Home |  Text search
2 genomes BUD3628 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_A0224

HVO_A0225

HVO_B0377

-

Hmu0688

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score2635 HVO_A0225 Hmu0688 HVO_A0224 HVO_B0377
1566HVO_A0225 2653 1420 774 615
1555Hmu0688 1420 2542 777 713
1508HVO_A0224 774 777 2922 1284
1492HVO_B0377 615 713 1284 2646

378 symbols
consensus       ----------M-IEQRRIERLDRDEWDTAVPASGQEN-FHQPEALEAQAEHADGELHLLG
#oth            1111111111122233122321311.122123.23232..1121.232121322212121
HVO_A0225       ::::::::::-:MS:L:::P:SL:::GA:L::::T:V:::T:AV:A:ID::F:::M::F:
Hmu0688         ::::::::::-:---ME:::::I:::GE:::D::I:L:::::::::VL:::V::D:E:Y:
HVO_A0224       VRRPPVGPQS:T::IVEFDER:::::::Y:SR:S:ASL:::Y:::RL::NYSNSK::::V
HVO_B0377       :::::::::::S::V::ATGD:VHG:::F:EQ:PHG:A:::YD:::I::A::GA::VP:V

consensus       GFKGQEPVGLFPVFRIRKGLGATVFSPPPSMAVPYLGPVMLPASP-KQRKRESRNREFID
#oth            12.111211.1.1132212223112....2231111...2123222.1113.21232.21
HVO_A0225       V:::::::A:::T:VR:NP::RV:V:::::::I::I::::M:N:::::SAY::V::::A:
Hmu0688         :::::QAI::L::VTDS:LV:T::T::::::N::R::::VM:T:::::::I::V:SK:TE
HVO_A0224       :Y:TE:::::::::E:::::VK:A:::::HIG:::::::::D:GNI:S::F:R:RNQ:::
HVO_B0377       :R::E:V:::::::::N::PI::::::::ELR:A:::::L:NMDHM::::::G:HH::::

consensus       ACLEWLGDRIRPSYARIRCNDAYLDPRPFEWADYAVTPQFTYRLDLA-RGADDIQASFSS
#oth            3121222332322231322333.2.2.213.312122121..21..32223113312..1
HVO_A0225       LVV:E::I:SNRTFV:LL:SP::::::::::TGF::K:S:::::::GG:SL:E:::Q:::
Hmu0688         :V::TIDTGGSL:LF:MV::SQ::::::YV::::DL:T:::::::::DAT::ETM:G:::
HVO_A0224       G:T::::EH:G:::THV:VG:Y:T:M:T:L:GGCD:S:KY::NV::T:::EE:LLM:::R
HVO_B0377       D::A:VR:E:::R::H::LDGR:D:L:A:S:N:::I:::Y::HV::S:P:V::VFM::::

consensus       SARRNIRNARELDITIEEEGLDGARAIYDAVASRYEEQDRPFRIPPEFVRDLYAALGDGR
#oth            11.11..31121232122112121231233132..21.2311332121.21.133.1211
HVO_A0225       :L::E::Q::::::::AD:::::::VV::D:V:::D:::E::GM:W:::ES:VEN:::-:
Hmu0688         :L::E::S:::::VSVSV::::::::::K:TRE::A::E:::P:EWSY::::VS::::-:
HVO_A0224       :::::::DG:K:VSG:::GDR:DICS:LTL:KN::::::LS:DV::Q::M:::DS:PK:Q
HVO_B0377       D::S:::::LDDAY::::G:PEAIER:VEQ::::::A:GISY:SS:::::::::T:PE:Q

consensus       ARPYVAR-PDGAFLGGIIALDSDDTAYRWQGGVRADYD-GVSINDLLDWRIIRDIMDD-A
#oth            3.1..3.221.1121.131232312311.1..2.332121222.1.11.2.12.222121
HVO_A0225       C:V::::D:G:EY:S:M:VTF::EVG:F:L::A:GE::::::::S::H:T::E::VE:E:
Hmu0688         :::::V:G:::::::::T::Y:P:A::F::::T:SS:E::::L:S:VH:Q::A::LA:D:
HVO_A0224       V::::F::Y::::VS::VV:QNG::L:::L::::PQF:F:IDV::::::::M::G::::-
HVO_B0377       I::::L::I::E:A:::L:V:YKE:VS:::::::::V:SDLA:::::::::M::A::R:-

consensus       LAGVTRYDLVGANNRRLNRYKSKFNPELVPFYVVESNAIGMRLAAHLYK--------TLR
#oth            111213...1...11.111..1.1121.111.22.231311312121.211111111213
HVO_A0225       ::S::K:::::::TE::CN:::::GG::::Y:::::TGV::N::KRT:Q::::::::L:Y
Hmu0688         ::S::G:::M:::TE::C::::::GAD:::Y:::::DG:::D::KAT:S::::::::::K
HVO_A0224       --:MR::::::::::::::::::Y:::::T::QI:HG:LPV:TI:::::SRLGPGIEM:S
HVO_B0377       --:R:T::::::::::I::::A::::::H:::SL:R::P::KTL::::::::::::::I:

consensus       RGN---------------
#oth            213222222111111111
HVO_A0225       K:SERIATK:::::::::
Hmu0688         :--:::::::::::::::
HVO_A0224       :::GTSLPSRLVSGFLHR
HVO_B0377       E:V:::::::::::::::