852 | 1852 | 1852 | 1870 | 1896 | 1890 |
1885 | VNG5044 | 1747 | 1471 | 2124 | 2124 | 2124 | 2124 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 1880 | 1880 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1889 | 1898 | 1915 |
1885 | VNG5253 | 1747 | 1471 | 2124 | 2124 | 2124 | 2124 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 1880 | 1880 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1889 | 1898 | 1915 |
1885 | VNG6042 | 1747 | 1471 | 2124 | 2124 | 2124 | 2124 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 1880 | 1880 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1889 | 1898 | 1915 |
1885 | VNG6484 | 1747 | 1471 | 2124 | 2124 | 2124 | 2124 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 1880 | 1880 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 1889 | 1898 | 1915 |
3310 | HVO_C0053 | 2383 | 1860 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 3402 | 3361 | 3381 | 3381 | 3317 | 3317 | 3291 | 3311 | 3311 | 3311 | 3283 | 3204 | 3224 | 3247 |
3332 | HVO_0276 | 2395 | 1854 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 3361 | 3383 | 3383 | 3383 | 3339 | 3339 | 3313 | 3313 | 3313 | 3313 | 3305 | 3231 | 3251 | 3269 |
3332 | HVO_A0077 | 2395 | 1854 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 3381 | 3383 | 3403 | 3403 | 3339 | 3339 | 3313 | 3333 | 3333 | 3333 | 3305 | 3226 | 3246 | 3269 |
3332 | HVO_A0260 | 2395 | 1854 | 1850 | 1850 | 1850 | 1850 | 3381 | 3383 | 3403 | 3403 | 3339 | 3339 | 3313 | 3333 | 3333 | 3333 | 3305 | 3226 | 3246 | 3269 |
3376 | HVO_0275 | 2397 | 1869 | 1880 | 1880 | 1880 | 1880 | 3317 | 3339 | 3339 | 3339 | 3383 | 3383 | 3342 | 3342 | 3342 | 3342 | 3334 | 3275 | 3295 | 3313 |
3376 | HVO_1835 | 2397 | 1869 | 1880 | 1880 | 1880 | 1880 | 3317 | 3339 | 3339 | 3339 | 3383 | 3383 | 3342 | 3342 | 3342 | 3342 | 3334 | 3275 | 3295 | 3313 |
3347 | HVO_0924 | 2377 | 1852 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 3291 | 3313 | 3313 | 3313 | 3342 | 3342 | 3375 | 3375 | 3375 | 3375 | 3350 | 3276 | 3254 | 3272 |
3347 | HVO_A0007 | 2377 | 1852 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 3311 | 3313 | 3333 | 3333 | 3342 | 3342 | 3375 | 3395 | 3395 | 3395 | 3350 | 3271 | 3249 | 3272 |
3347 | HVO_A0238 | 2377 | 1852 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 3311 | 3313 | 3333 | 3333 | 3342 | 3342 | 3375 | 3395 | 3395 | 3395 | 3350 | 3271 | 3249 | 3272 |
3347 | HVO_A0355 | 2377 | 1852 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 3311 | 3313 | 3333 | 3333 | 3342 | 3342 | 3375 | 3395 | 3395 | 3395 | 3350 | 3271 | 3249 | 3272 |
3339 | HVO_2051 | 2377 | 1852 | 1860 | 1860 | 1860 | 1860 | 3283 | 3305 | 3305 | 3305 | 3334 | 3334 | 3350 | 3350 | 3350 | 3350 | 3367 | 3298 | 3276 | 3289 |
3280 | HVO_A0144 | 2391 | 1870 | 1889 | 1889 | 1889 | 1889 | 3204 | 3231 | 3226 | 3226 | 3275 | 3275 | 3276 | 3271 | 3271 | 3271 | 3298 | 3393 | 3350 | 3327 |
3288 | HVO_A0431 | 2400 | 1896 | 1898 | 1898 | 1898 | 1898 | 3224 | 3251 | 3246 | 3246 | 3295 | 3295 | 3254 | 3249 | 3249 | 3249 | 3276 | 3350 | 3397 | 3334 |
3306 | HVO_B0157 | 2414 | 1890 | 1915 | 1915 | 1915 | 1915 | 3247 | 3269 | 3269 | 3269 | 3313 | 3313 | 3272 | 3272 | 3272 | 3272 | 3289 | 3327 | 3334 | 3369 |
450 symbols consensus ---MTYSPPDSVIVDRIQRAFPSDELRERARATNLVQRERKFDIVALFYTLSFGFAAGSD #oth 122221111111211111111111111111111112211111111111111211111211 VNG6148 :::--------------------------------------------------------- HVO_1520 :::--------------------------------------------------------- VNG5044 :::--------------------------------------------------------- VNG5253 :::--------------------------------------------------------- VNG6042 :::--------------------------------------------------------- VNG6484 :::--------------------------------------------------------- HVO_C0053 VGS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0276 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0077 VGS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0260 VGS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0007 VGS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0238 VGS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0355 VGS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2051 :::-V:::::::V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :VDDV:::::::V::::::::::::::::::::::IE::::::::::::::T:::::::: HVO_A0431 :VDDV:::::::V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::S:: HVO_B0157 :::-V:::::::V::::::::::::::::::::::IE::::::::::::::::::::::: consensus RSLQAFLERYVEMADCDELSYASFHDWFEPGFVALLREILDDAIENLDTGREDLNGRLER #oth 11111112111112111211113112112121112111111111111112231.1.1... VNG6148 ------------:S::::::::T::G::S:P::::::::::::::::::RNA::S::::: HVO_1520 -----------------------------------------------------:::C::: VNG5044 ------------:::::D::::A::::::::::::::::::::::::::::A::S::::: VNG5253 ------------:::::D::::A::::::::::::::::::::::::::::A::S::::: VNG6042 ------------:::::D::::A::::::::::::::::::::::::::::A::S::::: VNG6484 ------------:::::D::::A::::::::::::::::::::::::::::A::S::::: HVO_C0053 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0276 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0077 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0260 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0007 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0238 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0355 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2051 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :::::::D::::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::T:::::::: HVO_A0431 :::::::D::::::::::::::A:::::::::::F::::::::::::::::T:::::::: HVO_B0157 :::::::D::::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::A:::::::: consensus FRDVLIADATIVSLYQDAADIYTATGDHQAELKLHLTESLSTGLPTRFRTTDGTTHERSQ #oth ........11...1......1.1...21..1.....1..........1....11.1.... VNG6148 ::::::::GS::::::::::V:A::::D::G::::::::::::::::Y::::AK:Q:::: HVO_1520 ::::::::::::::::::::V:A:::KD:::::::::::::::::::::::::::::::: VNG5044 ::::::::::::::::::::V:A:::ED::::::::I::::::::::::::::::::::: VNG5253 ::::::::::::::::::::V:A:::ED::::::::I::::::::::::::::::::::: VNG6042 ::::::::::::::::::::V:A:::ED::::::::I::::::::::::::::::::::: VNG6484 ::::::::::::::::::::V:A:::ED::::::::I::::::::::::::::::::::: HVO_C0053 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0276 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0077 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0260 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0007 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0238 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0355 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2051 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :::::::::::::M::::::V:A:::KD:::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0431 ::::::::::::::::::::V:A:::KD:::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0157 ::::::::::::::::::::V:A:::ED:::::::::::::::::::::::::::::::: consensus LPTGEWVADALILLDLGFYDFWLFDRIDQNGGWFVSRVKDNANFEIVEELRTWRGNSIPL #oth ........1..2..............1.1.2.........1................... VNG6148 ::::::::G::V::::::::::::::::::N:::::::::D::::::::::::::::::: HVO_1520 :::::::::::F::::::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG5044 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG5253 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6042 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6484 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_C0053 ::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::D::::::::::::::::::: HVO_0276 ::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::D::::::::::::::::::: HVO_A0077 ::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::D::::::::::::::::::: HVO_A0260 ::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::D::::::::::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0007 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0238 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0355 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2051 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0431 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0157 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus EGESLQAVLEDLQRQEIDVRITLSFERKRGSGASATRTFRLVGLRNEETEEYHLYLTNLA #oth ......1..1.....................11.1..1.....11.1211.........2 VNG6148 ::::::D::D:::::::::::::::::::::CT:T::::::::VW::D:::::::::::S HVO_1520 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::: VNG5044 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G VNG5253 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G VNG6042 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G VNG6484 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G HVO_C0053 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::: HVO_0276 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::: HVO_A0077 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::: HVO_A0260 :::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::K:D:::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::::: HVO_0924 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::K:S::::::::::: HVO_A0007 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::K:S::::::::::: HVO_A0238 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::K:S::::::::::: HVO_A0355 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::K:S::::::::::: HVO_2051 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::K:S::::::::::: HVO_A0144 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::K:S::::::::::: HVO_A0431 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::::: HVO_B0157 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::::: consensus REDYSAPDIAQLYRARWEVELLFKELKSRFGLDEIKTTDGYIIEALIIMAAISLMMSRVI #oth 211.....1.11......1.....111111.111121.1211111121121111211111 VNG6148 KD::::::::::::::::I::::::::::::::::N:::P::::::V:::::::L::::: HVO_1520 ::S:::::R:AR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::::: VNG5044 ND::::::::::::::::::::::G-----:CHRTSS:---------------------- VNG5253 ND::::::::::::::::::::::G-----:CHRTSS:---------------------- VNG6042 ND::::::::::::::::::::::G-----:CHRTSS:---------------------- VNG6484 ND::::::::::::::::::::::G-----:CHRTSS:---------------------- HVO_C0053 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::::: HVO_0276 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0077 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0260 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0007 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0238 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0355 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2051 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0431 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0157 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus VDELRSLEARQREGEAAADADSSASRLPRRRCSLAVERHGHLIQLYLMIELGYELPDLDE #oth 111112122211211212112213222111112311222322222221321112111111 VNG6148 :::::K:DVK:::--S:D::TA:SPQ:::::::H:::::S::::::V:LD:::::::::: HVO_1520 ::::::::::::G----------R::RR::LVGV:APSASLFARRG-------------- VNG5044 ---------------------------:KS:VNAE:D----------------------- VNG5253 ---------------------------:KS:VNAE:D----------------------- VNG6042 ---------------------------:KS:VNAE:D----------------------- VNG6484 ---------------------------:KS:VNAE:D----------------------- HVO_C0053 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::::::V::::G:::::: HVO_0276 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::: HVO_A0077 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::: HVO_A0260 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0007 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0238 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0355 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2051 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0431 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0157 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus LLLWASRNPNPHRDRLREQVERGEFGFDRY #oth 111121121211131111212311121111 VNG6148 :::::::D:::::P:::::::S:::W---- HVO_1520 ----TP:SSD:-------T:SH:------- VNG5044 ----E:SD:AG------------------- VNG5253 ----E:SD:AG------------------- VNG6042 ----E:SD:AG------------------- VNG6484 ----E:SD:AG------------------- HVO_C0053 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0276 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0077 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0260 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0275 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1835 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0924 :::::::::::::Q:::::::::::::::: HVO_A0007 :::::::::::::Q:::::::::::::::: HVO_A0238 :::::::::::::Q:::::::::::::::: HVO_A0355 :::::::::::::Q:::::::::::::::: HVO_2051 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0144 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0431 :::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0157 ::::::::::::::::::::::::::::::