2 genomes BUD3205 4 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - - HVO_B0011 HVO_C0077 Hbo3192 Hbo3556 - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	2930	HVO_C0077	Hbo3556	HVO_B0011	Hbo3192
2139	HVO_C0077	2990	2280	1361	1381
2099	Hbo3556	2280	2958	1387	1314
2071	HVO_B0011	1361	1387	2981	1985
2032	Hbo3192	1381	1314	1985	2972

388 symbols
consensus       MRGSDNRYDVIVVGVGGIGSAAAYHLARRGLDVLGLDRYDIPNSQGSSHGDSRIIRLANY
#oth            1332232...1.1....1...11...13..1..1..11.21.113.....21.1..2121
HVO_C0077       ::S:STQ:::::M:::::::::V::::::::::::::Q:N::::I::::::::L:::T:H
Hbo3556         :E:::KA:::::::::::::::V:::SQ:::::::::Q:S::::V::::::::L:::T::
HVO_B0011       :SVR:D::::A::::::M:::T:::::D:::::V::E:::::H:::::::IT::::R:Y:
Hbo3192         ---MR::::::::::::M:::T:::::N::A:::::E:::V:HDM:::::VT::::K:Q:

consensus       EDPEYVPHVRRAIDLWESLAEETGRDLLHRTGTIDAGPADSETFAGSRRACEEHDIPHEH
#oth            .1.1...111.111..22.1111.111121..21....3112113.1321.121.111.2
HVO_C0077       :::::::::::S:S:::::E::Y:EQ:::::::V:::::::::VR::LK::TDY:L:Y::
Hbo3556         :::::::::::S:::::::E::Y:EQ::F::::V::::EG:::VE:AIT::::Y:L:Y::
HVO_B0011       :H:S:::LIE::Y:::DD::D:::::II::::S:::::V:NDV::::K:S:::::::::V
Hbo3192         :H:S:::L::::Y:::RE:::K::::::TI::G:::::P::QV:D::::S::A:::D::L

consensus       LSAAELNERFPGFELPEDFRAVYQPDGGFIVPEQCIQAHTEAAQAAGAEIRARETVVDW-
#oth            .111.1112...12..2121..1.1....22.1211111112.123.1111.1.212112
HVO_C0077       :::G::S:K:::::::QE:E::::::::::N:TK:V:::V:L::EH::TTH:H:::::::
Hbo3556         ::::::S:Q::::R::S::E::H:::::::H:TR:V:::VAG:HDN:::TH:H::::E::
HVO_B0011       :TG::V::::::Y:::::Y:::::E::::V::::S:IGY::::::R::::::::R:E::A
Hbo3192         :::::V:D::::YD::::H::::::::::L::::::I::::::::::G::::::PMR:FT

consensus       ETTDGGVRVRTDRGTYEADALVLTAGAWTDKLVEELEELATPERQILAGFQPESPAAFTA
#oth            222121.1.3.1211.1.131.11....2321222121212.1.121111..12223.21
HVO_C0077       :S:ANS:T:E:::T::::NHV:V::::::QL:::::::TL::W:V:VG:::::NRSQ:::
Hbo3556         D:::D::::Q::LT:::::Q::::::::K:VFP:RVA:KL::W:V:VG:::::::EK::P
HVO_B0011       ::N:::::::::::V:V::::::A::::NY::ADA:DG::I::::A::W:::::::T:AP
Hbo3192         PLA::::::T:PK::::::R::V::::::P:::P:::G::V::::V::WL::SDS:::D:

consensus       DAFPVFSIADEDQRYYGFPAADTPGFKFGLVDNLEDVADPDDFDRRPTEADEERLRTVL-
#oth            131..1223222131..2.21111...1.122121121..211.12.2211222..2112
HVO_C0077       :S::::::E::Q:S:::G:::G:S::::::::::::::::N:::P::::KER:::::::H
Hbo3556         ::L:::::NEG::G:::A:::G:S::::::::::::::::S:::P::::KEK:::::::Y
HVO_B0011       EE:::WNLSVPEG:F::::VH:V::::L:KYHHRDEEV:::::::E:NR:::AI::D:-:
Hbo3192         EN::::VH::::GH:::::RH:V::::::KFNHF:ETV:::EM::Q:RP:::RA::AY-:

consensus       --AERYFPEGAGPTKRLATCMFTNTPDQDFILDTLPDHPQVAVGAGFSGHGFKFASLMGE
#oth            221221..11.21122.1..11.11..11..1.21.22.1131......1....1212..
HVO_C0077       EN:Q:::::::KSI:::K:::V:H:::::::V:Y::SD:N:V:::::::K::::SC::::
Hbo3556         DK:RE::::::RS::::K:::V:H:::::::V:S:::R:::K:::::::K::::SG::::
HVO_B0011       ::T:K::::A::::MS::::::::S::EH:::::::::::::::::::::::::::VI::
Hbo3192         :::::C::K:::::VK::::L::::::EH:::::H:E:::ITI:::::::::::::VV::

consensus       ILADLATDGESAVDLDLFRIDRF-----
#oth            1...2121221321212.32...21111
HVO_C0077       L::::V:ESD::::I:::D::::QTMPR
Hbo3556         L::::V:EEA:K:::EI:EM::::::::
HVO_B0011       ::::R:G::::DLP::M:SL:::E::::
Hbo3192         ::::F:L:::TNH:T:::::::::::::