2 genomes BUD3091 2 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnB0102 HVO_B0290 - - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	1977	rrnB0102	HVO_B0290
1375	rrnB0102	1973	901
1503	HVO_B0290	901	1903

265 symbols
consensus       MRNARYPQLWAAIRAARKAGRELRARKEAADRERFRDRGDIVTEADRAAEARILAEIAAA
#oth            .1111.11..1.1...11..11.111111111111111111111..111.11.1111111
rrnB0102        ::D:T:::::::V::::::::T:ESV:P:::QFQVKHN:::::::::TV:ET::::LSGQ
HVO_B0290       :V:D::--::T:::::EV::D:::::F:SSS:::::::-----P::E::::::TDV::::

consensus       FPDDNVVSEEGAPEFRPKPRWIIDPIDGTTNFHNGIPHFSISIAFEGAGRPDVGIVNHVP
#oth            ..111.....11...11....11..1...1..1..1..1.1..11...11....1.11..
rrnB0102        ::VHT:::::S::::TT:::::::::::::::L:::::Y::::::::::E::::::Y:::
HVO_B0290       :::::::::::S:::::::::VV::L:::V:::::V::::V::MY:::T:::::V::Y::

consensus       ADQLYTAIEGEGAFANGRELSLSAAAELSEALIVTGFDSAARAAQDGAHLRAICNSTRGV
#oth            1111.1....1..11..11..1.111......1.....111111111111111111.1..
rrnB0102        SETM::::::G::Y:::QP:::::TT::::::::::::T:SMQ::EYD:F:T:L:V:Q::
HVO_B0290       :::::V::::::::V::::::V:N::::::::V::::::L:::NG:::Y:E:L:E:::::

consensus       RRMGSAAAELALVAAGRFDAFFERNLDMWDTAAGPLIVREAGGEVTRIEAIDDKNGDMVL
#oth            ..1....1...1....1..11..11.11...11.111.1.......111.1.111111.1
rrnB0102        ::F::::G:::M::::Q:::::::Q:SV::::::VK::E:::::::::K:L:G::SE:::
HVO_B0290       :::::::::::::::::::VY::Q:::::::RT:::L:::::::::HV:::::VT::T:V

consensus       ASNQAIHRDLIALMSAGSALGMDGQ
#oth            ...1.1.11111.1.1111111111
rrnB0102        :::E:::Q::V::V:::TVPK::::
HVO_B0290       :::::L::QV:S:::RH::::----