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2 genomes BUD3210 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1		 b Hma
Haloarcula
marismortui		 f Hvo
Haloferax
volcanii		 g Hbo
Halogeometricum
borinquense		 h Hmu
Halomicrobium
mukohataei		 i Hut
Halorhabdus
utahensis		 j Hla
Halorubrum
lacusprofundi		 q Nph
Natronomonas
pharaonis		 x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_A0338

HVO_C0073

Hbo3560

 - - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score2347 HVO_A0338 HVO_C0073 Hbo3560
1254HVO_A0338 2361 1108 1090
2140HVO_C0073 1108 2334 2005
2113Hbo3560 1090 2005 2339 

321 symbols
consensus       MSAFNAYLVKRMGYIGVTLILISLIAFAVTQLLPGNAAVMILGKQATEESIAAIEQQLGL
#oth            .11122.111.2.111...2111..2.11.11...11.11...11..11.11.111....
HVO_A0338       ::MY:-:V:R:V:FMA:::FFVT:::::::NI:::DV:LL:::PN:::Q:LE:LQT::::
HVO_C0073       ::::S::::::::::::::L:::::I::I:::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3560         :A::TV::A::F:::::::::::::V:G:::::::::::::::::::S::::::::::::

consensus       NRPWYVQYIDWLVGFVTGNWGESFANRQPVAALIFPRLVRSAQLAAATLILVTVTAIPLG
#oth            ..11....2..11.111.11.2.121211.121.11..1..11..22122111.111...
HVO_A0338       :::L:::::::V::LLQ::M:::LRFGE:::Q::AE::P::MM::V:ATLVAV:LSV:::
HVO_C0073       ::A:::::F:::::::::D::I::S:::E::K::::::::::::::I:S:::::::::::
Hbo3560         ::::::::L:::G::::::::T::::Q:::T:I::::::::::::IV::T::::::::::

consensus       VLAAVKQDSIWDLLASAGGYVGVSLPEFVIGTAFIALFAGPVFQILPFGGYEPLSAGIVT
#oth            .1..11.1111.11..21111.1.1.1.11.12..21.11111111.2...111.212.1
HVO_A0338       :Y:::N:NEAP:VS::MFAF::I:M:I:LW:LV::LV::-VWLNLF:T:::VSP:DDL:G
HVO_C0073       ::::I:::::::::::::::A:::::::::::::::::T::::::::Y:::::::S:V::
Hbo3560         ::::::::::::::::V:::::::::::::::L::T::::::::::::::::::::::::

consensus       WAKHLILPSVTLSIILTAHVMRLTRSEIVEVLREDYVRSARLKGLSERKVILRHALRNGL
#oth            111111..1111111...11..1...121...111.111..1..1.1211221.1.1.11
HVO_A0338       SLTR:V::AGAMGFA:::YI::M:::SML:::S:E:INL::A::M:Q:VIV:::::K:AI
HVO_C0073       :::::::::::::::::::::::::::V:::::K:::::::::::::T:::S::::::::
Hbo3560         ::::M::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::LTK:T:::::

consensus       LPTITLLALNIGYLLGSIVVVEEVFTFPGLGRLLVRSIQARDLPVIQACVMLIAIVYAFS
#oth            1.1..1111121.11.11.11....11..1...1111..2.11.11.221112.11.211
HVO_A0338       I:V::VI:FQFS:AF:GV::L::::FW::I:::TLTA::S::I:L::G:ILVV:LI:M::
HVO_C0073       :::::::T::V::::::::::::::::::::::::::::::::::::VT:::L:::::::
Hbo3560         :::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::T:N:::L::S::::::::TVT

consensus       NLAADILYTYLDPRIEYGEND
#oth            .11..21.1.1....1..122
HVO_A0338       :F:::L::A:F::::R::GD:
HVO_C0073       ::T::V:::::::::::::EE
Hbo3560         ::::::M:::::::::::::-