2 genomes BUD3821 3 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - - - Hbo1639 - Hut1191 Hut2043 - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	2063	Hut2043	Hut1191	Hbo1639
1288	Hut2043	1972	914	869
1515	Hut1191	914	2057	1132
1483	Hbo1639	869	1132	2192

305 symbols
consensus       ------DADEAEADRAVAATANRFLRDIRVNAERWNIKAIRNPFVFLSSLAQPIIFLVLF
#oth            111111222222222212212.2112.211122..211121..11221112111111..1
Hut2043         ::::::--------MS:TE:::TR:::L:::::::TR::VH::TA::VEI:VATLS::::
Hut1191         ::::::MST::G:::E::R:S:S::G:VWT:FM::::N:::::::VV:::L:::::::::
Hbo1639         MSRFTD:::TS:IGT:QR:SG:::VV::::SLK::L::TS:::::TF:::V:::::F::M

consensus       AAVFGNIAGGALQRAGGDDINYVTYLLPAIAIQAALAAAASSGIGLVDDIETGMFEKTLV
#oth            22...211.11.222222211.1...1..122.22122.21..1...1.1.1.1.1.11.
Hut2043         S::::DVG:L::E:::FG:VA::::::::VLM::TMGS:F:::M:::R:L::::::::I:
Hut1191         TQ:::::::::::TG----:::E::::::::V:IS:VV:S:::::::::::S:V:Q::::
Hbo1639         :E:::S::::T:SQTL::E:::::::T:::V::S::::::V::::::::::::::::I::

consensus       TPMNRGAVFLGKALSELARIVVQLAIILALGVAI---------GANIATGAIGAIGIIGI
#oth            1..112.1.1..211.121.11.221112.111211111111111212..11.121.21.
Hut2043         :::SAT:::A:::AA:::Q:::::SVVVG:A::::::::::::::::E:::::VL::LA:
Hut1191         :::::V::::::T::::I:::::VT:::V:::VL:::::::::::E::::IP::VA::::
Hbo1639         S::::::M::::V:::VV::AI:T:::::::Y:MLFLQSAASVETYLQ:::::::::V::

consensus       AILFGLLFMAFSNIVALITRDREATIAAANLLQFPLLFVSSAFLPLSDDRGWIRTVATFN
#oth            1211112.1.2..1.1.21..2.21121111221....1.1..1.1.22221.211.11.
Hut2043         CL:V::::::V::::G:LA::E:VIN::TM:FM:::::L:P::I:::::---:EL:::::
Hut1191         ::::S:W:L::::T:::::::Q:S::I:::MV:L:::::::::::V:SM:P::Q::::Y:
Hbo1639         :VI::GV:::Y::::::V::::::::MI::::T::::::::::::::VLP:::::F:V::

consensus       PITYGVDAARALMLGQDTLEVLDVTAFGGIWNTVVPSLAILLVLNAILGAIAVRLLARAS
#oth            ......1.2..11.12.112.12.12.1.211.11.1121.1111211.11.11112...
Hut2043         ::::::E:V:::V::E:::T:VS:SW:::VAD::::AVG::::::G:V::::I:::::::
Hut1191         :::::::::::I::NK:VM::::::::::::::L:::::::I::DV::::V::YMIN:::
Hbo1639         ::::::::I::::::::::S::H::V:S:F::::I:::IV::GA::A::G::::::T:::

consensus       SASVQ
#oth            1.1.1
Hut2043         ::::A
Hut1191         :::::
Hbo1639         R:D::