|
Pairwise sequence scores | ||||
---|---|---|---|---|
Consensus score | 6043 | HVO_B0309 | pNG7244 | pNG7246 |
3175 | HVO_B0309 | 5988 | 2042 | 2222 |
4346 | pNG7244 | 2042 | 5541 | 3766 |
4772 | pNG7246 | 2222 | 3766 | 6224 |
828 symbols consensus ------MARADGGDAEQA-----------------AENNHEARGDRAPVGERTEKYDDRG #oth 111111222212122222111111111111111112222221212222122221121222 HVO_B0309 :::::::P:S:T::P:T:::::::::::::::::::KSTS:::::D:::::SV::V:GW: pNG7244 ::::::------------:::::::::::::::::------------------------- pNG7246 MSNDDET:K::::T:S:SETVEDERFEEHPLEWDEP::::K:P:E:DS:SH::::::::K consensus LVTGQARYTADYEE--DDAAAAAVLRSEHAHARVRGIDTEAAEAMDGVDAVLTPEDDTVP #oth 1111212112122211212221212112221211221112111211..2..1.12112.. HVO_B0309 ::::K::::D:VPT:::::L::K::::P:::::::S:::::::TIA::K::::H::--:: pNG7244 --------------::----------------------------:::::::I::F::V:: pNG7246 ::::::K:::::::RYP:L:Y:::V:::IP:G::T::::S::::::::E:::::KS:::: consensus DARYTSAGQSYPEPSPWDERVLNEHVRFVGDPVAAVAARDAETAAAAVRAIEVDYEEYDA #oth 1221112.11..1.1.1.21..1.1..11.1.1.....21211.21.1211.12.111.2 HVO_B0309 ED:F:RT:FP::A:A:F:::::::T:::::E::::::::T::A:::::D:::::::P::H pNG7244 :KL:S:S:::::::::::LK::R:::::::::::::::D:P:::DR:A:KV:IE:R:L:: pNG7246 ::K:::::::::::::::M::::::::YI:::I:::::E:RA::T:::E::::S:::::Y consensus VLDPEEALNEDAPQLFEADDVENEQEGADYNRNREAHIRGELGDVNRAF-----DDARHV #oth .2.111.221...1.112221..21211112..2221221.1.1.22111111111221. HVO_B0309 :::AH::MGA:::T:H-PEPY::P::N:APE::VVCET:H:E:N:E:G::::::EA:DE: pNG7244 :F::::::D::::::::::::::K:S:::::::L:S:FE:::::::S::ERASN::E::: pNG7246 :T:::D:F:::::::::DGE::::IV:H::D:::M:::G::::::DG:L:::::::DT:: consensus HETEWETQAQSHANMEKHTTIAYTDEDDRHVLITATQVPNHTRRQIAHLFDIPIRDVRVK #oth 2.1.1..2211.222.21.11.11.111.1.11.2...1211.111.11.12111.1..2 HVO_B0309 V:G:Y::::VH:LP::TN::::WV:DRR:L::R:T:::SHIC:DK::RV:GLNRT::::V pNG7244 I::::::PY:::CVP:P::::::::::::::F:::::::F:::::::::::V:::::::: pNG7246 :::::::IR:::::V::::SL:::::::::::::S::::::::::L::::::::::I::T consensus KPRVGGGFGGKQA-MANEPIGAALALATDRPVRLEASRQEEFHAARFRHPMQVRAKTAVT #oth ...1.1...21.2112211.22..2.11111.21121.2.1121212..1121221.1.1 HVO_B0309 :::::::::VR:DTLP:QF:::::::E:GEK:::KND:K:DL:G:QT::AQT::V::G:R pNG7244 :::I:A:::S::E:::I:::TF::H::A::::K::M::::::T:L:::::::MQMQ:::: pNG7246 :::::::::::::::VV:::PL::S:::::::LY::::E:::Y:M:S::::K:K:::::: consensus DDGDIEAMDIYALSNTGAYGCHGMTVANNVGHKPLPLYPRVENARFEGDAVHTNLPQGGA #oth 1..111.112121..1....2.111.12.1121.111.1212.21.2112.1..21211. HVO_B0309 E::TLT::HVDVT:::::::::ASA:LM:AA:E::SV::-C::RL:T:R::Y::VTP::: pNG7244 :::::::::L:T:::S::::T::::::::::T:::::::::S:V::S::V::::::M:A: pNG7246 :::::::I::::::::::::S::::::G:::S::M:::SK:P:::::A:I::::T::T:: consensus MRGYGAPQGTFAIEAHLDEVARALGLDPIEFRRRNAVEEGDLDREIAGLKDGDRANRRIR #oth ......1..1112.2.1....12112..1.1.1111111..112121222212222.211 HVO_B0309 ::::::V::::G::S::::::A:I:M::V:L::::::::::ESF:----PEYSESK:TLE pNG7244 :::::::::H::V:::I:::::R:DF::::::LQ:::R::::::SV:I::::::FT:E:: pNG7246 ::::::::::L:L:G:::::::D:::::::::::HHM:V::::-::::MMG:EG:::::: consensus SCGIRECIERGKEAIGY-DDLEQPDADHRQRGIGMALAAQGSGVAGDELGAAQIQMNEDG #oth .1.22..21.11111.11.11.1.12.122..2.1..21111..112.1111112111.. HVO_B0309 :V:VK::L::AC:TL:WA:GP:E:AD:RY:::Y:V:::MAK:::PSS:FSRCN:TLED:: pNG7244 :::::::VD::::::::::::::::E:::K::V::::I::::::::K::::::V:::::: pNG7246 :::LD:::::::D:::::::::::::::LH:::::::S:::T::::::::::::M::::: consensus SFHLQVGGVDTGTGADTAFGQIAAEVLGCDEEDVHVKAADTDATPFDYGAYASSTTYISG #oth 11111..11.1.1.11.212....1.1.1221112.112...2..1.1............ HVO_B0309 TLTVR::VG:::Q:SE:VM:::::S:F:LGI:S:::::D::::::W:N:::::::::::: pNG7244 :::::::::::::::::M:S:::::::::TP:::V:I:::::L::::::::::::::::: pNG7246 ::::::::::I::::::::L:::::::::::D:II::SS:::V::::::::::::::::: consensus RAVKKAAEDAKERILDWGAKLLEEPPDVLETGDGEVYSERDGNSVALERIGYEAAYG-DD #oth 2.111..1.111121111.1111111.11111..2.11112.2112..2111..21.111 HVO_B0309 N:TE:::R:LAAKVR:LA:EWRGVA::DV:LA::::RFP-::E:M::::FAS::FQ:IHG pNG7244 ::::N::::::::L:E:::::::::::::D::::G:::::T:KR:S::E:::::T::::: pNG7246 M::::::::::::::::::::::::V::::::::T:::::S::::T::D::::::::::: consensus EREHILGDGNHCTAESPPPFAAQFADVTVDTETGEFEVRKLVNAVDCGVAINPAGAEGQI #oth 111111.2.2.2.21..1.11..111.1..11...1.121..2.1...1....1211..1 HVO_B0309 PKRRLT:T:K:H::L::K:::::L:A:E:::::::::::R::::::::R:::::::R::V pNG7244 :::::::::::S:D:::::YG:::V::::::::::Y:LN:::F:A:::::::::LV:::: pNG7246 :::::::K:T:::E::::::::::::::::ET::::::H:::V::::::::::GM::::: consensus EGGAHMSLEQAVSEDLTLDDRGAPEIAGFRDYGLPRAAEHPDIETILVETHEPTGPFGAK #oth 1.121.111211.11111.12.211221112.12121212.21111....1......... HVO_B0309 I:::V:G:G:T:::::P::::::::FR:L:::EVMH:P:L:::D:E::::D::::::::: pNG7244 :::E:::::Y:T:G:::F:ED:N:DVL:::Q::M::TTD::EM::::::::::::::::: pNG7246 ::AN:::Y:M::::GI::::E:RA:::D:DE::::S:::T:P::S::::::::::::::: consensus SVAEVPTNGVPPALSNAIRDAVGVRATELPITAEDIKAALDERRAA-- #oth .11.111111.1.11..11......21.1.111.22211.11222211 HVO_B0309 ::G::SIL:P:A:IA:::H:::::::::::::P:TVWT::Q:D:DR:: pNG7244 :I::L::::::::::::::::::::L::::F::::LM::::DQSG:GK pNG7246 ::::::::T::::::::V:::::::IR:M::S::K:::K::::K:-::