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2 genomes BUD3211 3 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_2342

Hbo2023

Hbo3039

- - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score3626 Hbo3039 HVO_2342 Hbo2023
2527Hbo3039 3594 2175 2228
3067HVO_2342 2175 3653 2676
3139Hbo2023 2228 2676 3630

503 symbols
consensus       ---MPAKARDVNLTDGDLLKPLLVLSLPIVLSQMMQVAYNLADTFWVGRVGQNAVSALSF
#oth            1112222111..11..111..1.1..1.1111111..1...........1.22.......
Hbo3039         MSGP:GPG:A::I:::PI:::::F::I::::TN:L::::::::::::::L::D:::::::
HVO_2342        ::::S:::K::::V::::V::M::::::L:F::I:::::::::::::::::TE:::::::
Hbo2023         :::--VS::::::::::::::::::::::I:::::::C:::::::::::::E::::::::

consensus       SWPIVFLMISIGGGFTVAGTVLVAQNKGAGNDDRVNHVAGQTIAFVILLSAGFSVLGYIL
#oth            ..11...1.1211..................2.11211....11..11..12.111..21
Hbo3039         ::A::::I:TLAA::::::::::::::::::L::ISD:::::::::VA::VV::::::V:
HVO_2342        :::L::::::F::::::::::::::::::::H:E:D:A::::LG:::::::::A:I::L:
Hbo2023         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::A::::F

consensus       APILLNLIGTTPGTEVHALSVEYTRTIFLGVAFMFGFFIFQALLRGWGDTKTPMYLMALG
#oth            1.2..2...1......12.112....1...12.1.1.....1..1.....1..1...21.
Hbo3039         ::W::Q:::A::::::FR::IT::::M:::IP:V:A:::::S::Q::::::::L:::L::
HVO_2342        T::::P:::::::::::Q:A:::::::::::::::::::::::::::::::::::::G::
Hbo2023         ::S::::::::::::::::::S:::::::::Y::::::::::::::::::R:::::::F:

consensus       VVLNVIIDPFLILGFQANPIFGLLGLDGLQANLFAATGFTGFGVQGAAIATVFSRGVGAL
#oth            .11..21........12.11.121.122.122.111.1.1.1......1..111..1..1
Hbo3039         :I:::V::::::::::D:LL:EVT::TT::S::Y:::E:G:::::::::::ITA::I::V
HVO_2342        ::I::FL::::::::N::::::::::ES:GQS::::::::::::::::::::::::::::
Hbo2023         ::::::::::::::::N:::::M::F:::::T::SL:::::M::::::V:::::::::::

consensus       VGFGLLLSGRVGIHLSPRDLILERETVRRIVRIGAPASIEQSTRALGVTALTALVAYAGA
#oth            1112..1......1.112.1112111.22.11....2...1..111.1.11...1.1.12
Hbo3039         IAV::::::::::::A:S:FV:T::::SK:FT::::::::M::QSF:I:VM:::::L:::
HVO_2342        :::W:::::::::S:::::::P:::M:E::::::::S:::::::::::::::::::::AV
Hbo2023         :::Y::F:::::::::KD::::KAD:::S:::::::T:::::::::::::::::A::::T

consensus       NAAGADTEAAVAAFGIGNRLNSLVFLPAIGLAQGTETVVGQNLGADQAERAKQAVFAGVG
#oth            222122122........1.11...1...1..11.11.1.......1111.1111..211.
Hbo3039         E--------::::::::T:IT:::V:::L:::R::::A:::::::K::G::::::::SA:
HVO_2342        ::G::S::T::::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::::EH:::W:::
Hbo2023         TV::I::S:::::::::::::::::::::::Q::V:::::::::::KP::S::T::L:::

consensus       IIAAALVVVSVAAYLFAEPIVAVFIPGEPA--VIAIGVDYLRINGLTFVFLGAFRVVNGG
#oth            1.221.111.122.11.11..11..1.11111.....111..1212111...2.2..2.1
Hbo3039         :::GV:::I::LV::N:AT::SI::T:QE:AT:::::A::::VV:V:Y::::V:Y::Q:A
HVO_2342        ::VT:::F::A::::::::::::::::::::::::::::::::I:P::L:::::N:::::
Hbo2023         L:S:::A::::VS:Q::::::::::::::N::::::::NF::::A:G:::::I::::S::

consensus       FRGSGSTRTAMAFSLIALWVLRIPPAYALVEWFDMGADGIWYGIAFSNVAAAILAGAWFL
#oth            1.......1..2.1112.1...1.1.11..11121.22.1..11.11..221211121.1
Hbo3039         Y:::::::L::I:GI:G:I:::V:::::::A::::::M:V:::::AA::LIVV:S:VY::
HVO_2342        :::::::::::V::::S:::::::A:FV:::F:S::PT:::::::::::GV:L::F:::T
Hbo2023         :::::::::::::::L::::::::::::::::TGL:L:::::AM:::::::::V::L:::

consensus       RGTWTNNVVDVERAVP----ADD
#oth            ....122...121211111121.
Hbo3039         :::::EG:::R::GAQEVTHGG:
HVO_2342        ::::K:S::::GP:::::::T::
Hbo2023         :::::D:::::S:P:::::::::