|
Pairwise sequence scores | |||||
---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2976 | HVO_2165 | HQ3476A | HVO_2164 | HQ3477A |
1736 | HVO_2165 | 3113 | 1567 | 631 | 464 |
1621 | HQ3476A | 1567 | 2919 | 497 | 401 |
1582 | HVO_2164 | 631 | 497 | 2951 | 1385 |
1405 | HQ3477A | 464 | 401 | 1385 | 3107 |
446 symbols consensus MT---------D----P----AARRSRLRAAAGFAIARLL-RLRTHARRRTTLSVLGVAI #oth 11211111122122221222233132.2223312.23121211112323122.122.121 HVO_2165 ::EDADPNRGS:AATT:ESSRFP:L::V::S::I:VSQ:-:---S:::G::V:T:::ITL HQ3476A --:::::::::-::::-::::-MIG::::::I:::::Q:-:---::D:T:::::I::::: HVO_2164 --:::::::::-::::-::::M:::H::FGVV:L:GR:V:G::::TSSKQVL:::I:::L HQ3477A ::D::::::KT:TDFD:DIHS:S:SK:ILRLST:::T:I:N::::PGA::I::TLV::M: consensus AVLAATLLSGVALGLIQTGQNAFDSAGRDYWITGEPVRFSPTAVGGGETRIGDTHALTAR #oth .1211.1121212.11122132212211.2.111122322222.12222312.2.31231 HVO_2165 ::::::::A:TGI:V:::::QQ::A::::V::::G:::::::G:::F:NS:V:A:G:D:E HQ3476A ::::::::TA:GG:V:::::EK:::::::L::::G::E:A::T:::V::P:R:S:T:ANE HVO_2164 ::TLM:TV::I::::--GAE::IQ:E:V:::VVP:ASTA:SV::SV:SPQL:::::I:D: HQ3477A :IALM:TV:::::::--AT:S:VQGDNV::::VP:TGDLNTI::ST:Q::L::::R::S: consensus LERRERVKYATPVLFQTVYVAPNDS-T-EYELLVGVGPP-GSAGSVQGTSGEGLTRGDPH #oth 12232112211.222.2.22322312121.212212221122322123121221212121 HVO_2165 ::A::D::VV::MS::::::RS:E::-:D::T:::::A::ARG::::I:N:S:FS:P:V: HQ3476A V:NIND::T:A:L::::::IS::G::-::::TVGAL:VR:::::-::V:::R:FN:S-R: HVO_2164 :A:D:::D:::::QT:L:TL::E:GS:D::V:AA:II:::EEPT::V:V:T:A::P:::: HQ3477A :T:ND:IQ::::::S:V:P:QTQT:T:R::I:::::V::N::NPTIASVPT:E::P:::Y consensus FAGGRYTGPMTGELVLDQAAAELLNVSAGDEVY--VGGT---A-ANEFTIVDVSPTDL-S #oth 1121312112.1.2222111.22211.3.13221111.122212321.112112223121 HVO_2165 Y:::N::::::H:V:I::RT::MM:::V::SL:::::::TGI:RE::::V:G::::F-:: HQ3476A ::::E:N::::H:IL:::RT:S:V:::I::T::::::::LAL:N:::::::GI:::G-:: HVO_2164 Y:N:S:D::R::::::ND::::::G:::::::TAS:::S:::-:RA:::VA::HEGS:S: HQ3477A :DAN:S:DSW::::IAT::::TV::A:T:EPIM::PA:::::-:DQT:R:T::ADS::RT consensus GFGGTPVALVHLSELQEVTGSTGGDTATQILVST-D-ADSAAVRADIQADYPRTDVRTNQ #oth 21122.21211.....22..2122.2.212121221211233.2321123..31211.21 HVO_2165 R:L:::SVV::::::::::::::A::::LMTLTVA:G::PE::A::::::::DY:::::: HQ3476A Q:L:::TVSLP:::::::::K::S:P::L:TAT:T:D:SVGT:ERRL:QQ::TY:I:::: HVO_2164 :V:PV:::::::::::TM::::E::L:D:L:::::-:-:::G::S::E:L::::S:V:QT HQ3477A :V:AA:::::::::::AI::AAD::::S:::::S:-:-S:QR::TT:EGI::Q:N:V:RT consensus EQARATASTQALPIAMGASLLVLALLVGVALTANALGLEVNHDRRALAALKALGTSTSSL #oth 12133232211123.21222321.122.2112213121223222232.2.1.2.122212 HVO_2165 ::LTEILRD::VVM:A:G::VF::::A:L::SV:V:LSH:Y:QK:E::::::::::S:T: HQ3476A ::L:::IER::VF::G::::TL::VVI:F:::L:::VSMFIQHIE:Y::::::::::TT: HVO_2164 GL:VRG:::SS::L::A:VS::V:V::::LFV:TMM:::::A:::N::V:S:M:YR:::Q HQ3477A GF:GQ:V::SS::V:::IAAF:V::I:::LF::TTM:::IT:::QFI:I:S:V:YTER:V consensus ALAVVAQTVVVGTIGGAVGVAAGIGGAYGLNAIAARLLGFQAVAILDPRLVLYGG-ATAA #oth 32322212221223..31.23122121221.3233322123313322.1222212112.3 HVO_2165 S:TL:::AL:L::F::LL:::LSFPA:V:::RL:QL:V::GD:VV:-::A::A::F:I:F HQ3476A :T:AIT::FF::VL:::::LG:AMPI:I:::EVIT:II::EN:IM:S::IL:L::::::L HVO_2164 M:L:::E::::A:V::V:::V:::::I:LT:::TRE:::V:-::LF::V::G:SV::V:: HQ3477A GFV:AL:V:T:CF:::T::ALL::::I:AT:T:L:QT:SLP:PG:I::::IP::I:M::V consensus LIGLLSSIAPSWLAARIRPLEALR-- #oth 12111123122223311321221321 HVO_2165 VMS:V::L:V:RQI:G::::DH:-:: HQ3476A :VS:::GV:A:LYVL::D::TM:K:: HVO_2164 ::::V:::Y:A::TW:TPT:::MSHD HQ3477A :::I:ALPY:V:::R:TTIT::::L: