|
Pairwise sequence scores | ||||
---|---|---|---|---|
Consensus score | 2219 | hla0826 | HVO_0604 | HVO_B0096 |
1476 | hla0826 | 2344 | 853 | 905 |
1430 | HVO_0604 | 853 | 2352 | 1074 |
1484 | HVO_B0096 | 905 | 1074 | 2264 |
330 symbols consensus ---MDVLLTGAHGRAGTAVINHLAARDAYDFTYLDREDAPDD------HPHRDYETVVAD #oth 11112..2..22.22.1.1221122211.111111.222.121111111122211.1.2. hla0826 ::::T::::::::TV::::----T:TS:::HVL::::P:::ELGDGSP:::::R::::V: HVO_0604 MVTQQ::V::PF:E::E:IL::::E::E:E::::::TEH:E-::::::-----:::F::: HVO_B0096 :::::::M::VY::C:::::D::HDD:::::::FN:S:R:::::::::::YGG:D:::G: consensus VADYDAIRAAADGQD-----AIVHLAADPDADATFEDIEEPNIRGTYNVLEAARRAGVEK #oth 12112.22212111111111.21.1.121222112111211.12.11.1.1112211112 hla0826 :GADG:VE:LT:AMTEHEVA::::::G::TLS::YASV:RN:V:::R::::::S::::GT HVO_0604 I:::E:::P:F::::::::::VI::::QS::G:A::::I::::M::::::K:MED::::: HVO_B0096 :S::::LDG::A:::::::::M::M::Y:YT:G:W:::F::::I:M::A::V::ENEI:S consensus LVFASSNHVMGGYEDEHAPALYEPD-----DGLRIDHEDPIRPDSDYGASKAAGEAICRL #oth 2111.111.1.2..2121.21.11111111211222.12121..12.....12..221.2 hla0826 V::::::::V:M::T:::::::A:::::::E:PTV::RS:::::::::::::::::W::: HVO_0604 :IY:::QR:::L::EDL::D:::E:YPSEY:P::FT::TLPK::GY:::::MF::H:::T HVO_B0096 F::L:T::::::::::FS:EI:::G:::::H::V:G::::V::::F::::::Y::DMG:Y consensus YAERDGAPKQCYALRICSVRGPAYDHPYGDAERAVAAGD-----------------CERG #oth 11112121212.11.12...2121...1....11.22.1111111111111111112... hla0826 ::::E:I--D::::::G::::::F:::F:::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0604 H:R:::::S:V:SI::S:::TEQ::::::::::G:DR::EHKVEDGEVWDQSQTGSW::: HVO_B0096 :V:NYEY:::F::::V::::M:E:::::::::A::EN:E:::::::::::::::::F::: consensus SDEYEEAVARMKATWQSRRDFAHLIDCCLDD------------DNV---AFDIFYGVSDN #oth 111..12.2.1121.2.1..1.11211..2.111111111111.2.1112122.11..1. hla0826 D:D::T:::::RC::L::::C:A:V:A::::GTDGDNTCGPNP:T:AGG::EV::::::: HVO_0604 ::::::M:K:L::::T:Q::::::LE:::E::::::::::::::S::::TY:T::A::G: HVO_B0096 :A::::T:G:::SM:::::::::E:::::Q:::::::::::::::::::E:G::S::::: consensus QARWFDRDHARARIGYEPADDGNEWDSPPE #oth 221.1.22..12221.1.1.1.21111..1 hla0826 PNG::::T:::E:V::::::S::AMTE::R HVO_0604 K:::::T:::K:VLD:::::::S::::::: HVO_B0096 :R::Y:LE:::SQ:::H:Q:::E:::::::