Home |  Text search
2 genomes BUD4302 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_2164

HVO_2165

- - - - -

HQ3476A

HQ3477A

Pairwise sequence scores
Consensus score2976 HVO_2165 HQ3476A HVO_2164 HQ3477A
1736HVO_2165 3113 1567 631 464
1621HQ3476A 1567 2919 497 401
1582HVO_2164 631 497 2951 1385
1405HQ3477A 464 401 1385 3107

446 symbols
consensus       MT---------D----P----AARRSRLRAAAGFAIARLL-RLRTHARRRTTLSVLGVAI
#oth            11211111122122221222233132.2223312.23121211112323122.122.121
HVO_2165        ::EDADPNRGS:AATT:ESSRFP:L::V::S::I:VSQ:-:---S:::G::V:T:::ITL
HQ3476A         --:::::::::-::::-::::-MIG::::::I:::::Q:-:---::D:T:::::I:::::
HVO_2164        --:::::::::-::::-::::M:::H::FGVV:L:GR:V:G::::TSSKQVL:::I:::L
HQ3477A         ::D::::::KT:TDFD:DIHS:S:SK:ILRLST:::T:I:N::::PGA::I::TLV::M:

consensus       AVLAATLLSGVALGLIQTGQNAFDSAGRDYWITGEPVRFSPTAVGGGETRIGDTHALTAR
#oth            .1211.1121212.11122132212211.2.111122322222.12222312.2.31231
HVO_2165        ::::::::A:TGI:V:::::QQ::A::::V::::G:::::::G:::F:NS:V:A:G:D:E
HQ3476A         ::::::::TA:GG:V:::::EK:::::::L::::G::E:A::T:::V::P:R:S:T:ANE
HVO_2164        ::TLM:TV::I::::--GAE::IQ:E:V:::VVP:ASTA:SV::SV:SPQL:::::I:D:
HQ3477A         :IALM:TV:::::::--AT:S:VQGDNV::::VP:TGDLNTI::ST:Q::L::::R::S:

consensus       LERRERVKYATPVLFQTVYVAPNDS-T-EYELLVGVGPP-GSAGSVQGTSGEGLTRGDPH
#oth            12232112211.222.2.22322312121.212212221122322123121221212121
HVO_2165        ::A::D::VV::MS::::::RS:E::-:D::T:::::A::ARG::::I:N:S:FS:P:V:
HQ3476A         V:NIND::T:A:L::::::IS::G::-::::TVGAL:VR:::::-::V:::R:FN:S-R:
HVO_2164        :A:D:::D:::::QT:L:TL::E:GS:D::V:AA:II:::EEPT::V:V:T:A::P::::
HQ3477A         :T:ND:IQ::::::S:V:P:QTQT:T:R::I:::::V::N::NPTIASVPT:E::P:::Y

consensus       FAGGRYTGPMTGELVLDQAAAELLNVSAGDEVY--VGGT---A-ANEFTIVDVSPTDL-S
#oth            1121312112.1.2222111.22211.3.13221111.122212321.112112223121
HVO_2165        Y:::N::::::H:V:I::RT::MM:::V::SL:::::::TGI:RE::::V:G::::F-::
HQ3476A         ::::E:N::::H:IL:::RT:S:V:::I::T::::::::LAL:N:::::::GI:::G-::
HVO_2164        Y:N:S:D::R::::::ND::::::G:::::::TAS:::S:::-:RA:::VA::HEGS:S:
HQ3477A         :DAN:S:DSW::::IAT::::TV::A:T:EPIM::PA:::::-:DQT:R:T::ADS::RT

consensus       GFGGTPVALVHLSELQEVTGSTGGDTATQILVST-D-ADSAAVRADIQADYPRTDVRTNQ
#oth            21122.21211.....22..2122.2.212121221211233.2321123..31211.21
HVO_2165        R:L:::SVV::::::::::::::A::::LMTLTVA:G::PE::A::::::::DY::::::
HQ3476A         Q:L:::TVSLP:::::::::K::S:P::L:TAT:T:D:SVGT:ERRL:QQ::TY:I::::
HVO_2164        :V:PV:::::::::::TM::::E::L:D:L:::::-:-:::G::S::E:L::::S:V:QT
HQ3477A         :V:AA:::::::::::AI::AAD::::S:::::S:-:-S:QR::TT:EGI::Q:N:V:RT

consensus       EQARATASTQALPIAMGASLLVLALLVGVALTANALGLEVNHDRRALAALKALGTSTSSL
#oth            12133232211123.21222321.122.2112213121223222232.2.1.2.122212
HVO_2165        ::LTEILRD::VVM:A:G::VF::::A:L::SV:V:LSH:Y:QK:E::::::::::S:T:
HQ3476A         ::L:::IER::VF::G::::TL::VVI:F:::L:::VSMFIQHIE:Y::::::::::TT:
HVO_2164        GL:VRG:::SS::L::A:VS::V:V::::LFV:TMM:::::A:::N::V:S:M:YR:::Q
HQ3477A         GF:GQ:V::SS::V:::IAAF:V::I:::LF::TTM:::IT:::QFI:I:S:V:YTER:V

consensus       ALAVVAQTVVVGTIGGAVGVAAGIGGAYGLNAIAARLLGFQAVAILDPRLVLYGG-ATAA
#oth            32322212221223..31.23122121221.3233322123313322.1222212112.3
HVO_2165        S:TL:::AL:L::F::LL:::LSFPA:V:::RL:QL:V::GD:VV:-::A::A::F:I:F
HQ3476A         :T:AIT::FF::VL:::::LG:AMPI:I:::EVIT:II::EN:IM:S::IL:L::::::L
HVO_2164        M:L:::E::::A:V::V:::V:::::I:LT:::TRE:::V:-::LF::V::G:SV::V::
HQ3477A         GFV:AL:V:T:CF:::T::ALL::::I:AT:T:L:QT:SLP:PG:I::::IP::I:M::V

consensus       LIGLLSSIAPSWLAARIRPLEALR--
#oth            12111123122223311321221321
HVO_2165        VMS:V::L:V:RQI:G::::DH:-::
HQ3476A         :VS:::GV:A:LYVL::D::TM:K::
HVO_2164        ::::V:::Y:A::TW:TPT:::MSHD
HQ3477A         :::I:ALPY:V:::R:TTIT::::L: