2 genomes BUD3200 2 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC1689 - Hbo3988 - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	2585	rrnAC1689	Hbo3988
1764	rrnAC1689	2492	1110
1931	Hbo3988	1110	2526

330 symbols
consensus       MPGRISRHQSAEDLAGDAADCIEEVRKTELPDQIAELAAEYDRCCGERDRFLWQWIHGLF
#oth            111111111.111111.11111.1.11.1..1111..11..1.11.1..1...1..11..
rrnAC1689       --------M:V:SP:V::Q:LL::::T:S::::V::::D::E:I::::::::::::YS::
Hbo3988         :::::::::::G::G::Y:G:::S:H:::::QS:I::S::::::V:T::E:::K::::::

consensus       DAFTLPCVHPDHADEVRTQKTILTMYITALDDITDNDGDRATFEQARRLPQAPEAVRPDA
#oth            11...11.11111.1.1.1..11...1.1...11111..11...1....111.11.1111
rrnAC1689       PE:::SS:::::::H:::::::::::V:I::::VE:::::D:::E::::V:D:S::D:SR
Hbo3988         ::::::::PSSVL:::T:T::VF:::::::::L::HL::E::::::::::H:::S::Y::

consensus       AAVDEDILRFAERLWRRFEDRLTAAPRYEEHLDVFIFDMRQALNAMDYAAVLNDNQRIAN
#oth            11.111111.1.11.111111..1...1..11...11.1..1....1.11.1.1.11...
rrnAC1689       :::S:EYFS:I::V::E::GG::D:::V::FY:::TY::::T::::::S::V:E:P::::
Hbo3988         PG::T:::::::T::N:VT:::::::::::::::::::V:::::::E::R::::::E:::

consensus       LAEARHHGAHNMVMFPYAAIDLMWSPEFDRADLGQLRDLILDLQRMARIGNWITTWEREL
#oth            .111111.11........11...11.1..1111.11.1.11...1.......1...1..1
rrnAC1689       :SG:ETY::::::::::::V:::Y:::::L::Y:TV::::W:::E:::::::L::::::V
Hbo3988         :::S::::PF::::::::G:::::T:S:::QE:::::S:L::::::::::::::::K:::

consensus       KEDDYTAGIVVEALQRGLITPDDLENPDRAAELIARIDEEQIEARFRDRWADRYADARDR
#oth            1.1.....1..1..11.11.111111.1.1111.11.111111.1.111.111.11111.
rrnAC1689       ::G::::::::L:::E:FV::EE::::::K::::DK:KT::L::::::::::I:QSV:::
Hbo3988         Y:::::::V:::::E:::::V::--D:E::---::::::SG:V:Q:ELE:ET:::::MS:

consensus       EFDIDSFDLRALVDGMRTVMQYHEASRGQK
#oth            .1.11.1.111..1..1..11..1..1.1.
rrnAC1689       :::T::V::D:::Q::E::F::::::::H:
Hbo3988         :Y::E:::V:R:::::::::E::V::Y:::