2 genomes BUD3203 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - - HVO_A0190 HVO_A0196 Hbo3801 Hbo3802 - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	4292	Hbo3801	Hbo3802	HVO_A0190	HVO_A0196
1963	Hbo3801	5737	671	682	1327
1079	Hbo3802	671	2654	605	666
2591	HVO_A0190	682	605	3712	2410
3422	HVO_A0196	1327	666	2410	6890

936 symbols
consensus       ------------D---------S-----LNRRNYLK-LGAMAAGAALAGAATPAAEAPEE
#oth            111112222222122222222212222223113212222132232122233233233231
Hbo3801         MSMAEQPANSPN:AGAENTENQ:DDTKL:G::DA::LGA:T::V::G:::::TT:T:AI:
Hbo3802         ::::::::::::-:::::::::-:::::--------:-----------------------
HVO_A0190       ::::::::::::-:::::::::-:::::VK::T::RT:::VGV::::::CN::DE:T:T:
HVO_A0196       :::::MVRLTDG:DDESAADSD:ILESQ:::::::::::::::ST::SAGVAS::SG:::

consensus       REGITED--------RVVNAVDDLGMDPNGNEPIDDQLDDAYEDGTLIEFPPGDYLITRE
#oth            23232321111111121221.111.11.21122212312322332121111213122233
Hbo3801         :::V:F:::::::::::::::::::::::::DR::SK:E::LSP:::::::A:T:K:ASK
Hbo3802         -------::::::::----N:EKA:SN:RE:S----------------------------
HVO_A0190       TPRP::ETPTPEPELT:FD:::::::::T:Q::V::I::ET:G:D:A:::::::::::::
HVO_A0196       :F::QW:::::::::::::::::::::::::::::::::S:::S:::::::::E::A:ET

consensus       QDWND-VSRFGIVGIGDSHKDVQFVFP---NGERMRMLRITSGADHVLKNFSIQQTDDDT
#oth            2323221122231.3122222121121222312331323222233211111212221132
Hbo3801         :VLE::--:T:::::A:DRSK:R::P::::Q:KG::WINFGNV:GA:::::T:DRL::YD
Hbo3802         -----:-------:S:A----------:::------------------------------
HVO_A0190       H::DRG::N:RL::L::::::::::::PADP:::F::::::::T::::::::::::::::
HVO_A0196       :Y:::D:::::M::T:S::::::::::SGN:::KY:F:E::::DH:::::::::::::S:

consensus       TTADIWGANDDGALIEDVEWLGRTPTDN-AR-QLLAADCTSVDGVAVVRRVYRREGAELP
#oth            1222223322212122211221211123211212223211221.11.2122112112212
Hbo3801         ::VGMG:NIKRNFVLKN::YD:W:::GP:--::MF::NV:DS::T:::DGL::TGPT:FQ
Hbo3802         ---------EN:IVVQ------------:--:------V:KP::::::DTFV:KGPQDFA
HVO_A0190       :S::::L::::::::::::::::::::SH::D:::LF:::::E::N:I::::M::::A::
HVO_A0196       ::::::MI::::::::::::::::::::D::R::::Y::S:::::N:A::::M:::::::

consensus       GYPNGVAGIRIGRGHVGEVRLRNCHIENRGESGIRATHGRGVLRVEGGLFKNNDNTNMRI
#oth            1..3222212322112.22222121.11111111112112.2211.1.1...122121.1
Hbo3801         H::KSSLD:WS::::E:HMV:::IE:H:GS::::YTGK:N:TYLI:D:Y:::VVH:AV:A
Hbo3802         H::GNAITVFT::::L:T:YY::L::::G::H::Y:SK:Q:NV::::::::::LGDGV::
HVO_A0190       :::::::::::TERS:::::MID::::Q::S:SF::::T:::::::::::::::::::::
HVO_A0196       :::D::::::VQG:S:::I::VD::::Q::S:SF::::T:::::::::::::::::::::

consensus       AAGDHPEKTSWIKGATVIMDADNLNEHAR-------DGDRLDSPRGIRIDSTGNGYTGVL
#oth            112111111.11111.112.2112212121111111212322221112211223112.21
Hbo3801         :GR:-----:TVRNC:IV::TEDWDPRNEKVESTYD::EPIQLN:A:WAQTNDKQFS:PV
Hbo3802         :GEG-----::V:::::VI:M:DRTPGN::::::::--GNWHQA:::HLQ:GEY::::G:
HVO_A0190       S:::::::::::::::::V:::::::::::::::::E:::::::E:L::::::H::::::
HVO_A0196       S:::::::::::::::::::::::::::H::::::::::S::::E:L:::::::::A:::

consensus       IEDCDFIAKSSPTSRAIAGIPTNASHGGATIRNCRIQNDTGVQTIHADQVDT--DQAREP
#oth            1...1213222121311332223322.1113..1.1211122211321322.1123131.
Hbo3801         :::::I:I:NT-::T:L:::YV:FDT:::K:::T:::C:S:HVIPIYG:SP:::NE:G::
Hbo3802         V:::TV::HA::RTE:LLK:EH--:Q:A::V::::FF:N:DYR::VV:KPA:GPQ:PKK:
HVO_A0190       ::::::VYR:::S:PG:ITV::YG::::F:M:::::I::::::::Y:GP::::::I::::
HVO_A0196       :::::::F::C::::G:VSS::W:G:::F:L:::::::::S:::::::S::::::T:DK:

consensus       WEVTLENVSISG---SQAAGAAAMIDEDRNGSRIRNSCIDLPNGRVDGVLLNNADGCAIE
#oth            11121111211.2221213231123211.11.313121.32112311.111121312312
Hbo3801         I:ME:DG::VT::::-S:WDK:::YF:::PN:V:::C::QSS:NN-:::::D:C::STV:
Hbo3802         ::::F::IE::::::-R:SNTV::LL:::P::K:S:VT::::SVG:::IV:::CE:TV:D
HVO_A0190       :G:N::::T:::ACE::PY:S:VVV::N::::::VD:::Y::::::G:::V:R:S:::::
HVO_A0196       :G::::::::T:STR::P::::VC::N:::::TVQ::::HF:::D:::::V:D:TN:E:L

consensus       NSNINVGGRATRFSGAS------VALSNITSSDSCPLPSAD-ST--D-------------
#oth            2211111.3112222321111111312221222112122222112212222222222111
Hbo3801         :T:::::::::T:KNG::::::::ST:S:::::::::::LPS::PS:GTPSTGDGSG:::
Hbo3802         :M:VVT::YPL:V:SN:DGEQCL:T:K:LRRLK:SL:SD:::--::-:::::::::::::
HVO_A0190       H:S:::S:PP::TR:VE::::::L::DDV:YTAT:------:--::-:::::::::::::
HVO_A0196       D:::::S:Q::V::::D:::::::DT:::::::::::::::G::GG:SSTTDDSTTDDST

consensus       -----------G------Y-----------G----E-----SGT--------GV----T-
#oth            111111111111222222122222222222122221222221112222222211222212
Hbo3801         ::::::::::::SDDSSS:DLPYRFKVEST:GGKT:FTVST:::MKPASDAE::VENN:V
Hbo3802         :::::::::::-::::::-:::::::::::-::::-:::::---::::::::--::::-:
HVO_A0190       :::::::::::-::::::-:::::::::::-::::-:::::---::::::::--::::-:
HVO_A0196       AEPLPNEIRLV:TGTTTQ:EFTVTDSLQAS:DTIE:WDDIE:::ATGWITTD::EDAY:F

consensus       S---------E---------EQVLASSVTGATCADGNDE--DGS-------------LS-
#oth            122222111112222222223323322221323323323221111111222222222112
Hbo3801         :DRVGP:::::SGVDSYLYEGY:TDF::::GEH:NYYI:TS:::::::KSVQVSPEL::A
Hbo3802         -:::::::::-:::::::::TEQ::::LS:S::L::::T::---:::::::::::::--:
HVO_A0190       -:::::::::-:::::::::-------------------::---:::::::::::::--:
HVO_A0196       :GDIDSFSFL:GESEIHVNG:::SE:T:::::TD:ST:SNT:::TDSTDDSTTDSTD::H

consensus       ----V-----------V----E---------DT-DG--ASG--------D-F---GS-T-
#oth            222212222222222212222122222222211211221112222222212122211212
Hbo3801         NRFV:KSTGGGVASYD:TVDG:IVRGACGLE::V::QT:::RVGPDSGI:A:HYT::I:D
Hbo3802         ::::-:::::::::::-::::-:::::::::--:--::---::::::::-:-:::--:-:
HVO_A0190       ::::-:::::::::::-::::-:::::::::--:--::---::::::::-:-:::--:-:
HVO_A0196       ELRL:GTGTPTQYEFT:SDAL:ASGDTIETW::I::TS:::WITTAGVE:T:NFA::V:A

consensus       --F---------DG------TV-----D----G--DS-----------T-DAQNELAIIG
#oth            221111111111112222221122222122221221111111111111121332323331
Hbo3801         LT::::::::::::AEYATV::NGKEI:PNQY:EG::::::::::::::S:LP:S:T:S:
Hbo3802         ::-:::::::::--::::::--:::::-::::-::--:::::::::::-:-:KQTF:V::
HVO_A0190       ::-:::::::::--::::::--:::::-::::-::--:::::::::::-:----------
HVO_A0196       FG:VEGEAEIHV::EQVTES::TDAVT:SGTD:ST::GTDGSTDSTDD:T:S::::RLV:

consensus       TGANRQYEVTVS-----S-D----------------------------------------
#oth            223333132222222221212221111111111111111111111111111111111111
Hbo3801         ::T:ST:T::::EDIDV:P:ETD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3802         ANDD:L:GTVLD:::::-:-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0190       ------------:::::-:-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0196       :::ET:::::::GTLEA:G:TIEQWDDVSESSATGWVTTEGVEDVYAFTGTITSLSFLEG

consensus       ------------------------------------------------------------
#oth            111111111111111111111111111111111111111111111111112222222222
Hbo3801         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DISGNISTKS
Hbo3802         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0190       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_A0196       EAEVYVNGTRVDPAVFSLPNTLVVEGDGTETTYDFMVSGDILNDPLVGPTESDDSLTNGK

consensus       A-G-VTDG-DAFR--G-IT---------------DR
#oth            121211112122222121121111111111111123
Hbo3801         :E:A::::E:KYVYA:E::T::::::::::::::S:
Hbo3802         -:-:----:----::-:--:::::::::::::::EQ
HVO_A0190       -:-:----:-:::::-:--::::::::::::::::E
HVO_A0196       :K:S::::I::::FS:D::KMNLAGDAALTFEDN:G