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2 genomes BUD3202 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1		 b Hma
Haloarcula
marismortui		 f Hvo
Haloferax
volcanii		 g Hbo
Halogeometricum
borinquense		 h Hmu
Halomicrobium
mukohataei		 i Hut
Halorhabdus
utahensis		 j Hla
Halorubrum
lacusprofundi		 q Nph
Natronomonas
pharaonis		 x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_1210

HVO_1211

Hbo0346

Hbo0349

Hbo0350

 - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score1543 HVO_1211 Hbo0346 Hbo0349 HVO_1210 Hbo0350
1273HVO_1211 1577 1148 1153 910 903
1344Hbo0346 1148 1534 1297 921 947
1332Hbo0349 1153 1297 1526 898 927
1016HVO_1210 910 921 898 1535 1089
1049Hbo0350 903 947 927 1089 1621 

237 symbols
consensus       MFEKFNNDDRGQVGIGTLIVFIAMVLVAAIAAGVLVNTAGFLQATAEDAGQQSVNKVTNR
#oth            ..111212......................................1...11........
HVO_1211        ::NNITD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::
Hbo0346         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::
Hbo0349         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::::
HVO_1210        :::NI-:E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo0350         :::::-DT::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::E::::::::

consensus       VEVLNTHGEV---GGEDTIDNINLTVRLAAGSGSVDMNETSVKYLSADTVRTLT-NQTTT
#oth            .1.111..4.12222131112131........21.1111.11..1.421121.1112122
HVO_1211        ::::::::T:::::::ED::::T:::::::::DA:::::::I::::G:S:V:::::::V:
Hbo0346         ::::::::V::::-:D:::RS::M::::::::S:::::::::::::S:::Q::::::::S
Hbo0349         :::::::::::::-:D:::R::QM::::::::S::::::::::::::T::Q:::::::DD
HVO_1210        :D:V:A::L:NKT:E:R:V:Q:F::::::::::::SLED:T:::::ET:A::::Y:D:V:
Hbo0350         :D:VS:::I:NDEAN:L:V:SL:::::::::::::SLED:TI::V:DS:A:N:VYDNA::

consensus       DGDGTAQA----NVADSD-----------EFGLDEVTDDDG-SFGVLNSMNDRYEVTINT
#oth            222234441111222231111111111111.214311.1.11..2..1212..1231.1.
HVO_1211        S:ANS:TNDSAEG::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::::::::D:
Hbo0346         :::::VKT::::--::AN::::::::::::::::K:::::::::::::::::::VA::::
Hbo0349         :SE:LI:E::::--:::::::::::::::::A:T::::::::::::::::::::G:::::
HVO_1210        GS:TADP::::::LTTGN:::::::::::N:TAGVLE:G:D:::E:::EQS::A:MV:::
Hbo0350         :A:::SLG::::::SAN:KNFGSDGLNNT::TAYALE:G:DT::P::SNQG::::IV:::

consensus       SAVEA--G-D-ANHTNGLSTGEQVTLEITSRTGGTTQVILTMPQQLAGKNANDPIEL
#oth            241.311112323332.13..22.1.1....2..12.............2311.11.
HVO_1211        A:I:TSD:::NT:LIG:::::::::::::::::::::::::::::::::TQ:E:V::
Hbo0346         :DI:::::TND:G:S:::N::DS::::::::::::::::::::::::::::G:::::
Hbo0349         TK::::::::S:::DK::K::::::::::::::::::::::::::::::::G::V::
HVO_1210        :T::G::-:-:-DN:::TA::QT:K:D::::N:::A:::::::::::::DN::::A:
Hbo0350         :V::D::-:-:-TP:K::::::S:K::::::S::SS::::::::::::::D::::A: